Protein–RNA interactions for Protein: P38750

YHL008C, Uncharacterized transporter YHL008C, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CP38750 NSR1YGR159C 1245 nt19.86■□□□□ 0.77
YHL008CP38750 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.53■□□□□ 0.72
YHL008CP38750 NOP1YDL014W 984 nt19.08■□□□□ 0.64
YHL008CP38750 MDJ1YFL016C 1536 nt18.12■□□□□ 0.49
YHL008CP38750 YKL036CYKL036C 393 nt17.85■□□□□ 0.45
YHL008CP38750 Q0297Q0297 156 nt16.84■□□□□ 0.29
YHL008CP38750 SRX1YKL086W 384 nt16.71■□□□□ 0.27
YHL008CP38750 YJL027CYJL027C 417 nt16.67■□□□□ 0.26
YHL008CP38750 SCS3YGL126W 1143 nt16.37■□□□□ 0.21
YHL008CP38750 DBP2YNL112W 1641 nt15.86■□□□□ 0.13
YHL008CP38750 YCR051WYCR051W 669 nt15.82■□□□□ 0.12
YHL008CP38750 YBR190WYBR190W 312 nt15.57■□□□□ 0.08
YHL008CP38750 YOL085CYOL085C 342 nt15.47■□□□□ 0.07
YHL008CP38750 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 RTC3YHR087W 336 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 PKP1YIL042C 1185 nt15.16■□□□□ 0.02
YHL008CP38750 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
YHL008CP38750 CCC1YLR220W 969 nt14.96□□□□□ -0.01
YHL008CP38750 SCJ1YMR214W 1134 nt14.82□□□□□ -0.04
YHL008CP38750 SSA3YBL075C 1950 nt14.82□□□□□ -0.04
YHL008CP38750 Q0182Q0182 405 nt14.74□□□□□ -0.05
YHL008CP38750 RVS167YDR388W 1449 nt14.72□□□□□ -0.05
YHL008CP38750 ATS1YAL020C 1002 nt14.71□□□□□ -0.05
YHL008CP38750 PUT4YOR348C 1884 nt14.56□□□□□ -0.08
YHL008CP38750 PET122YER153C 765 nt14.38□□□□□ -0.11
YHL008CP38750 MOT3YMR070W 1473 nt14.35□□□□□ -0.11
YHL008CP38750 SCR1SCR1 522 nt14.26□□□□□ -0.13
YHL008CP38750 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.23□□□□□ -0.13
YHL008CP38750 ARE1YCR048W 1833 nt14.14□□□□□ -0.15
YHL008CP38750 SHR5YOL110W 714 nt14.13□□□□□ -0.15
YHL008CP38750 POA1YBR022W 534 nt14.03□□□□□ -0.16
YHL008CP38750 URN1YPR152C 1398 nt14.03□□□□□ -0.16
YHL008CP38750 SAH1YER043C 1350 nt13.99□□□□□ -0.17
YHL008CP38750 RRN5YLR141W 1092 nt13.99□□□□□ -0.17
YHL008CP38750 OPI9YLR338W 858 nt13.95□□□□□ -0.18
YHL008CP38750 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.93□□□□□ -0.18
YHL008CP38750 DEP1YAL013W 1218 nt13.88□□□□□ -0.19
YHL008CP38750 BSC6YOL137W 1494 nt13.84□□□□□ -0.19
YHL008CP38750 YDJ1YNL064C 1230 nt13.79□□□□□ -0.2
YHL008CP38750 RSB1YOR049C 1065 nt13.73□□□□□ -0.21
YHL008CP38750 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.72□□□□□ -0.21
YHL008CP38750 RPN10YHR200W 807 nt13.68□□□□□ -0.22
YHL008CP38750 SPT5YML010W 3192 nt13.64□□□□□ -0.23
YHL008CP38750 PST2YDR032C 597 nt13.62□□□□□ -0.23
YHL008CP38750 YNL208WYNL208W 600 nt13.61□□□□□ -0.23
YHL008CP38750 BUD23YCR047C 828 nt13.54□□□□□ -0.24
YHL008CP38750 PUN1YLR414C 792 nt13.52□□□□□ -0.25
