Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.19■□□□□ 0.98
PUF2Q12221 NSR1YGR159C 1245 nt20.92■□□□□ 0.94
PUF2Q12221 NOP1YDL014W 984 nt20.55■□□□□ 0.88
PUF2Q12221 YKL036CYKL036C 393 nt19.08■□□□□ 0.64
PUF2Q12221 MDJ1YFL016C 1536 nt18.61■□□□□ 0.57
PUF2Q12221 Q0297Q0297 156 nt18.06■□□□□ 0.48
PUF2Q12221 SRX1YKL086W 384 nt17.99■□□□□ 0.47
PUF2Q12221 YJL027CYJL027C 417 nt17.84■□□□□ 0.45
PUF2Q12221 SCS3YGL126W 1143 nt17.46■□□□□ 0.39
PUF2Q12221 YCR051WYCR051W 669 nt17.1■□□□□ 0.33
PUF2Q12221 YOL085CYOL085C 342 nt16.55■□□□□ 0.24
PUF2Q12221 DBP2YNL112W 1641 nt16.51■□□□□ 0.23
PUF2Q12221 PKP1YIL042C 1185 nt16.34■□□□□ 0.21
PUF2Q12221 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 RPP1BYDL130W 321 nt16.21■□□□□ 0.19
PUF2Q12221 CCC1YLR220W 969 nt16.1■□□□□ 0.17
PUF2Q12221 YBR190WYBR190W 312 nt15.76■□□□□ 0.11
PUF2Q12221 ATS1YAL020C 1002 nt15.61■□□□□ 0.09
PUF2Q12221 PET122YER153C 765 nt15.52■□□□□ 0.08
PUF2Q12221 SCJ1YMR214W 1134 nt15.5■□□□□ 0.07
PUF2Q12221 RTC3YHR087W 336 nt15.44■□□□□ 0.06
PUF2Q12221 RVS167YDR388W 1449 nt15.42■□□□□ 0.06
PUF2Q12221 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.41■□□□□ 0.06
PUF2Q12221 SCR1SCR1 522 nt15.3■□□□□ 0.04
PUF2Q12221 RRN5YLR141W 1092 nt15.07■□□□□ 0
PUF2Q12221 SHR5YOL110W 714 nt14.95□□□□□ -0.02
PUF2Q12221 YDJ1YNL064C 1230 nt14.85□□□□□ -0.03
PUF2Q12221 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.78□□□□□ -0.04
PUF2Q12221 RSB1YOR049C 1065 nt14.77□□□□□ -0.05
PUF2Q12221 GAR1YHR089C 618 nt14.57□□□□□ -0.08
PUF2Q12221 DEP1YAL013W 1218 nt14.55□□□□□ -0.08
PUF2Q12221 URN1YPR152C 1398 nt14.5□□□□□ -0.09
PUF2Q12221 PST2YDR032C 597 nt14.45□□□□□ -0.1
PUF2Q12221 PUT4YOR348C 1884 nt14.31□□□□□ -0.12
PUF2Q12221 YNL208WYNL208W 600 nt14.27□□□□□ -0.13
PUF2Q12221 OPI9YLR338W 858 nt14.25□□□□□ -0.13
PUF2Q12221 RPN10YHR200W 807 nt14.23□□□□□ -0.13
PUF2Q12221 SAH1YER043C 1350 nt14.19□□□□□ -0.14
PUF2Q12221 ARE1YCR048W 1833 nt14.08□□□□□ -0.15
PUF2Q12221 TIR1YER011W 765 nt14.06□□□□□ -0.16
PUF2Q12221 SSA1YAL005C 1929 nt13.91□□□□□ -0.18
PUF2Q12221 YKL097CYKL097C 411 nt13.9□□□□□ -0.18
PUF2Q12221 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.89□□□□□ -0.19
PUF2Q12221 SHU1YHL006C 453 nt13.88□□□□□ -0.19
PUF2Q12221 POA1YBR022W 534 nt13.87□□□□□ -0.19
PUF2Q12221 YJR018WYJR018W 363 nt13.81□□□□□ -0.2
PUF2Q12221 PUN1YLR414C 792 nt13.81□□□□□ -0.2
PUF2Q12221 SRB2YHR041C 633 nt13.78□□□□□ -0.2
PUF2Q12221 YJR120WYJR120W 351 nt13.71□□□□□ -0.21
PUF2Q12221 PTC2YER089C 1395 nt13.68□□□□□ -0.22
PUF2Q12221 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.67□□□□□ -0.22
PUF2Q12221 BUD23YCR047C 828 nt13.57□□□□□ -0.24
PUF2Q12221 BSC6YOL137W 1494 nt13.55□□□□□ -0.24
PUF2Q12221 RPP2BYDR382W 333 nt13.52□□□□□ -0.25
PUF2Q12221 WWM1YFL010C 636 nt13.49□□□□□ -0.25
PUF2Q12221 NAB2YGL122C 1578 nt13.45□□□□□ -0.26
PUF2Q12221 YOR139CYOR139C 393 nt13.39□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 MNP1YGL068W 585 nt13.37□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 HOM6YJR139C 1080 nt13.37□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 YGR021WYGR021W 873 nt13.36□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 SSA3YBL075C 1950 nt13.35□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 FIS1YIL065C 468 nt13.34□□□□□ -0.27
PUF2Q12221 DAL1YIR027C 1383 nt13.31□□□□□ -0.28
PUF2Q12221 BDH2YAL061W 1254 nt13.3□□□□□ -0.28
PUF2Q12221 FPR4YLR449W 1179 nt13.3□□□□□ -0.28
PUF2Q12221 INM2YDR287W 879 nt13.27□□□□□ -0.29
PUF2Q12221 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.21□□□□□ -0.29
PUF2Q12221 PHO4YFR034C 939 nt13.21□□□□□ -0.29
PUF2Q12221 YBL100CYBL100C 315 nt13.21□□□□□ -0.29
PUF2Q12221 NPL3YDR432W 1245 nt13.2□□□□□ -0.3
PUF2Q12221 RKM5YLR137W 1104 nt13.17□□□□□ -0.3
PUF2Q12221 LSM3YLR438C-A 270 nt13.11□□□□□ -0.31
PUF2Q12221 YOL037CYOL037C 354 nt13.09□□□□□ -0.31
PUF2Q12221 FUN26YAL022C 1554 nt13.07□□□□□ -0.32
PUF2Q12221 TRM9YML014W 840 nt13□□□□□ -0.33
PUF2Q12221 YPS1YLR120C 1710 nt12.91□□□□□ -0.34 RIP-Chip
PUF2Q12221 CCT6YDR188W 1641 nt12.9□□□□□ -0.34
PUF2Q12221 SPT5YML010W 3192 nt12.86□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 YDR095CYDR095C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.84□□□□□ -0.35
PUF2Q12221 YLR281CYLR281C 468 nt12.81□□□□□ -0.36
PUF2Q12221 ALF1YNL148C 765 nt12.81□□□□□ -0.36
PUF2Q12221 WHI5YOR083W 888 nt12.76□□□□□ -0.37
PUF2Q12221 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.75□□□□□ -0.37
PUF2Q12221 PUS2YGL063W 1113 nt12.73□□□□□ -0.37
PUF2Q12221 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.73□□□□□ -0.37
PUF2Q12221 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.73□□□□□ -0.37
PUF2Q12221 MEP2YNL142W 1500 nt12.69□□□□□ -0.38
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