Protein–RNA interactions for Protein: Q03860

TVP15, Golgi apparatus membrane protein TVP15, yeastyeast

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP15Q03860 NSR1YGR159C 1245 nt20.16■□□□□ 0.82
TVP15Q03860 YML009W-BYML009W-B 477 nt20■□□□□ 0.79
TVP15Q03860 NOP1YDL014W 984 nt19.27■□□□□ 0.68
TVP15Q03860 MDJ1YFL016C 1536 nt18.28■□□□□ 0.52
TVP15Q03860 YKL036CYKL036C 393 nt17.45■□□□□ 0.38
TVP15Q03860 YJL027CYJL027C 417 nt16.83■□□□□ 0.28
TVP15Q03860 SRX1YKL086W 384 nt16.83■□□□□ 0.28
TVP15Q03860 Q0297Q0297 156 nt16.75■□□□□ 0.27
TVP15Q03860 DBP2YNL112W 1641 nt16.01■□□□□ 0.15
TVP15Q03860 YCR051WYCR051W 669 nt15.97■□□□□ 0.15
TVP15Q03860 SCS3YGL126W 1143 nt15.71■□□□□ 0.11
TVP15Q03860 YBR190WYBR190W 312 nt15.65■□□□□ 0.1
TVP15Q03860 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.45■□□□□ 0.06
TVP15Q03860 CCC1YLR220W 969 nt15.31■□□□□ 0.04
TVP15Q03860 RTC3YHR087W 336 nt15.3■□□□□ 0.04
TVP15Q03860 YOL085CYOL085C 342 nt15.14■□□□□ 0.01
TVP15Q03860 RPP1BYDL130W 321 nt15.04■□□□□ -0
TVP15Q03860 PKP1YIL042C 1185 nt14.98□□□□□ -0.01
TVP15Q03860 RVS167YDR388W 1449 nt14.95□□□□□ -0.02
TVP15Q03860 SCJ1YMR214W 1134 nt14.85□□□□□ -0.03
TVP15Q03860 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.5□□□□□ -0.09
TVP15Q03860 PUT4YOR348C 1884 nt14.5□□□□□ -0.09
TVP15Q03860 PET122YER153C 765 nt14.43□□□□□ -0.1
TVP15Q03860 SSA3YBL075C 1950 nt14.37□□□□□ -0.11
TVP15Q03860 SHR5YOL110W 714 nt14.36□□□□□ -0.11
TVP15Q03860 URN1YPR152C 1398 nt14.2□□□□□ -0.14
TVP15Q03860 SCR1SCR1 522 nt14.15□□□□□ -0.14
TVP15Q03860 ARE1YCR048W 1833 nt14.12□□□□□ -0.15
TVP15Q03860 DEP1YAL013W 1218 nt14.11□□□□□ -0.15
TVP15Q03860 SAH1YER043C 1350 nt14.07□□□□□ -0.16
TVP15Q03860 OPI9YLR338W 858 nt14.05□□□□□ -0.16
TVP15Q03860 POA1YBR022W 534 nt14.03□□□□□ -0.16
TVP15Q03860 YDJ1YNL064C 1230 nt14.02□□□□□ -0.17
TVP15Q03860 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.97□□□□□ -0.17
TVP15Q03860 RRN5YLR141W 1092 nt13.97□□□□□ -0.17
TVP15Q03860 ATS1YAL020C 1002 nt13.94□□□□□ -0.18
TVP15Q03860 RPN10YHR200W 807 nt13.88□□□□□ -0.19
TVP15Q03860 YNL208WYNL208W 600 nt13.81□□□□□ -0.2
TVP15Q03860 BSC6YOL137W 1494 nt13.8□□□□□ -0.2
TVP15Q03860 GAR1YHR089C 618 nt13.79□□□□□ -0.2
TVP15Q03860 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.69□□□□□ -0.22
TVP15Q03860 PUN1YLR414C 792 nt13.63□□□□□ -0.23
TVP15Q03860 BUD23YCR047C 828 nt13.62□□□□□ -0.23
TVP15Q03860 RSB1YOR049C 1065 nt13.58□□□□□ -0.24
TVP15Q03860 PTC2YER089C 1395 nt13.55□□□□□ -0.24
TVP15Q03860 YJR018WYJR018W 363 nt13.51□□□□□ -0.25
TVP15Q03860 NAB2YGL122C 1578 nt13.4□□□□□ -0.26
