RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W DAS2Q12084 232 aa8.98□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W RAD10P06838 210 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W PDC5P16467 563 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W MSH1P25846 959 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W FAU1P40099 211 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W IRR1P40541 1150 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ALK1P43633 760 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W ALY2P47029 1046 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W EFM6P53970 246 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W VID22Q05934 901 aa8.97□□□□□ -0.97
CPD1YGR247W YSR3P23501 404 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W VAN1P23642 535 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NTH1P32356 751 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HOG1P32485 435 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W UTR2P32623 467 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SPG5P42933 373 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YJL107CP42947 387 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W STR2P47164 639 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HST3P53687 447 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NMA111P53920 997 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RCO1Q04779 684 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PFA4Q12006 378 aa8.96□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YLR462WO13556 202 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SEM1O94742 89 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PET309P32522 965 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W CYM1P32898 989 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W EMC3P36039 253 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YHL049CP38722 271 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YEL073CP39974 107 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YFL064CP43540 174 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W TY4A-JP47023 414 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PMT3P47190 753 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W KAP114P53067 1004 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YPR148CQ06523 435 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W GLE1Q12315 538 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W GPR1Q12361 961 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YBL111CQ3E7Y5 667 aa8.95□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MEC1P38111 2368 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MDM35O60200 86 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NDI1P32340 513 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W DOM34P33309 386 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SQT1P35184 431 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LDB7P38210 180 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W GND1P38720 489 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W CKB2P38930 258 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W IME4P41833 600 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HLJ1P48353 224 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ZRG17P53735 605 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ARP4P80428 489 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YOL024WQ08172 172 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W PNS1Q12412 539 aa8.94□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W VPS34P22543 875 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YCR006CP25350 157 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LDB16P25587 256 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MRPL9P31334 269 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HXT1P32465 570 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SKN1P33336 771 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MIC60P36112 540 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ARL1P38116 183 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RKM3P38222 552 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YHR033WP38690 423 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data8.93□□□□□ -0.98not detected
CPD1YGR247W LRO1P40345 661 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.93□□□□□ -0.98 RIP-Chip
CPD1YGR247W TRS23Q03784 219 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ADY3Q07732 790 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YLR030WQ07967 263 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W GTT2Q12390 233 aa8.93□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W IPP1P00817 287 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W STB6P36085 766 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LSM5P40089 93 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W GTS1P40956 396 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RIM21P48565 533 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YPR003CP53394 754 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W ARE2P53629 642 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RRN11Q04712 507 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W SOV1Q04748 898 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W BLS1Q06071 122 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W HOS1Q12214 470 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W LDB17Q12342 491 aa8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MVD1P32377 396 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data8.91□□□□□ -0.98not detected
CPD1YGR247W SRP101P32916 621 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RIM101P33400 625 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W YBP1P38315 674 aa8.91□□□□□ -0.98
CPD1YGR247W RCK2P38623 610 aa8.91□□□□□ -0.98
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