Protein–RNA interactions for Protein: P42947

YJL107C, Uncharacterized UPF0442 protein YJL107C, yeastyeast

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL107CP42947 NSR1YGR159C 1245 nt20.38■□□□□ 0.85
YJL107CP42947 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.31■□□□□ 0.84
YJL107CP42947 NOP1YDL014W 984 nt19.67■□□□□ 0.74
YJL107CP42947 MDJ1YFL016C 1536 nt18.54■□□□□ 0.56
YJL107CP42947 YKL036CYKL036C 393 nt18.19■□□□□ 0.5
YJL107CP42947 Q0297Q0297 156 nt17.19■□□□□ 0.34
YJL107CP42947 SRX1YKL086W 384 nt17.14■□□□□ 0.33
YJL107CP42947 YJL027CYJL027C 417 nt17.01■□□□□ 0.31
YJL107CP42947 SCS3YGL126W 1143 nt16.55■□□□□ 0.24
YJL107CP42947 YCR051WYCR051W 669 nt16.29■□□□□ 0.2
YJL107CP42947 DBP2YNL112W 1641 nt16.24■□□□□ 0.19
YJL107CP42947 YBR190WYBR190W 312 nt15.79■□□□□ 0.12
YJL107CP42947 YOL085CYOL085C 342 nt15.72■□□□□ 0.11
YJL107CP42947 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.64■□□□□ 0.09
YJL107CP42947 CCC1YLR220W 969 nt15.58■□□□□ 0.08
YJL107CP42947 RTC3YHR087W 336 nt15.5■□□□□ 0.07
YJL107CP42947 PKP1YIL042C 1185 nt15.47■□□□□ 0.07
YJL107CP42947 RPP1BYDL130W 321 nt15.43■□□□□ 0.06
YJL107CP42947 RVS167YDR388W 1449 nt15.1■□□□□ 0.01
YJL107CP42947 SCJ1YMR214W 1134 nt15.07■□□□□ 0
YJL107CP42947 ATS1YAL020C 1002 nt14.84□□□□□ -0.03
YJL107CP42947 PET122YER153C 765 nt14.71□□□□□ -0.05
YJL107CP42947 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.7□□□□□ -0.06
YJL107CP42947 PUT4YOR348C 1884 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL107CP42947 SCR1SCR1 522 nt14.65□□□□□ -0.06
YJL107CP42947 SSA3YBL075C 1950 nt14.59□□□□□ -0.07
YJL107CP42947 SHR5YOL110W 714 nt14.52□□□□□ -0.09
YJL107CP42947 URN1YPR152C 1398 nt14.37□□□□□ -0.11
YJL107CP42947 DEP1YAL013W 1218 nt14.34□□□□□ -0.11
YJL107CP42947 ARE1YCR048W 1833 nt14.31□□□□□ -0.12
YJL107CP42947 RRN5YLR141W 1092 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL107CP42947 SAH1YER043C 1350 nt14.26□□□□□ -0.13
YJL107CP42947 POA1YBR022W 534 nt14.2□□□□□ -0.14
YJL107CP42947 OPI9YLR338W 858 nt14.19□□□□□ -0.14
YJL107CP42947 YDJ1YNL064C 1230 nt14.17□□□□□ -0.14
YJL107CP42947 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.12□□□□□ -0.15
YJL107CP42947 RSB1YOR049C 1065 nt14.07□□□□□ -0.16
YJL107CP42947 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.02□□□□□ -0.17
YJL107CP42947 GAR1YHR089C 618 nt14□□□□□ -0.17
YJL107CP42947 RPN10YHR200W 807 nt13.99□□□□□ -0.17
YJL107CP42947 YNL208WYNL208W 600 nt13.96□□□□□ -0.17
YJL107CP42947 BSC6YOL137W 1494 nt13.93□□□□□ -0.18
YJL107CP42947 BUD23YCR047C 828 nt13.79□□□□□ -0.2
YJL107CP42947 PUN1YLR414C 792 nt13.74□□□□□ -0.21
YJL107CP42947 PTC2YER089C 1395 nt13.71□□□□□ -0.21
YJL107CP42947 PST2YDR032C 597 nt13.71□□□□□ -0.21
YJL107CP42947 YJR018WYJR018W 363 nt13.67□□□□□ -0.22
YJL107CP42947 SPT5YML010W 3192 nt13.61□□□□□ -0.23
YJL107CP42947 NAB2YGL122C 1578 nt13.54□□□□□ -0.24
YJL107CP42947 TIR1YER011W 765 nt13.52□□□□□ -0.25
YJL107CP42947 SSA1YAL005C 1929 nt13.47□□□□□ -0.25
YJL107CP42947 YJR120WYJR120W 351 nt13.43□□□□□ -0.26
YJL107CP42947 FIS1YIL065C 468 nt13.35□□□□□ -0.27
YJL107CP42947 FPR4YLR449W 1179 nt13.33□□□□□ -0.28
YJL107CP42947 DAL1YIR027C 1383 nt13.31□□□□□ -0.28
YJL107CP42947 YKL097CYKL097C 411 nt13.27□□□□□ -0.29
YJL107CP42947 RPP2BYDR382W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
YJL107CP42947 SRB2YHR041C 633 nt13.25□□□□□ -0.29
YJL107CP42947 SSA4YER103W 1929 nt13.2□□□□□ -0.3
YJL107CP42947 PHO4YFR034C 939 nt13.2□□□□□ -0.3
YJL107CP42947 INM2YDR287W 879 nt13.17□□□□□ -0.3
YJL107CP42947 SHU1YHL006C 453 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL107CP42947 MEP2YNL142W 1500 nt13.09□□□□□ -0.31
YJL107CP42947 YPS1YLR120C 1710 nt13.05□□□□□ -0.32
YJL107CP42947 YBL100CYBL100C 315 nt13.05□□□□□ -0.32
YJL107CP42947 BDH2YAL061W 1254 nt12.96□□□□□ -0.33
YJL107CP42947 DCW1YKL046C 1350 nt12.95□□□□□ -0.34
YJL107CP42947 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.94□□□□□ -0.34
YJL107CP42947 WWM1YFL010C 636 nt12.92□□□□□ -0.34
YJL107CP42947 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.9□□□□□ -0.34
YJL107CP42947 YDR095CYDR095C 411 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL107CP42947 FUN26YAL022C 1554 nt12.89□□□□□ -0.35
YJL107CP42947 BDF1YLR399C 2061 nt12.79□□□□□ -0.36
YJL107CP42947 YGR021WYGR021W 873 nt12.78□□□□□ -0.36
YJL107CP42947 TRM9YML014W 840 nt12.78□□□□□ -0.36
YJL107CP42947 ALF1YNL148C 765 nt12.75□□□□□ -0.37
YJL107CP42947 EMI2YDR516C 1503 nt12.72□□□□□ -0.37
YJL107CP42947 PTP1YDL230W 1008 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 LSM3YLR438C-A 270 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 CAC2YML102W 1407 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 HOM6YJR139C 1080 nt12.68□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 RPP2AYOL039W 321 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 CCT6YDR188W 1641 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 YOR139CYOR139C 393 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL107CP42947 MNP1YGL068W 585 nt12.62□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 NPL3YDR432W 1245 nt12.61□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.61□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 YBR220CYBR220C 1683 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 YDL221WYDL221W 552 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 YMR090WYMR090W 684 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 TAT1YBR069C 1860 nt12.59□□□□□ -0.39
YJL107CP42947 SIS1YNL007C 1059 nt12.56□□□□□ -0.4
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