RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C NMA111P53920 997 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C NUP100Q02629 959 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C STP3Q05937 343 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ESC2Q06340 456 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YOL036WQ08206 761 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C WSC3Q12215 556 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SEC39Q12745 709 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YSR3P23501 404 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ROX1P25042 368 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RAD57P25301 460 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C UTR2P32623 467 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C TCD1P38756 429 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CEM1P39525 442 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RGI2P40188 164 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SSU1P41930 458 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C EFM6P53970 246 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RSM10Q03201 203 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CCE1Q03702 353 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C EMI1Q04406 187 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C VPS38Q05919 439 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C BUD7Q08754 746 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C AVL9Q12500 764 aa6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CPA1P07258 411 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C TFC3P34111 1160 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C GND1P38720 489 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C PCL5P38794 229 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SMF1P38925 575 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CKB2P38930 258 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C EFM4P40516 257 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ERF2Q06551 359 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C BSC6Q08280 497 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C APL4Q12028 832 aa6.95□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C VAN1P23642 535 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CDC13P32797 924 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ARA1P38115 344 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C LDB7P38210 180 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C DED81P38707 554 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C END3P39013 349 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CFD1P40558 293 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ALF1P53904 254 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C DIC1Q06143 298 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YOL073CQ08232 322 aa6.94□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C TSR4P25040 408 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MSH1P25846 959 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IME4P41833 600 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YJL107CP42947 387 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ZRG17P53735 605 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C NOP15P53927 220 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CTR9P89105 1077 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.93□□□□□ -1.3not detected
SPE3YPR069C ARX1Q03862 593 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C BLS1Q06071 122 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ADY3Q07732 790 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C HOS1Q12214 470 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YDR262WQ12331 272 aa6.93□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ERR1P0CX10 437 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ERR2P0CX11 437 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SEC15P22224 910 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C VPS34P22543 875 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MRPL9P31334 269 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C NDI1P32340 513 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C TAF14P35189 244 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YEL073CP39974 107 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C DPH1P40487 425 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IRR1P40541 1150 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C GTS1P40956 396 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ERR3P42222 437 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C NUT2Q06213 157 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C PFA4Q12006 378 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C FRE7Q12333 620 aa6.92□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MDM35O60200 86 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SEM1O94742 89 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C QCR6P00127 147 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C SMI1P32566 505 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C STB6P36085 766 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YMR134WP40207 237 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C ALG8P40351 577 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C RCO1Q04779 684 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C MPC54Q08550 464 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C GUP2Q08929 609 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C GTT2Q12390 233 aa6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CMR1Q12510 522 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C YBR056W-AI2HB52 66 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IMA3P0CW40 589 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C IMA4P0CW41 589 aa6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SPE3YPR069C CKI1P20485 582 aa6.9□□□□□ -1.3
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