YHL008CP38750 GAR1YHR089C 618 nt13.46□□□□□ -0.25
YHL008CP38750 PTC2YER089C 1395 nt13.45□□□□□ -0.26
YHL008CP38750 YJR018WYJR018W 363 nt13.35□□□□□ -0.27
YHL008CP38750 SSA4YER103W 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
YHL008CP38750 NAB2YGL122C 1578 nt13.34□□□□□ -0.27
YHL008CP38750 FIS1YIL065C 468 nt13.15□□□□□ -0.3
YHL008CP38750 YKL097CYKL097C 411 nt13.15□□□□□ -0.3
YHL008CP38750 YJR120WYJR120W 351 nt13.12□□□□□ -0.31
YHL008CP38750 DAL1YIR027C 1383 nt13.07□□□□□ -0.32
YHL008CP38750 TIR1YER011W 765 nt13.05□□□□□ -0.32
YHL008CP38750 MEP2YNL142W 1500 nt13.04□□□□□ -0.32
YHL008CP38750 SSA1YAL005C 1929 nt13.02□□□□□ -0.32
YHL008CP38750 SHU1YHL006C 453 nt12.99□□□□□ -0.33
YHL008CP38750 FPR4YLR449W 1179 nt12.99□□□□□ -0.33
YHL008CP38750 PHO4YFR034C 939 nt12.97□□□□□ -0.33
YHL008CP38750 INM2YDR287W 879 nt12.94□□□□□ -0.34
YHL008CP38750 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
YHL008CP38750 BDF1YLR399C 2061 nt12.9□□□□□ -0.34
YHL008CP38750 YPS1YLR120C 1710 nt12.9□□□□□ -0.34
YHL008CP38750 DCW1YKL046C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
YHL008CP38750 SRB2YHR041C 633 nt12.75□□□□□ -0.37
YHL008CP38750 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.75□□□□□ -0.37
YHL008CP38750 YDR095CYDR095C 411 nt12.74□□□□□ -0.37
YHL008CP38750 YBL100CYBL100C 315 nt12.74□□□□□ -0.37
YHL008CP38750 TAT1YBR069C 1860 nt12.72□□□□□ -0.37
YHL008CP38750 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.69□□□□□ -0.38
YHL008CP38750 EMI2YDR516C 1503 nt12.64□□□□□ -0.39
YHL008CP38750 YOR139CYOR139C 393 nt12.63□□□□□ -0.39
YHL008CP38750 BDH2YAL061W 1254 nt12.61□□□□□ -0.39
YHL008CP38750 YBR220CYBR220C 1683 nt12.61□□□□□ -0.39
YHL008CP38750 FUN26YAL022C 1554 nt12.58□□□□□ -0.4
YHL008CP38750 YMR090WYMR090W 684 nt12.55□□□□□ -0.4
YHL008CP38750 PTP1YDL230W 1008 nt12.54□□□□□ -0.4
YHL008CP38750 YDL221WYDL221W 552 nt12.52□□□□□ -0.41
YHL008CP38750 CAC2YML102W 1407 nt12.51□□□□□ -0.41
YHL008CP38750 RPP2AYOL039W 321 nt12.48□□□□□ -0.41
YHL008CP38750 ALF1YNL148C 765 nt12.46□□□□□ -0.41
YHL008CP38750 SDH1YKL148C 1923 nt12.46□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 WWM1YFL010C 636 nt12.43□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 TRM9YML014W 840 nt12.43□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 YGR021WYGR021W 873 nt12.42□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 HOM6YJR139C 1080 nt12.42□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 NPL3YDR432W 1245 nt12.4□□□□□ -0.42
YHL008CP38750 CCT6YDR188W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
YHL008CP38750 MNP1YGL068W 585 nt12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms