RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)K

tK(UUU)K, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)K, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)KtK(UUU)K CDC12P32468 407 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CYM1P32898 989 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K LRG1P35688 1017 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ASK1P35734 292 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CAB3P36076 571 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YBR071WP38243 211 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K BMT2P38278 337 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K IFA38P38286 347 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YHL008CP38750 627 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GGC1P38988 300 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RGA1P39083 1007 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K FRT2P39734 528 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GID8P40208 455 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YRB1P41920 201 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K FAR3P46671 204 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K URB2P47108 1174 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K LIA1P47120 325 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K TRM9P49957 279 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SLM2P53955 656 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K MRS2Q01926 470 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ECM9Q02202 377 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K USA1Q03714 838 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K TAF12Q03761 539 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YMR155WQ03795 547 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CSN9Q03981 162 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ROY1Q04847 553 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PNP1Q05788 311 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GIC2Q06648 383 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CDA1Q06702 301 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K VAM6Q07468 1049 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PFA4Q12006 378 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K NMD4Q12129 218 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K HAL9Q12180 1030 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YPR011CQ12251 326 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K Q0010Q9ZZX9 128 aa3.17□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PHO5P00635 467 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PRT1P06103 763 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K STE7P06784 515 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SPT3P06844 337 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K KIN2P13186 1147 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SEC15P22224 910 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K MGR1P25573 417 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K LDB16P25587 256 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K KAP122P32767 1081 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.16□□□□□ -1.9not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K SDH3P33421 198 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K KKQ8P36004 724 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K APT2P36973 181 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RRN10P38204 145 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K FTH1P38310 465 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K MET30P39014 640 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP39P39682 629 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YIL001WP40560 513 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K AXL1P40851 1208 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SPG5P42933 373 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ELP2P42935 788 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SDT1P53078 280 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K KXD1P53158 218 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K SGF73P53165 657 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GTR2P53290 341 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RMI1Q02685 241 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GOT1Q03554 138 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K HDA3Q06623 655 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RAD34Q06665 692 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR053CQ12026 108 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K REX3Q12090 404 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GET4Q12125 312 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YLL054CQ12244 843 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K ATG34Q12292 412 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K NTO1Q12311 748 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GLE1Q12315 538 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K GLO4Q12320 285 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YVC1Q12324 675 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K HSP42Q12329 375 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K PST1Q12355 444 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K YLR111WQ12528 110 aa3.16□□□□□ -1.9
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL17AP05740 184 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K CBS2P14905 389 aa3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K NAR1P23503 491 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
tK(UUU)KtK(UUU)K PHO87P25360 923 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.4 ms