RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	CIN1	P40987	1014 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	NMD5	P46970	1048 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	MSY1	P48527	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	ASE1	P50275	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TRM8	Q12009	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	CNS1	P33313	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YPT53	P36019	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	ERV46	P39727	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SNO3	P43544	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YML122C	Q03207	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SSP2	Q08646	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	TMA16	Q08687	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	XBP1	P40489	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	RSC9	Q03124	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	THI3	Q07471	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	PCT1	P13259	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	MDM10	P18409	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YSP3	P25036	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	AXL2	P38928	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	PHM8	P40025	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	LTP1	P40347	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	REG1	Q00816	1014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	SWA2	Q06677	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPO20	YMR017W	YER010C	P40011	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	RIC1	P40395	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	IRC7	P43623	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YPR003C	P53394	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YLR302C	O13544	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SSH4	P32343	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	RRN3	P36070	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ORC5	P50874	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	COQ3	P27680	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	MSS51	P32335	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	TFC3	P34111	1160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PSD1	P39006	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ASG1	P40467	964 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	CDC1	P40986	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	CRN1	Q06440	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ERG8	P24521	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PTP1	P25044	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	RER1	P25560	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SRB5	P32585	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	VPS4	P52917	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	FCP1	Q03254	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SNO4	Q04902	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	HSP32	Q08992	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PFA4	Q12006	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	CRC1	Q12289	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	TOP1	P04786	769 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	MRP20	P32387	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	CBF2	P32504	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	UBP13	P38187	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	SWP82	P43554	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	NET1	P47035	1189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	STP1	Q00947	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	RCO1	Q04779	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	OPY2	Q06810	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	OCT1	P35999	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	LHS1	P36016	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	ARN1	P38731	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YIL024C	P40543	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YJL107C	P42947	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	MEP3	P53390	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YNR061C	P53747	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	CBK1	P53894	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	PDR8	Q06149	701 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	NUS1	Q12063	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPO20	YMR017W	GAL4	P04386	881 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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