Protein–RNA interactions for Protein: Q12107

APC9, Anaphase-promoting complex subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APC9Q12107 NSR1YGR159C 1245 nt20.21■□□□□ 0.83
APC9Q12107 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.08■□□□□ 0.81
APC9Q12107 NOP1YDL014W 984 nt19.34■□□□□ 0.69
APC9Q12107 MDJ1YFL016C 1536 nt18.28■□□□□ 0.52
APC9Q12107 YKL036CYKL036C 393 nt17.64■□□□□ 0.41
APC9Q12107 SRX1YKL086W 384 nt16.97■□□□□ 0.31
APC9Q12107 Q0297Q0297 156 nt16.94■□□□□ 0.3
APC9Q12107 YJL027CYJL027C 417 nt16.76■□□□□ 0.27
APC9Q12107 DBP2YNL112W 1641 nt16.12■□□□□ 0.17
APC9Q12107 YCR051WYCR051W 669 nt16.05■□□□□ 0.16
APC9Q12107 SCS3YGL126W 1143 nt15.96■□□□□ 0.15
APC9Q12107 YBR190WYBR190W 312 nt15.61■□□□□ 0.09
APC9Q12107 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
APC9Q12107 CCC1YLR220W 969 nt15.34■□□□□ 0.05
APC9Q12107 YOL085CYOL085C 342 nt15.34■□□□□ 0.05
APC9Q12107 RTC3YHR087W 336 nt15.19■□□□□ 0.02
APC9Q12107 RPP1BYDL130W 321 nt15.18■□□□□ 0.02
APC9Q12107 PKP1YIL042C 1185 nt15.14■□□□□ 0.01
APC9Q12107 SCJ1YMR214W 1134 nt14.94□□□□□ -0.02
APC9Q12107 RVS167YDR388W 1449 nt14.89□□□□□ -0.03
APC9Q12107 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
APC9Q12107 PET122YER153C 765 nt14.57□□□□□ -0.08
APC9Q12107 PUT4YOR348C 1884 nt14.47□□□□□ -0.09
APC9Q12107 SHR5YOL110W 714 nt14.38□□□□□ -0.11
APC9Q12107 SCR1SCR1 522 nt14.22□□□□□ -0.13
APC9Q12107 SSA3YBL075C 1950 nt14.19□□□□□ -0.14
APC9Q12107 ATS1YAL020C 1002 nt14.18□□□□□ -0.14
APC9Q12107 URN1YPR152C 1398 nt14.17□□□□□ -0.14
APC9Q12107 YDJ1YNL064C 1230 nt14.12□□□□□ -0.15
APC9Q12107 ARE1YCR048W 1833 nt14.12□□□□□ -0.15
APC9Q12107 RRN5YLR141W 1092 nt14.11□□□□□ -0.15
APC9Q12107 DEP1YAL013W 1218 nt14.1□□□□□ -0.15
APC9Q12107 OPI9YLR338W 858 nt14.04□□□□□ -0.16
APC9Q12107 SAH1YER043C 1350 nt14.04□□□□□ -0.16
APC9Q12107 POA1YBR022W 534 nt13.95□□□□□ -0.18
APC9Q12107 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.89□□□□□ -0.19
APC9Q12107 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.84□□□□□ -0.19
APC9Q12107 GAR1YHR089C 618 nt13.84□□□□□ -0.19
APC9Q12107 RPN10YHR200W 807 nt13.8□□□□□ -0.2
APC9Q12107 YNL208WYNL208W 600 nt13.8□□□□□ -0.2
APC9Q12107 BSC6YOL137W 1494 nt13.72□□□□□ -0.21
APC9Q12107 RSB1YOR049C 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
APC9Q12107 PUN1YLR414C 792 nt13.58□□□□□ -0.24
APC9Q12107 PTC2YER089C 1395 nt13.5□□□□□ -0.25
APC9Q12107 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
APC9Q12107 YJR018WYJR018W 363 nt13.49□□□□□ -0.25
