RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W UBR1P19812 1950 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ATG22P25568 528 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W THI4P32318 326 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ERT1P38140 529 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W REG2P38232 338 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MNN5P46982 586 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W IRC18P47056 224 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MRH4P53166 561 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W REG1Q00816 1014 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W GRS2Q06817 618 aa12.5□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ECM29P38737 1868 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W TOD6P34219 525 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W CAF4P36130 643 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PHM8P40025 321 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ALD5P40047 520 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SLG1P54867 378 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W BSC2Q05611 235 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PEX27Q08580 376 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W NBP2Q12163 236 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RPN6Q12377 434 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MIS1P09440 975 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W BEM1P29366 551 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W COX13P32799 129 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PTM1P32857 523 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data12.49□□□□□ -0.41not detected
SSA4YER103W PFD1P46988 109 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ACF4P47129 309 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PEX31P53203 462 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W IBD2P53892 351 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W TAF12Q03761 539 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YDR131CQ03899 556 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SWA2Q06677 668 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YOR214CQ12282 236 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W JLP1Q12358 412 aa12.49□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W ZRT3P34240 503 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W AGP2P38090 596 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MSC7P38694 644 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MUP3P38734 546 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RIM4P38741 713 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PCL6P40038 420 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W EFM5P53200 248 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W TRS31Q03337 283 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YLR345WQ06137 509 aa12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MRPL7P36519 292 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RIB1P38066 345 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SFB3P38810 929 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YER034WP40022 185 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SOK1P40317 901 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W PTR3P43606 678 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YGR168CP53293 376 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W VAC7P53950 1165 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YNL018CP53976 612 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SKY1Q03656 742 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RIF2Q06208 395 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W CDD1Q06549 142 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W APE1P14904 514 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W TKL1P23254 680 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W UTR4P32626 227 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W MRP21P38175 177 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W LEU5P38702 357 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YHR054CP38780 354 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W RSC30P38781 883 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W COG3P40094 801 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YIR007WP40566 764 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W SEG1Q04279 960 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W TRE2Q08693 809 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W GPM2Q12008 311 aa12.47□□□□□ -0.41
SSA4YER103W FBP1P09201 348 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W AAT2P23542 418 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W LRE1P25579 583 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SDH3P33421 198 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W HAT2P39984 401 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W NUP85P46673 744 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ROM1P53046 1155 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W TPN1P53099 579 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W GND2P53319 492 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W YAT1P80235 687 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W RCO1Q04779 684 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W GPB1Q08886 897 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data12.46□□□□□ -0.42not detected
SSA4YER103W MDM32Q12171 622 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ERP3Q12403 225 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MDM12Q92328 271 aa12.46□□□□□ -0.42
SSA4YER103W SKT5P34226 696 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W MLH1P38920 769 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ERV46P39727 415 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data12.45□□□□□ -0.42not detected
SSA4YER103W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W BOL2P53082 120 aa12.45□□□□□ -0.42
SSA4YER103W KTR6P54070 446 aa12.45□□□□□ -0.42
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