Protein–RNA interactions for Protein: Q12289

CRC1, Mitochondrial carnitine carrier, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CRC1Q12289 NSR1YGR159C 1245 nt14.79□□□□□ -0.04
CRC1Q12289 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.74□□□□□ -0.05
CRC1Q12289 NOP1YDL014W 984 nt14.37□□□□□ -0.11
CRC1Q12289 MDJ1YFL016C 1536 nt13.13□□□□□ -0.31
CRC1Q12289 YKL036CYKL036C 393 nt13.13□□□□□ -0.31
CRC1Q12289 SRX1YKL086W 384 nt12.52□□□□□ -0.41
CRC1Q12289 Q0297Q0297 156 nt12.51□□□□□ -0.41
CRC1Q12289 YJL027CYJL027C 417 nt12.23□□□□□ -0.45
CRC1Q12289 SCS3YGL126W 1143 nt11.87□□□□□ -0.51
CRC1Q12289 YCR051WYCR051W 669 nt11.84□□□□□ -0.51
CRC1Q12289 DBP2YNL112W 1641 nt11.57□□□□□ -0.56
CRC1Q12289 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.36□□□□□ -0.59
CRC1Q12289 YOL085CYOL085C 342 nt11.33□□□□□ -0.6
CRC1Q12289 YBR190WYBR190W 312 nt11.31□□□□□ -0.6
CRC1Q12289 RPP1BYDL130W 321 nt11.22□□□□□ -0.61
CRC1Q12289 CCC1YLR220W 969 nt11.19□□□□□ -0.62
CRC1Q12289 PKP1YIL042C 1185 nt11.12□□□□□ -0.63
CRC1Q12289 RTC3YHR087W 336 nt11.01□□□□□ -0.65
CRC1Q12289 RVS167YDR388W 1449 nt10.98□□□□□ -0.65
CRC1Q12289 SCJ1YMR214W 1134 nt10.78□□□□□ -0.68
CRC1Q12289 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.71□□□□□ -0.69
CRC1Q12289 PET122YER153C 765 nt10.69□□□□□ -0.7
CRC1Q12289 SCR1SCR1 522 nt10.63□□□□□ -0.71
CRC1Q12289 ATS1YAL020C 1002 nt10.62□□□□□ -0.71
CRC1Q12289 SSA3YBL075C 1950 nt10.55□□□□□ -0.72
CRC1Q12289 SHR5YOL110W 714 nt10.54□□□□□ -0.72
CRC1Q12289 YDJ1YNL064C 1230 nt10.4□□□□□ -0.74
CRC1Q12289 RRN5YLR141W 1092 nt10.37□□□□□ -0.75
CRC1Q12289 PUT4YOR348C 1884 nt10.27□□□□□ -0.76
CRC1Q12289 URN1YPR152C 1398 nt10.27□□□□□ -0.76
CRC1Q12289 Q0182Q0182 405 nt10.25□□□□□ -0.77
CRC1Q12289 RPN10YHR200W 807 nt10.19□□□□□ -0.78
CRC1Q12289 DEP1YAL013W 1218 nt10.18□□□□□ -0.78
CRC1Q12289 OPI9YLR338W 858 nt10.17□□□□□ -0.78
CRC1Q12289 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.16□□□□□ -0.78
CRC1Q12289 RSB1YOR049C 1065 nt10.14□□□□□ -0.79
CRC1Q12289 GAR1YHR089C 618 nt10.12□□□□□ -0.79
CRC1Q12289 YNL208WYNL208W 600 nt10.11□□□□□ -0.79
CRC1Q12289 SAH1YER043C 1350 nt10.07□□□□□ -0.8
CRC1Q12289 ARE1YCR048W 1833 nt10.05□□□□□ -0.8
CRC1Q12289 MOT3YMR070W 1473 nt9.96□□□□□ -0.82
CRC1Q12289 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.95□□□□□ -0.82
CRC1Q12289 POA1YBR022W 534 nt9.94□□□□□ -0.82
CRC1Q12289 PUN1YLR414C 792 nt9.91□□□□□ -0.82
CRC1Q12289 PST2YDR032C 597 nt9.83□□□□□ -0.84
CRC1Q12289 TIR1YER011W 765 nt9.81□□□□□ -0.84
CRC1Q12289 YJR018WYJR018W 363 nt9.81□□□□□ -0.84
