Protein–RNA interactions for Protein: P36145

TFA2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, yeastyeast

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA2P36145 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.64■□□□□ 0.89
TFA2P36145 NSR1YGR159C 1245 nt20.57■□□□□ 0.88
TFA2P36145 NOP1YDL014W 984 nt20.14■□□□□ 0.81
TFA2P36145 YKL036CYKL036C 393 nt18.59■□□□□ 0.57
TFA2P36145 MDJ1YFL016C 1536 nt18.14■□□□□ 0.49
TFA2P36145 Q0297Q0297 156 nt17.65■□□□□ 0.42
TFA2P36145 SRX1YKL086W 384 nt17.59■□□□□ 0.41
TFA2P36145 YJL027CYJL027C 417 nt17.33■□□□□ 0.36
TFA2P36145 SCS3YGL126W 1143 nt16.9■□□□□ 0.3
TFA2P36145 YCR051WYCR051W 669 nt16.64■□□□□ 0.25
TFA2P36145 YOL085CYOL085C 342 nt16.1■□□□□ 0.17
TFA2P36145 DBP2YNL112W 1641 nt16.09■□□□□ 0.17
TFA2P36145 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.88■□□□□ 0.13
TFA2P36145 RPP1BYDL130W 321 nt15.82■□□□□ 0.12
TFA2P36145 PKP1YIL042C 1185 nt15.79■□□□□ 0.12
TFA2P36145 CCC1YLR220W 969 nt15.67■□□□□ 0.1
TFA2P36145 YBR190WYBR190W 312 nt15.53■□□□□ 0.08
TFA2P36145 RVS167YDR388W 1449 nt15.17■□□□□ 0.02
TFA2P36145 RTC3YHR087W 336 nt15.14■□□□□ 0.01
TFA2P36145 ATS1YAL020C 1002 nt15.14■□□□□ 0.01
TFA2P36145 SCJ1YMR214W 1134 nt15.09■□□□□ 0.01
TFA2P36145 PET122YER153C 765 nt15.07■□□□□ 0
TFA2P36145 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.02■□□□□ -0
TFA2P36145 SCR1SCR1 522 nt14.95□□□□□ -0.02
TFA2P36145 RRN5YLR141W 1092 nt14.66□□□□□ -0.06
TFA2P36145 SHR5YOL110W 714 nt14.64□□□□□ -0.07
TFA2P36145 YDJ1YNL064C 1230 nt14.58□□□□□ -0.08
TFA2P36145 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.37□□□□□ -0.11
TFA2P36145 RSB1YOR049C 1065 nt14.34□□□□□ -0.11
TFA2P36145 URN1YPR152C 1398 nt14.19□□□□□ -0.14
TFA2P36145 GAR1YHR089C 618 nt14.18□□□□□ -0.14
TFA2P36145 DEP1YAL013W 1218 nt14.15□□□□□ -0.14
TFA2P36145 SSA3YBL075C 1950 nt14.07□□□□□ -0.16
TFA2P36145 PUT4YOR348C 1884 nt14.05□□□□□ -0.16
TFA2P36145 PST2YDR032C 597 nt14.04□□□□□ -0.16
TFA2P36145 RPN10YHR200W 807 nt14.02□□□□□ -0.17
TFA2P36145 OPI9YLR338W 858 nt14.01□□□□□ -0.17
TFA2P36145 YNL208WYNL208W 600 nt14□□□□□ -0.17
TFA2P36145 SAH1YER043C 1350 nt13.87□□□□□ -0.19
TFA2P36145 ARE1YCR048W 1833 nt13.8□□□□□ -0.2
TFA2P36145 TIR1YER011W 765 nt13.73□□□□□ -0.21
TFA2P36145 PUN1YLR414C 792 nt13.62□□□□□ -0.23
TFA2P36145 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.6□□□□□ -0.23
TFA2P36145 POA1YBR022W 534 nt13.6□□□□□ -0.23
TFA2P36145 YJR018WYJR018W 363 nt13.56□□□□□ -0.24
TFA2P36145 SSA1YAL005C 1929 nt13.54□□□□□ -0.24
TFA2P36145 YKL097CYKL097C 411 nt13.47□□□□□ -0.25
