Protein–RNA interactions for Protein: Q03784

TRS23, Trafficking protein particle complex subunit 23, yeastyeast

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRS23Q03784 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.18■□□□□ 0.66
TRS23Q03784 NOP1YDL014W 984 nt18.77■□□□□ 0.6
TRS23Q03784 NSR1YGR159C 1245 nt18.75■□□□□ 0.59
TRS23Q03784 YKL036CYKL036C 393 nt17.67■□□□□ 0.42
TRS23Q03784 YJL027CYJL027C 417 nt16.57■□□□□ 0.24
TRS23Q03784 Q0297Q0297 156 nt16.56■□□□□ 0.24
TRS23Q03784 SRX1YKL086W 384 nt16.42■□□□□ 0.22
TRS23Q03784 MDJ1YFL016C 1536 nt16.34■□□□□ 0.21
TRS23Q03784 SCS3YGL126W 1143 nt16.28■□□□□ 0.2
TRS23Q03784 YCR051WYCR051W 669 nt15.62■□□□□ 0.09
TRS23Q03784 YOL085CYOL085C 342 nt15.31■□□□□ 0.04
TRS23Q03784 PKP1YIL042C 1185 nt15.04■□□□□ -0
TRS23Q03784 RPP1BYDL130W 321 nt14.87□□□□□ -0.03
TRS23Q03784 SCJ1YMR214W 1134 nt14.85□□□□□ -0.03
TRS23Q03784 ATS1YAL020C 1002 nt14.66□□□□□ -0.06
TRS23Q03784 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.64□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 DBP2YNL112W 1641 nt14.6□□□□□ -0.07
TRS23Q03784 CCC1YLR220W 969 nt14.51□□□□□ -0.09
TRS23Q03784 PET122YER153C 765 nt14.17□□□□□ -0.14
TRS23Q03784 SCR1SCR1 522 nt14.1□□□□□ -0.15
TRS23Q03784 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.98□□□□□ -0.17
TRS23Q03784 YBR190WYBR190W 312 nt13.81□□□□□ -0.2
TRS23Q03784 RRN5YLR141W 1092 nt13.8□□□□□ -0.2
TRS23Q03784 RVS167YDR388W 1449 nt13.78□□□□□ -0.2
TRS23Q03784 RSB1YOR049C 1065 nt13.62□□□□□ -0.23
TRS23Q03784 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.54□□□□□ -0.24
TRS23Q03784 RTC3YHR087W 336 nt13.53□□□□□ -0.24
TRS23Q03784 PST2YDR032C 597 nt13.52□□□□□ -0.25
TRS23Q03784 YDJ1YNL064C 1230 nt13.5□□□□□ -0.25
TRS23Q03784 SHR5YOL110W 714 nt13.4□□□□□ -0.26
TRS23Q03784 GAR1YHR089C 618 nt13.16□□□□□ -0.3
TRS23Q03784 YKL097CYKL097C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
TRS23Q03784 DEP1YAL013W 1218 nt12.92□□□□□ -0.34
TRS23Q03784 SHU1YHL006C 453 nt12.89□□□□□ -0.35
TRS23Q03784 URN1YPR152C 1398 nt12.81□□□□□ -0.36
TRS23Q03784 YNL208WYNL208W 600 nt12.73□□□□□ -0.37
TRS23Q03784 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
TRS23Q03784 RPN10YHR200W 807 nt12.67□□□□□ -0.38
TRS23Q03784 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.6□□□□□ -0.39
TRS23Q03784 YOR139CYOR139C 393 nt12.59□□□□□ -0.39
TRS23Q03784 OPI9YLR338W 858 nt12.54□□□□□ -0.4
TRS23Q03784 SSA1YAL005C 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
TRS23Q03784 SRB2YHR041C 633 nt12.38□□□□□ -0.43
TRS23Q03784 SAH1YER043C 1350 nt12.38□□□□□ -0.43
TRS23Q03784 NPL3YDR432W 1245 nt12.37□□□□□ -0.43
TRS23Q03784 PUT4YOR348C 1884 nt12.29□□□□□ -0.44
TRS23Q03784 MNP1YGL068W 585 nt12.23□□□□□ -0.45
TRS23Q03784 YJR018WYJR018W 363 nt12.23□□□□□ -0.45
TRS23Q03784 YGR021WYGR021W 873 nt12.22□□□□□ -0.45
TRS23Q03784 HOM6YJR139C 1080 nt12.22□□□□□ -0.45
TRS23Q03784 WWM1YFL010C 636 nt12.21□□□□□ -0.45
TRS23Q03784 ARE1YCR048W 1833 nt12.18□□□□□ -0.46
TRS23Q03784 PUN1YLR414C 792 nt12.16□□□□□ -0.46
TRS23Q03784 YJR120WYJR120W 351 nt12.15□□□□□ -0.46
TRS23Q03784 YOL037CYOL037C 354 nt12.14□□□□□ -0.47
TRS23Q03784 RPP2BYDR382W 333 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.07□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 RKM5YLR137W 1104 nt12.04□□□□□ -0.48
TRS23Q03784 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.01□□□□□ -0.49
TRS23Q03784 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.99□□□□□ -0.49
TRS23Q03784 PTC2YER089C 1395 nt11.97□□□□□ -0.49
TRS23Q03784 SSA3YBL075C 1950 nt11.96□□□□□ -0.5
TRS23Q03784 POA1YBR022W 534 nt11.93□□□□□ -0.5
TRS23Q03784 BDH2YAL061W 1254 nt11.9□□□□□ -0.5
TRS23Q03784 PUS2YGL063W 1113 nt11.85□□□□□ -0.51
TRS23Q03784 YLR281CYLR281C 468 nt11.85□□□□□ -0.51
TRS23Q03784 LSM3YLR438C-A 270 nt11.81□□□□□ -0.52
TRS23Q03784 BUD23YCR047C 828 nt11.76□□□□□ -0.53
TRS23Q03784 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
TRS23Q03784 WHI5YOR083W 888 nt11.75□□□□□ -0.53
TRS23Q03784 INM2YDR287W 879 nt11.74□□□□□ -0.53
TRS23Q03784 MOT3YMR070W 1473 nt11.74□□□□□ -0.53
TRS23Q03784 YBL100CYBL100C 315 nt11.7□□□□□ -0.54
TRS23Q03784 DAL1YIR027C 1383 nt11.67□□□□□ -0.54
TRS23Q03784 BSC6YOL137W 1494 nt11.67□□□□□ -0.54
TRS23Q03784 FPR4YLR449W 1179 nt11.66□□□□□ -0.54
TRS23Q03784 FIS1YIL065C 468 nt11.64□□□□□ -0.55
TRS23Q03784 TRM9YML014W 840 nt11.61□□□□□ -0.55
TRS23Q03784 YPR011CYPR011C 981 nt11.58□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 FUN26YAL022C 1554 nt11.58□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 PHO4YFR034C 939 nt11.56□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 FMP45YDL222C 930 nt11.55□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 Q0182Q0182 405 nt11.55□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 DSK2YMR276W 1122 nt11.54□□□□□ -0.56
TRS23Q03784 YLR236CYLR236C 324 nt11.52□□□□□ -0.57
TRS23Q03784 CCT6YDR188W 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
TRS23Q03784 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.48□□□□□ -0.57
TRS23Q03784 IMP2'YIL154C 1041 nt11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms