Protein–RNA interactions for Protein: Q03981

CSN9, COP9 signalosome complex subunit 9, yeastyeast

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSN9Q03981 NSR1YGR159C 1245 nt20.28■□□□□ 0.84
CSN9Q03981 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.19■□□□□ 0.82
CSN9Q03981 NOP1YDL014W 984 nt19.52■□□□□ 0.72
CSN9Q03981 MDJ1YFL016C 1536 nt18.21■□□□□ 0.51
CSN9Q03981 YKL036CYKL036C 393 nt17.85■□□□□ 0.45
CSN9Q03981 SRX1YKL086W 384 nt17.1■□□□□ 0.33
CSN9Q03981 Q0297Q0297 156 nt17.08■□□□□ 0.32
CSN9Q03981 YJL027CYJL027C 417 nt16.76■□□□□ 0.27
CSN9Q03981 YCR051WYCR051W 669 nt16.17■□□□□ 0.18
CSN9Q03981 SCS3YGL126W 1143 nt16.15■□□□□ 0.18
CSN9Q03981 DBP2YNL112W 1641 nt16.08■□□□□ 0.17
CSN9Q03981 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.61■□□□□ 0.09
CSN9Q03981 YBR190WYBR190W 312 nt15.57■□□□□ 0.08
CSN9Q03981 YOL085CYOL085C 342 nt15.5■□□□□ 0.07
CSN9Q03981 CCC1YLR220W 969 nt15.4■□□□□ 0.06
CSN9Q03981 RPP1BYDL130W 321 nt15.31■□□□□ 0.04
CSN9Q03981 PKP1YIL042C 1185 nt15.27■□□□□ 0.04
CSN9Q03981 RTC3YHR087W 336 nt15.17■□□□□ 0.02
CSN9Q03981 RVS167YDR388W 1449 nt14.97□□□□□ -0.01
CSN9Q03981 SCJ1YMR214W 1134 nt14.93□□□□□ -0.02
CSN9Q03981 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.69□□□□□ -0.06
CSN9Q03981 PET122YER153C 765 nt14.66□□□□□ -0.06
CSN9Q03981 SHR5YOL110W 714 nt14.44□□□□□ -0.1
CSN9Q03981 ATS1YAL020C 1002 nt14.4□□□□□ -0.1
CSN9Q03981 SCR1SCR1 522 nt14.4□□□□□ -0.1
CSN9Q03981 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
CSN9Q03981 RRN5YLR141W 1092 nt14.22□□□□□ -0.13
CSN9Q03981 YDJ1YNL064C 1230 nt14.21□□□□□ -0.13
CSN9Q03981 URN1YPR152C 1398 nt14.16□□□□□ -0.14
CSN9Q03981 DEP1YAL013W 1218 nt14.09□□□□□ -0.15
CSN9Q03981 ARE1YCR048W 1833 nt14.03□□□□□ -0.16
CSN9Q03981 OPI9YLR338W 858 nt14.02□□□□□ -0.17
CSN9Q03981 SAH1YER043C 1350 nt13.97□□□□□ -0.17
CSN9Q03981 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.94□□□□□ -0.18
CSN9Q03981 GAR1YHR089C 618 nt13.91□□□□□ -0.18
CSN9Q03981 SSA3YBL075C 1950 nt13.89□□□□□ -0.19
CSN9Q03981 RPN10YHR200W 807 nt13.85□□□□□ -0.19
CSN9Q03981 YNL208WYNL208W 600 nt13.85□□□□□ -0.19
CSN9Q03981 POA1YBR022W 534 nt13.85□□□□□ -0.19
CSN9Q03981 RSB1YOR049C 1065 nt13.83□□□□□ -0.2
CSN9Q03981 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.79□□□□□ -0.2
CSN9Q03981 BSC6YOL137W 1494 nt13.59□□□□□ -0.23
CSN9Q03981 PUN1YLR414C 792 nt13.58□□□□□ -0.24
CSN9Q03981 YJR018WYJR018W 363 nt13.49□□□□□ -0.25
CSN9Q03981 PTC2YER089C 1395 nt13.47□□□□□ -0.25
CSN9Q03981 TIR1YER011W 765 nt13.46□□□□□ -0.25
CSN9Q03981 BUD23YCR047C 828 nt13.43□□□□□ -0.26