TFA2P36145 SHU1YHL006C 453 nt13.43□□□□□ -0.26
TFA2P36145 PTC2YER089C 1395 nt13.41□□□□□ -0.26
TFA2P36145 Q0182Q0182 405 nt13.34□□□□□ -0.27
TFA2P36145 YJR120WYJR120W 351 nt13.34□□□□□ -0.27
TFA2P36145 RPP2BYDR382W 333 nt13.31□□□□□ -0.28
TFA2P36145 BSC6YOL137W 1494 nt13.3□□□□□ -0.28
TFA2P36145 BUD23YCR047C 828 nt13.28□□□□□ -0.28
TFA2P36145 SRB2YHR041C 633 nt13.28□□□□□ -0.28
TFA2P36145 MOT3YMR070W 1473 nt13.26□□□□□ -0.29
TFA2P36145 NAB2YGL122C 1578 nt13.25□□□□□ -0.29
TFA2P36145 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.17□□□□□ -0.3
TFA2P36145 INM2YDR287W 879 nt13.11□□□□□ -0.31
TFA2P36145 WWM1YFL010C 636 nt13.1□□□□□ -0.31
TFA2P36145 YGR021WYGR021W 873 nt13.09□□□□□ -0.31
TFA2P36145 DAL1YIR027C 1383 nt13.08□□□□□ -0.31
TFA2P36145 BDH2YAL061W 1254 nt13.05□□□□□ -0.32
TFA2P36145 FIS1YIL065C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
TFA2P36145 HOM6YJR139C 1080 nt13.02□□□□□ -0.33
TFA2P36145 FPR4YLR449W 1179 nt12.99□□□□□ -0.33
TFA2P36145 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.94□□□□□ -0.34
TFA2P36145 PHO4YFR034C 939 nt12.94□□□□□ -0.34
TFA2P36145 YBL100CYBL100C 315 nt12.94□□□□□ -0.34
TFA2P36145 LSM3YLR438C-A 270 nt12.92□□□□□ -0.34
TFA2P36145 YOR139CYOR139C 393 nt12.92□□□□□ -0.34
TFA2P36145 SPT5YML010W 3192 nt12.9□□□□□ -0.34
TFA2P36145 MNP1YGL068W 585 nt12.9□□□□□ -0.34
TFA2P36145 RKM5YLR137W 1104 nt12.83□□□□□ -0.36
TFA2P36145 NPL3YDR432W 1245 nt12.81□□□□□ -0.36
TFA2P36145 TRM9YML014W 840 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA2P36145 FUN26YAL022C 1554 nt12.8□□□□□ -0.36
TFA2P36145 YOL037CYOL037C 354 nt12.77□□□□□ -0.37
TFA2P36145 SSA4YER103W 1929 nt12.71□□□□□ -0.37
TFA2P36145 YPS1YLR120C 1710 nt12.69□□□□□ -0.38
TFA2P36145 CCT6YDR188W 1641 nt12.67□□□□□ -0.38
TFA2P36145 YDR095CYDR095C 411 nt12.62□□□□□ -0.39
TFA2P36145 ALF1YNL148C 765 nt12.61□□□□□ -0.39
TFA2P36145 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.57□□□□□ -0.4
TFA2P36145 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.57□□□□□ -0.4
TFA2P36145 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.52□□□□□ -0.41
TFA2P36145 MEP2YNL142W 1500 nt12.5□□□□□ -0.41
TFA2P36145 YLR281CYLR281C 468 nt12.47□□□□□ -0.41
TFA2P36145 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.44□□□□□ -0.42
TFA2P36145 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.44□□□□□ -0.42
TFA2P36145 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.44□□□□□ -0.42
TFA2P36145 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.44□□□□□ -0.42
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