TVP15Q03860 SPT5YML010W 3192 nt13.36□□□□□ -0.27
TVP15Q03860 TIR1YER011W 765 nt13.33□□□□□ -0.28
TVP15Q03860 YJR120WYJR120W 351 nt13.25□□□□□ -0.29
TVP15Q03860 SSA1YAL005C 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
TVP15Q03860 FIS1YIL065C 468 nt13.2□□□□□ -0.3
TVP15Q03860 DAL1YIR027C 1383 nt13.17□□□□□ -0.3
TVP15Q03860 FPR4YLR449W 1179 nt13.15□□□□□ -0.3
TVP15Q03860 RPP2BYDR382W 333 nt13.13□□□□□ -0.31
TVP15Q03860 SSA4YER103W 1929 nt13.08□□□□□ -0.32
TVP15Q03860 INM2YDR287W 879 nt13.06□□□□□ -0.32
TVP15Q03860 PHO4YFR034C 939 nt13.05□□□□□ -0.32
TVP15Q03860 SRB2YHR041C 633 nt12.99□□□□□ -0.33
TVP15Q03860 MEP2YNL142W 1500 nt12.98□□□□□ -0.33
TVP15Q03860 PST2YDR032C 597 nt12.97□□□□□ -0.33
TVP15Q03860 YPS1YLR120C 1710 nt12.91□□□□□ -0.34
TVP15Q03860 YBL100CYBL100C 315 nt12.9□□□□□ -0.34
TVP15Q03860 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.81□□□□□ -0.36
TVP15Q03860 BDH2YAL061W 1254 nt12.81□□□□□ -0.36
TVP15Q03860 DCW1YKL046C 1350 nt12.79□□□□□ -0.36
TVP15Q03860 YDR095CYDR095C 411 nt12.78□□□□□ -0.36
TVP15Q03860 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
TVP15Q03860 WWM1YFL010C 636 nt12.7□□□□□ -0.38
TVP15Q03860 TRM9YML014W 840 nt12.63□□□□□ -0.39
TVP15Q03860 ALF1YNL148C 765 nt12.63□□□□□ -0.39
TVP15Q03860 EMI2YDR516C 1503 nt12.6□□□□□ -0.39
TVP15Q03860 BDF1YLR399C 2061 nt12.58□□□□□ -0.4
TVP15Q03860 LSM3YLR438C-A 270 nt12.56□□□□□ -0.4
TVP15Q03860 PTP1YDL230W 1008 nt12.54□□□□□ -0.4
TVP15Q03860 SHU1YHL006C 453 nt12.54□□□□□ -0.4
TVP15Q03860 RPP2AYOL039W 321 nt12.54□□□□□ -0.4
TVP15Q03860 CCT6YDR188W 1641 nt12.51□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YMR090WYMR090W 684 nt12.51□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 CAC2YML102W 1407 nt12.51□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YGR021WYGR021W 873 nt12.49□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YDL221WYDL221W 552 nt12.48□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.48□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.48□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 YBR220CYBR220C 1683 nt12.47□□□□□ -0.41
TVP15Q03860 HOM6YJR139C 1080 nt12.44□□□□□ -0.42
TVP15Q03860 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP15Q03860 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP15Q03860 SIS1YNL007C 1059 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP15Q03860 TAT1YBR069C 1860 nt12.42□□□□□ -0.42
TVP15Q03860 SDH1YKL148C 1923 nt12.38□□□□□ -0.43
TVP15Q03860 MNP1YGL068W 585 nt12.35□□□□□ -0.43
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