RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	PFA3	P42836	336 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	HST2	P53686	357 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CSN9	Q03981	162 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	VAC14	Q06708	880 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	GTT2	Q12390	233 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	GPA2	P10823	449 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	KIP2	P28743	706 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	EXO84	P38261	753 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	VHC1	P38329	1120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CCT6	P39079	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MEF2	P39677	819 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MBP1	P39678	833 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	IKS1	P47042	667 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YJL049W	P47048	450 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TEP1	P53916	434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	BLS1	Q06071	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ESA1	Q08649	445 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	IOC2	Q12072	812 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	DAS2	Q12084	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
STE6	YKL209C	YRM1	Q12340	786 aa		3.13	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CDC8	P00572	216 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	HEM2	P05373	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SPS1	P08458	490 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PMT1	P33775	817 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TMA108	P40462	946 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YJR115W	P47152	169 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MRX6	P48564	524 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	FRE4	P53746	719 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	NMA111	P53920	997 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	SSL2	Q00578	843 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TPO4	Q12256	659 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	AEP1	P32493	518 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	HSM3	P38348	480 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	REV7	P38927	245 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ATF2	P53296	535 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ALF1	P53904	254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TFB2	Q02939	513 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	NHX1	Q04121	633 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YOL024W	Q08172	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CCH1	P50077	2039 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MET8	P15807	274 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CLN1	P20437	546 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PUP2	P32379	260 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	BEM3	P32873	1128 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	OAR1	P35731	278 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	UBS1	P38290	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	APE4	P38821	490 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CIN1	P40987	1014 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TEL2	P53038	688 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	NUP100	Q02629	959 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YMR187C	Q03236	431 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	VID22	Q05934	901 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	FAR10	Q06001	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	MCP2	Q06567	569 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PLB3	Q08108	686 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ATG29	Q12092	213 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PNS1	Q12412	539 aa		3.12	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	not detected
STE6	YKL209C	GDA1	P32621	518 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	PCH2	P38126	564 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	CHS7	P38843	316 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YEL020C	P39994	560 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YAT2	P40017	923 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ARG2	P40360	574 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	RIM21	P48565	533 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	COS12	P53053	380 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	ERG5	P54781	538 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	DIN7	Q12086	430 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	DPB3	P27344	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	UTH1	P36135	365 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	GLG1	P36143	616 aa		3.11	□□□□□ -1.91
STE6	YKL209C	TDA11	P38854	504 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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