CSN9Q03981 PST2YDR032C 597 nt13.39□□□□□ -0.27
CSN9Q03981 SSA1YAL005C 1929 nt13.38□□□□□ -0.27
CSN9Q03981 NAB2YGL122C 1578 nt13.32□□□□□ -0.28
CSN9Q03981 YJR120WYJR120W 351 nt13.31□□□□□ -0.28
CSN9Q03981 SPT5YML010W 3192 nt13.23□□□□□ -0.29
CSN9Q03981 SRB2YHR041C 633 nt13.16□□□□□ -0.3
CSN9Q03981 FIS1YIL065C 468 nt13.14□□□□□ -0.31
CSN9Q03981 RPP2BYDR382W 333 nt13.12□□□□□ -0.31
CSN9Q03981 DAL1YIR027C 1383 nt13.1□□□□□ -0.31
CSN9Q03981 INM2YDR287W 879 nt13.03□□□□□ -0.32
CSN9Q03981 FPR4YLR449W 1179 nt13.02□□□□□ -0.33
CSN9Q03981 PHO4YFR034C 939 nt12.98□□□□□ -0.33
CSN9Q03981 SHU1YHL006C 453 nt12.89□□□□□ -0.35
CSN9Q03981 BDH2YAL061W 1254 nt12.87□□□□□ -0.35
CSN9Q03981 YBL100CYBL100C 315 nt12.87□□□□□ -0.35
CSN9Q03981 WWM1YFL010C 636 nt12.84□□□□□ -0.35
CSN9Q03981 YPS1YLR120C 1710 nt12.82□□□□□ -0.36
CSN9Q03981 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
CSN9Q03981 SSA4YER103W 1929 nt12.75□□□□□ -0.37
CSN9Q03981 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.74□□□□□ -0.37
CSN9Q03981 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
CSN9Q03981 YDR095CYDR095C 411 nt12.71□□□□□ -0.37
CSN9Q03981 YKL097CYKL097C 411 nt12.7□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 YGR021WYGR021W 873 nt12.67□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 HOM6YJR139C 1080 nt12.67□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 LSM3YLR438C-A 270 nt12.67□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.65□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 TRM9YML014W 840 nt12.65□□□□□ -0.38
CSN9Q03981 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.62□□□□□ -0.39
CSN9Q03981 DCW1YKL046C 1350 nt12.59□□□□□ -0.39
CSN9Q03981 CCT6YDR188W 1641 nt12.57□□□□□ -0.4
CSN9Q03981 MNP1YGL068W 585 nt12.56□□□□□ -0.4
CSN9Q03981 ALF1YNL148C 765 nt12.54□□□□□ -0.4
CSN9Q03981 PTP1YDL230W 1008 nt12.48□□□□□ -0.41
CSN9Q03981 RKM5YLR137W 1104 nt12.46□□□□□ -0.41
CSN9Q03981 RPP2AYOL039W 321 nt12.46□□□□□ -0.41
CSN9Q03981 SIS1YNL007C 1059 nt12.43□□□□□ -0.42
CSN9Q03981 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.42□□□□□ -0.42
CSN9Q03981 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.42□□□□□ -0.42
CSN9Q03981 EMI2YDR516C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
CSN9Q03981 CAC2YML102W 1407 nt12.41□□□□□ -0.42
CSN9Q03981 BDF1YLR399C 2061 nt12.33□□□□□ -0.44
CSN9Q03981 YDL221WYDL221W 552 nt12.31□□□□□ -0.44
CSN9Q03981 YOR139CYOR139C 393 nt12.29□□□□□ -0.44
CSN9Q03981 YMR090WYMR090W 684 nt12.28□□□□□ -0.44
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