RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	IRC13	Q08630	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	ATG29	Q12092	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	ABF1	P14164	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	SYN8	P31377	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	CCL1	P37366	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	ERC1	P38767	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	AFG3	P39925	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	SAE2	P46946	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	CTK2	P46962	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	MSE1	P48525	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	VID30	P53076	958 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	RIA1	P53893	1110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	CRN1	Q06440	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	FMP45	Q07651	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	MLH3	Q12083	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	BAG7	Q12128	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	NFI1	Q12216	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	AVL9	Q12500	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	AFI1	Q99222	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0B	YLR048W	STF1	P01098	86 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CPR2	P23285	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	VMA16	P23968	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
RPS0B	YLR048W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CTR1	P49573	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YAT1	P80235	687 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ROY1	Q04847	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FRE6	Q12473	712 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	GAL80	P04387	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CNE1	P27825	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ERV1	P27882	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SIP1	P32578	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	PMT1	P33775	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CMC1	P36064	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FMP52	P40008	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YJL163C	P46996	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	PET130	P47065	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TCB2	P48231	1178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TWF1	P53250	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	DIP5	P53388	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	EOS1	P53938	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	BOP3	P53958	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CTF4	Q01454	927 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RSF1	Q05043	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	GPM3	Q12326	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	HSP42	Q12329	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SKS1	Q12505	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	DFG16	Q99234	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ISN1	Q99312	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	COX1	P00401	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TFB1	P32776	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MRE11	P32829	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	LST4	P34239	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	APL3	P38065	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	BUR6	P40096	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MAF1	P41910	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SWP82	P43554	623 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	IRC8	P47046	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	UBX6	P47049	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YIP4	P53093	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CUL3	P53202	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YGR151C	P53287	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SNF12	P53628	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	BUD17	P53727	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SEC5	P89102	971 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MAK10	Q02197	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	UFO1	Q04511	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TGS1	Q12052	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RKI1	Q12189	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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