APC9Q12107 SPT5YML010W 3192 nt13.41□□□□□ -0.26
APC9Q12107 TIR1YER011W 765 nt13.4□□□□□ -0.26
APC9Q12107 YJR120WYJR120W 351 nt13.37□□□□□ -0.27
APC9Q12107 SSA1YAL005C 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
APC9Q12107 NAB2YGL122C 1578 nt13.33□□□□□ -0.28
APC9Q12107 PST2YDR032C 597 nt13.22□□□□□ -0.29
APC9Q12107 FIS1YIL065C 468 nt13.21□□□□□ -0.29
APC9Q12107 SRB2YHR041C 633 nt13.18□□□□□ -0.3
APC9Q12107 DAL1YIR027C 1383 nt13.12□□□□□ -0.31
APC9Q12107 RPP2BYDR382W 333 nt13.06□□□□□ -0.32
APC9Q12107 FPR4YLR449W 1179 nt13.04□□□□□ -0.32
APC9Q12107 PHO4YFR034C 939 nt13.02□□□□□ -0.33
APC9Q12107 INM2YDR287W 879 nt13.01□□□□□ -0.33
APC9Q12107 SSA4YER103W 1929 nt12.97□□□□□ -0.33
APC9Q12107 MEP2YNL142W 1500 nt12.9□□□□□ -0.34
APC9Q12107 YPS1YLR120C 1710 nt12.88□□□□□ -0.35
APC9Q12107 YBL100CYBL100C 315 nt12.86□□□□□ -0.35
APC9Q12107 BDH2YAL061W 1254 nt12.83□□□□□ -0.36
APC9Q12107 WWM1YFL010C 636 nt12.79□□□□□ -0.36
APC9Q12107 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
APC9Q12107 SHU1YHL006C 453 nt12.76□□□□□ -0.37
APC9Q12107 DCW1YKL046C 1350 nt12.74□□□□□ -0.37
APC9Q12107 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
APC9Q12107 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.7□□□□□ -0.38
APC9Q12107 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.65□□□□□ -0.38
APC9Q12107 LSM3YLR438C-A 270 nt12.6□□□□□ -0.39
APC9Q12107 TRM9YML014W 840 nt12.6□□□□□ -0.39
APC9Q12107 PTP1YDL230W 1008 nt12.58□□□□□ -0.4
APC9Q12107 HOM6YJR139C 1080 nt12.58□□□□□ -0.4
APC9Q12107 YGR021WYGR021W 873 nt12.55□□□□□ -0.4
APC9Q12107 CCT6YDR188W 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
APC9Q12107 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.54□□□□□ -0.4
APC9Q12107 BDF1YLR399C 2061 nt12.53□□□□□ -0.4
APC9Q12107 EMI2YDR516C 1503 nt12.52□□□□□ -0.4
APC9Q12107 ALF1YNL148C 765 nt12.52□□□□□ -0.41
APC9Q12107 CAC2YML102W 1407 nt12.52□□□□□ -0.41
APC9Q12107 MNP1YGL068W 585 nt12.49□□□□□ -0.41
APC9Q12107 RPP2AYOL039W 321 nt12.49□□□□□ -0.41
APC9Q12107 YKL097CYKL097C 411 nt12.47□□□□□ -0.41
APC9Q12107 SIS1YNL007C 1059 nt12.45□□□□□ -0.42
APC9Q12107 YBR220CYBR220C 1683 nt12.42□□□□□ -0.42
APC9Q12107 YDL221WYDL221W 552 nt12.41□□□□□ -0.42
APC9Q12107 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.37□□□□□ -0.43
APC9Q12107 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.37□□□□□ -0.43
APC9Q12107 RKM5YLR137W 1104 nt12.37□□□□□ -0.43
APC9Q12107 TAT1YBR069C 1860 nt12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms