RNA–Protein interactions for RNA: YHR133C

NSG1, Transcript of Protein involved in regulation of sterol biosynthesis, yeast

Gene NSG1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSG1	YHR133C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	VAN1	P23642	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	PHO3	P24031	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	ASK1	P35734	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	RRN3	P36070	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	HSM3	P38348	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	YHR078W	P38799	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	FMO1	P38866	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	IRR1	P40541	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	RPA14	P50106	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	NUP84	P52891	726 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SWC4	P53201	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	CCE1	Q03702	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	BLS1	Q06071	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	VTA1	Q06263	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	BUD7	Q08754	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	UBX3	Q12229	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MDY2	Q12285	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	GTT2	Q12390	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	VAC17	P25591	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	PTM1	P32857	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	PMT1	P33775	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	TFC3	P34111	1160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	THI80	P35202	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	ARP1	P38696	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MUP3	P38734	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	PCL5	P38794	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MEP1	P40260	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SER33	P40510	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	AXL1	P40851	1208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	MAD3	P47074	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	NNF1	P47149	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	CLD1	P53264	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	FRE4	P53746	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	TGL2	P54857	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	ARP4	P80428	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
NSG1	YHR133C	OSH6	Q02201	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	TVP15	Q03860	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SPO20	Q04359	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	SEC10	Q06245	871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	OPT2	Q06593	877 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	APC9	Q12107	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	ICT1	Q12385	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NSG1	YHR133C	HEM2	P05373	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SPS1	P08458	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GAL11	P19659	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	BAS1	P22035	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	EPT1	P22140	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	DEP1	P31385	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SFP1	P32432	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YSC84	P32793	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
NSG1	YHR133C	PPX1	P38698	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	DBP8	P38719	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	EFM1	P38732	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YDR089W	P38966	869 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
NSG1	YHR133C	PIK1	P39104	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MRX1	P40050	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MGS1	P40151	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MRM2	P53123	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	AQR1	P53943	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SMA1	Q02651	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	VPS16	Q03308	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GNT1	Q12096	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YPT6	Q99260	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RHO2	P06781	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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