RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W SGS1P35187 1447 aa20.38■□□□□ 0.85
SSA4YER103W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SSA4YER103W SSN2P38931 1420 aa20.02■□□□□ 0.8
SSA4YER103W INO80P53115 1489 aa19.65■□□□□ 0.74
SSA4YER103W DRS1P32892 752 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
SSA4YER103W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SSA4YER103W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SSA4YER103W TY1B-DR4Q07793 1604 aa18.68■□□□□ 0.58
SSA4YER103W HSL1P34244 1518 aa18.57■□□□□ 0.56
SSA4YER103W CHD1P32657 1468 aa18.52■□□□□ 0.56
SSA4YER103W MMS22Q06164 1454 aa18.5■□□□□ 0.55
SSA4YER103W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SSA4YER103W NOP2P40991 618 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SSA4YER103W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SSA4YER103W HIR3P47171 1648 aa18.31■□□□□ 0.52
SSA4YER103W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data18.23■□□□□ 0.51not detected
SSA4YER103W THO2P53552 1597 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SSA4YER103W REV3P14284 1504 aa18.17■□□□□ 0.5
SSA4YER103W SIN3P22579 1536 aa18.11■□□□□ 0.49
SSA4YER103W UFD4P33202 1483 aa18.09■□□□□ 0.49
SSA4YER103W SSK2P53599 1579 aa18.07■□□□□ 0.48
SSA4YER103W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SSA4YER103W STU1P38198 1513 aa17.93■□□□□ 0.46
SSA4YER103W TAF2P23255 1407 aa17.91■□□□□ 0.46
SSA4YER103W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SSA4YER103W TRM732Q03496 1420 aa17.9■□□□□ 0.46
SSA4YER103W ESP1Q03018 1630 aa17.87■□□□□ 0.45
SSA4YER103W POL1P13382 1468 aa17.82■□□□□ 0.44
SSA4YER103W YTA7P40340 1379 aa17.82■□□□□ 0.44
SSA4YER103W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SSA4YER103W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SSA4YER103W SWR1Q05471 1514 aa17.75■□□□□ 0.43
SSA4YER103W SPP41P38904 1435 aa17.73■□□□□ 0.43
SSA4YER103W BPT1P14772 1559 aa17.73■□□□□ 0.43
SSA4YER103W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
SSA4YER103W SCC2Q04002 1493 aa17.62■□□□□ 0.41
SSA4YER103W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SSA4YER103W ENP1P38333 483 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SSA4YER103W NUP170P38181 1502 aa17.55■□□□□ 0.4
SSA4YER103W ECM5Q03214 1411 aa17.55■□□□□ 0.4
SSA4YER103W MYO4P32492 1471 aa17.51■□□□□ 0.39
SSA4YER103W SSM4P40318 1319 aa17.51■□□□□ 0.39
SSA4YER103W YPK9Q12697 1472 aa17.5■□□□□ 0.39
SSA4YER103W DNA2P38859 1522 aa17.49■□□□□ 0.39
SSA4YER103W YOR1P53049 1477 aa17.47■□□□□ 0.39
SSA4YER103W RKR1Q04781 1562 aa17.46■□□□□ 0.39
SSA4YER103W BUD4P47136 1447 aa17.43■□□□□ 0.38
SSA4YER103W POL5P39985 1022 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SSA4YER103W ATG2P53855 1592 aa17.38■□□□□ 0.37
SSA4YER103W TAF7Q05021 590 aa17.37■□□□□ 0.37
SSA4YER103W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SSA4YER103W SMC4Q12267 1418 aa17.3■□□□□ 0.36
SSA4YER103W STH1P32597 1359 aa17.3■□□□□ 0.36
SSA4YER103W MLP2P40457 1679 aa17.25■□□□□ 0.35
SSA4YER103W PAN1P32521 1480 aa17.24■□□□□ 0.35
SSA4YER103W SPT7P35177 1332 aa17.23■□□□□ 0.35
SSA4YER103W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SSA4YER103W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SSA4YER103W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SSA4YER103W RTT106P40161 455 aa17.16■□□□□ 0.34
SSA4YER103W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SSA4YER103W RPO31P04051 1460 aa17.15■□□□□ 0.34
SSA4YER103W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
SSA4YER103W IFH1P39520 1085 aa17.12■□□□□ 0.33
SSA4YER103W TSC11P40061 1430 aa17.12■□□□□ 0.33
SSA4YER103W PDR10P51533 1564 aa17.1■□□□□ 0.33
SSA4YER103W PEP1P32319 1579 aa17.09■□□□□ 0.33
SSA4YER103W KOG1P38873 1557 aa17.07■□□□□ 0.32
SSA4YER103W TY1B-DR3Q99231 1755 aa17.04■□□□□ 0.32
SSA4YER103W ULS1Q08562 1619 aa17.02■□□□□ 0.32
SSA4YER103W PRS1P32895 427 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-FP0CX63 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-CP25384 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-DR2Q03494 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY1B-DR1Q03855 1755 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-OR1Q12113 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-DR1Q12472 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY2B-OR2Q12501 1770 aa16.99■□□□□ 0.31
SSA4YER103W TY3B-GQ99315 1547 aa16.93■□□□□ 0.3
SSA4YER103W TY2B-BQ12491 1770 aa16.89■□□□□ 0.29
SSA4YER103W VPS15P22219 1454 aa16.84■□□□□ 0.29
SSA4YER103W MDS3P53094 1487 aa16.83■□□□□ 0.28
SSA4YER103W CAB3P36076 571 aa16.82■□□□□ 0.28
SSA4YER103W TFA1P36100 482 aa16.78■□□□□ 0.28
SSA4YER103W DNF1P32660 1571 aa16.78■□□□□ 0.28
SSA4YER103W LEU3P08638 886 aa16.77■□□□□ 0.28
SSA4YER103W SRB8P25648 1427 aa16.77■□□□□ 0.27
SSA4YER103W NUP159P40477 1460 aa16.75■□□□□ 0.27
SSA4YER103W EBP2P36049 427 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SSA4YER103W YPR148CQ06523 435 aa16.74■□□□□ 0.27
SSA4YER103W YBT1P32386 1661 aa16.74■□□□□ 0.27
SSA4YER103W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SSA4YER103W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SSA4YER103W TY1B-HO13535 1793 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
SSA4YER103W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa16.69■□□□□ 0.26
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