CRC1Q12289 BSC6YOL137W 1494 nt9.76□□□□□ -0.85
CRC1Q12289 PTC2YER089C 1395 nt9.73□□□□□ -0.85
CRC1Q12289 BUD23YCR047C 828 nt9.7□□□□□ -0.86
CRC1Q12289 NAB2YGL122C 1578 nt9.67□□□□□ -0.86
CRC1Q12289 SSA1YAL005C 1929 nt9.66□□□□□ -0.86
CRC1Q12289 RPP2BYDR382W 333 nt9.64□□□□□ -0.87
CRC1Q12289 YJR120WYJR120W 351 nt9.57□□□□□ -0.88
CRC1Q12289 DAL1YIR027C 1383 nt9.51□□□□□ -0.89
CRC1Q12289 INM2YDR287W 879 nt9.51□□□□□ -0.89
CRC1Q12289 FIS1YIL065C 468 nt9.48□□□□□ -0.89
CRC1Q12289 YKL097CYKL097C 411 nt9.48□□□□□ -0.89
CRC1Q12289 FPR4YLR449W 1179 nt9.44□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 SHU1YHL006C 453 nt9.41□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 SRB2YHR041C 633 nt9.41□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 SPT5YML010W 3192 nt9.41□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 PHO4YFR034C 939 nt9.4□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 BDH2YAL061W 1254 nt9.4□□□□□ -0.9
CRC1Q12289 YBL100CYBL100C 315 nt9.37□□□□□ -0.91
CRC1Q12289 YGR021WYGR021W 873 nt9.34□□□□□ -0.91
CRC1Q12289 WWM1YFL010C 636 nt9.32□□□□□ -0.92
CRC1Q12289 LSM3YLR438C-A 270 nt9.29□□□□□ -0.92
CRC1Q12289 YPS1YLR120C 1710 nt9.25□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.25□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 HOM6YJR139C 1080 nt9.24□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.24□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 TRM9YML014W 840 nt9.24□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 FUN26YAL022C 1554 nt9.24□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 SSA4YER103W 1929 nt9.23□□□□□ -0.93
CRC1Q12289 YDR095CYDR095C 411 nt9.2□□□□□ -0.94
CRC1Q12289 MEP2YNL142W 1500 nt9.19□□□□□ -0.94
CRC1Q12289 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.17□□□□□ -0.94
CRC1Q12289 ALF1YNL148C 765 nt9.17□□□□□ -0.94
CRC1Q12289 CCT6YDR188W 1641 nt9.14□□□□□ -0.95
CRC1Q12289 MNP1YGL068W 585 nt9.13□□□□□ -0.95
CRC1Q12289 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.13□□□□□ -0.95
CRC1Q12289 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.13□□□□□ -0.95
CRC1Q12289 RKM5YLR137W 1104 nt9.11□□□□□ -0.95
CRC1Q12289 YOL037CYOL037C 354 nt9.07□□□□□ -0.96
CRC1Q12289 NPL3YDR432W 1245 nt9.04□□□□□ -0.96
CRC1Q12289 YJL225CYJL225C 5277 nt9.03□□□□□ -0.96
CRC1Q12289 RPP2AYOL039W 321 nt9.03□□□□□ -0.96
CRC1Q12289 SIS1YNL007C 1059 nt9.01□□□□□ -0.97
CRC1Q12289 YOR139CYOR139C 393 nt9.01□□□□□ -0.97
CRC1Q12289 PAC11YDR488C 1602 nt8.98□□□□□ -0.97
CRC1Q12289 DCW1YKL046C 1350 nt8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms