Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.67■□□□□ 0.74
PTP1P25044 NSR1YGR159C 1245 nt19.41■□□□□ 0.7
PTP1P25044 NOP1YDL014W 984 nt19.25■□□□□ 0.67
PTP1P25044 YKL036CYKL036C 393 nt17.89■□□□□ 0.45
PTP1P25044 MDJ1YFL016C 1536 nt17.01■□□□□ 0.31
PTP1P25044 Q0297Q0297 156 nt16.86■□□□□ 0.29
PTP1P25044 SRX1YKL086W 384 nt16.78■□□□□ 0.28
PTP1P25044 YJL027CYJL027C 417 nt16.73■□□□□ 0.27
PTP1P25044 SCS3YGL126W 1143 nt16.33■□□□□ 0.2
PTP1P25044 YCR051WYCR051W 669 nt15.93■□□□□ 0.14
PTP1P25044 YOL085CYOL085C 342 nt15.45■□□□□ 0.06
PTP1P25044 PKP1YIL042C 1185 nt15.17■□□□□ 0.02
PTP1P25044 RPP1BYDL130W 321 nt15.13■□□□□ 0.01
PTP1P25044 SCJ1YMR214W 1134 nt15.11■□□□□ 0.01
PTP1P25044 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
PTP1P25044 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.05■□□□□ -0
PTP1P25044 CCC1YLR220W 969 nt14.89□□□□□ -0.03
PTP1P25044 ATS1YAL020C 1002 nt14.66□□□□□ -0.06
PTP1P25044 YBR190WYBR190W 312 nt14.51□□□□□ -0.09
PTP1P25044 PET122YER153C 765 nt14.4□□□□□ -0.1
PTP1P25044 SCR1SCR1 522 nt14.38□□□□□ -0.11
PTP1P25044 RVS167YDR388W 1449 nt14.36□□□□□ -0.11
PTP1P25044 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.3□□□□□ -0.12
PTP1P25044 RTC3YHR087W 336 nt14.2□□□□□ -0.14
PTP1P25044 RRN5YLR141W 1092 nt14.01□□□□□ -0.17
PTP1P25044 SHR5YOL110W 714 nt13.87□□□□□ -0.19
PTP1P25044 YDJ1YNL064C 1230 nt13.85□□□□□ -0.19
PTP1P25044 RSB1YOR049C 1065 nt13.81□□□□□ -0.2
PTP1P25044 SSA3YBL075C 1950 nt13.79□□□□□ -0.2
PTP1P25044 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.74□□□□□ -0.21
PTP1P25044 PST2YDR032C 597 nt13.53□□□□□ -0.24
PTP1P25044 GAR1YHR089C 618 nt13.49□□□□□ -0.25
PTP1P25044 DEP1YAL013W 1218 nt13.35□□□□□ -0.27
PTP1P25044 URN1YPR152C 1398 nt13.34□□□□□ -0.27
PTP1P25044 RPN10YHR200W 807 nt13.26□□□□□ -0.29
PTP1P25044 YNL208WYNL208W 600 nt13.23□□□□□ -0.29
PTP1P25044 YKL097CYKL097C 411 nt13.22□□□□□ -0.29
PTP1P25044 OPI9YLR338W 858 nt13.11□□□□□ -0.31
PTP1P25044 TIR1YER011W 765 nt13.04□□□□□ -0.32
PTP1P25044 PUT4YOR348C 1884 nt12.99□□□□□ -0.33
PTP1P25044 SAH1YER043C 1350 nt12.95□□□□□ -0.34
PTP1P25044 SHU1YHL006C 453 nt12.93□□□□□ -0.34
PTP1P25044 ARE1YCR048W 1833 nt12.81□□□□□ -0.36
PTP1P25044 SSA1YAL005C 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
PTP1P25044 PUN1YLR414C 792 nt12.78□□□□□ -0.36
PTP1P25044 YJR018WYJR018W 363 nt12.75□□□□□ -0.37
PTP1P25044 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.66□□□□□ -0.38
PTP1P25044 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.65□□□□□ -0.38
PTP1P25044 RPP2BYDR382W 333 nt12.6□□□□□ -0.39
PTP1P25044 POA1YBR022W 534 nt12.6□□□□□ -0.39
PTP1P25044 SRB2YHR041C 633 nt12.55□□□□□ -0.4
PTP1P25044 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
PTP1P25044 YGR021WYGR021W 873 nt12.53□□□□□ -0.4
PTP1P25044 YJR120WYJR120W 351 nt12.51□□□□□ -0.41
PTP1P25044 YOR139CYOR139C 393 nt12.5□□□□□ -0.41
PTP1P25044 WWM1YFL010C 636 nt12.46□□□□□ -0.41
PTP1P25044 NPL3YDR432W 1245 nt12.45□□□□□ -0.42
PTP1P25044 HOM6YJR139C 1080 nt12.43□□□□□ -0.42
PTP1P25044 BUD23YCR047C 828 nt12.4□□□□□ -0.42
PTP1P25044 NAB2YGL122C 1578 nt12.38□□□□□ -0.43
PTP1P25044 MNP1YGL068W 585 nt12.37□□□□□ -0.43
PTP1P25044 BDH2YAL061W 1254 nt12.33□□□□□ -0.44
PTP1P25044 YOL037CYOL037C 354 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP1P25044 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.31□□□□□ -0.44
PTP1P25044 INM2YDR287W 879 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP1P25044 BSC6YOL137W 1494 nt12.29□□□□□ -0.44
PTP1P25044 RKM5YLR137W 1104 nt12.26□□□□□ -0.45
PTP1P25044 DAL1YIR027C 1383 nt12.25□□□□□ -0.45
PTP1P25044 LSM3YLR438C-A 270 nt12.22□□□□□ -0.45
PTP1P25044 FPR4YLR449W 1179 nt12.22□□□□□ -0.45
PTP1P25044 YBL100CYBL100C 315 nt12.19□□□□□ -0.46
PTP1P25044 FIS1YIL065C 468 nt12.18□□□□□ -0.46
PTP1P25044 PHO4YFR034C 939 nt12.11□□□□□ -0.47
PTP1P25044 TRM9YML014W 840 nt12.08□□□□□ -0.48
PTP1P25044 FUN26YAL022C 1554 nt12.04□□□□□ -0.48
PTP1P25044 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.02□□□□□ -0.49
PTP1P25044 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.02□□□□□ -0.49
PTP1P25044 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.02□□□□□ -0.49
PTP1P25044 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.02□□□□□ -0.49
PTP1P25044 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.02□□□□□ -0.49
PTP1P25044 YLR281CYLR281C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
PTP1P25044 CCT6YDR188W 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
PTP1P25044 PUS2YGL063W 1113 nt11.9□□□□□ -0.5
PTP1P25044 WHI5YOR083W 888 nt11.9□□□□□ -0.5
PTP1P25044 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.88□□□□□ -0.51
PTP1P25044 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.88□□□□□ -0.51
PTP1P25044 ALF1YNL148C 765 nt11.88□□□□□ -0.51
PTP1P25044 PAC11YDR488C 1602 nt11.84□□□□□ -0.51
PTP1P25044 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
PTP1P25044 YDR095CYDR095C 411 nt11.77□□□□□ -0.53
PTP1P25044 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.77□□□□□ -0.53
PTP1P25044 MOT3YMR070W 1473 nt11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms