RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)L

tK(UUU)L, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)L, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)LtK(UUU)L CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CYM1P32898 989 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L LRG1P35688 1017 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ASK1P35734 292 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CAB3P36076 571 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YBR071WP38243 211 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L BMT2P38278 337 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L IFA38P38286 347 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YHL008CP38750 627 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GGC1P38988 300 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RGA1P39083 1007 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L FRT2P39734 528 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GID8P40208 455 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YRB1P41920 201 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L FAR3P46671 204 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L URB2P47108 1174 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L TRM9P49957 279 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SLM2P53955 656 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L MRS2Q01926 470 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ECM9Q02202 377 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L USA1Q03714 838 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L TAF12Q03761 539 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YMR155WQ03795 547 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CSN9Q03981 162 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ROY1Q04847 553 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PNP1Q05788 311 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GIC2Q06648 383 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CDA1Q06702 301 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L VAM6Q07468 1049 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PFA4Q12006 378 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L NMD4Q12129 218 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L HAL9Q12180 1030 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YPR011CQ12251 326 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L Q0010Q9ZZX9 128 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PHO5P00635 467 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PRT1P06103 763 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L STE7P06784 515 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SPT3P06844 337 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SEC15P22224 910 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L MGR1P25573 417 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L LDB16P25587 256 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L KAP122P32767 1081 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tK(UUU)LtK(UUU)L SDH3P33421 198 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L KKQ8P36004 724 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L APT2P36973 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RRN10P38204 145 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L FTH1P38310 465 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L MET30P39014 640 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PRP39P39682 629 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YIL001WP40560 513 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L AXL1P40851 1208 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SPG5P42933 373 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ELP2P42935 788 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SDT1P53078 280 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L KXD1P53158 218 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L SGF73P53165 657 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GTR2P53290 341 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RMI1Q02685 241 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GOT1Q03554 138 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L HDA3Q06623 655 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RAD34Q06665 692 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YLR053CQ12026 108 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L REX3Q12090 404 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GET4Q12125 312 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YLL054CQ12244 843 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L ATG34Q12292 412 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L NTO1Q12311 748 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GLE1Q12315 538 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L GLO4Q12320 285 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YVC1Q12324 675 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L HSP42Q12329 375 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L PST1Q12355 444 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L YLR111WQ12528 110 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)LtK(UUU)L RPL17AP05740 184 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L CBS2P14905 389 aa3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)LtK(UUU)L PHO87P25360 923 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms