Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.14■□□□□ 0.49
XBP1P40489 NSR1YGR159C 1245 nt17.84■□□□□ 0.45
XBP1P40489 NOP1YDL014W 984 nt17.8■□□□□ 0.44
XBP1P40489 YKL036CYKL036C 393 nt16.59■□□□□ 0.25
XBP1P40489 Q0297Q0297 156 nt15.59■□□□□ 0.09
XBP1P40489 MDJ1YFL016C 1536 nt15.55■□□□□ 0.08
XBP1P40489 YJL027CYJL027C 417 nt15.53■□□□□ 0.08
XBP1P40489 SRX1YKL086W 384 nt15.5■□□□□ 0.07
XBP1P40489 SCS3YGL126W 1143 nt15.17■□□□□ 0.02
XBP1P40489 YCR051WYCR051W 669 nt14.73□□□□□ -0.05
XBP1P40489 YOL085CYOL085C 342 nt14.32□□□□□ -0.12
XBP1P40489 PKP1YIL042C 1185 nt14.05□□□□□ -0.16
XBP1P40489 RPP1BYDL130W 321 nt14□□□□□ -0.17
XBP1P40489 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
XBP1P40489 DBP2YNL112W 1641 nt13.82□□□□□ -0.2
XBP1P40489 SCJ1YMR214W 1134 nt13.81□□□□□ -0.2
XBP1P40489 CCC1YLR220W 969 nt13.72□□□□□ -0.21
XBP1P40489 ATS1YAL020C 1002 nt13.64□□□□□ -0.23
XBP1P40489 SCR1SCR1 522 nt13.32□□□□□ -0.28
XBP1P40489 PET122YER153C 765 nt13.3□□□□□ -0.28
XBP1P40489 YBR190WYBR190W 312 nt13.26□□□□□ -0.29
XBP1P40489 RVS167YDR388W 1449 nt13.2□□□□□ -0.3
XBP1P40489 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.19□□□□□ -0.3
XBP1P40489 RTC3YHR087W 336 nt12.99□□□□□ -0.33
XBP1P40489 RRN5YLR141W 1092 nt12.95□□□□□ -0.34
XBP1P40489 RSB1YOR049C 1065 nt12.8□□□□□ -0.36
XBP1P40489 YDJ1YNL064C 1230 nt12.79□□□□□ -0.36
XBP1P40489 SHR5YOL110W 714 nt12.74□□□□□ -0.37
XBP1P40489 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.7□□□□□ -0.38
XBP1P40489 PST2YDR032C 597 nt12.58□□□□□ -0.4
XBP1P40489 SSA3YBL075C 1950 nt12.49□□□□□ -0.41
XBP1P40489 GAR1YHR089C 618 nt12.43□□□□□ -0.42
XBP1P40489 PUT4YOR348C 1884 nt12.3□□□□□ -0.44
XBP1P40489 YKL097CYKL097C 411 nt12.26□□□□□ -0.45
XBP1P40489 DEP1YAL013W 1218 nt12.25□□□□□ -0.45
XBP1P40489 URN1YPR152C 1398 nt12.22□□□□□ -0.45
XBP1P40489 RPN10YHR200W 807 nt12.19□□□□□ -0.46
XBP1P40489 YNL208WYNL208W 600 nt12.15□□□□□ -0.46
XBP1P40489 TIR1YER011W 765 nt12.01□□□□□ -0.49
XBP1P40489 OPI9YLR338W 858 nt12.01□□□□□ -0.49
XBP1P40489 SHU1YHL006C 453 nt12□□□□□ -0.49
XBP1P40489 ARE1YCR048W 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
XBP1P40489 POA1YBR022W 534 nt11.95□□□□□ -0.5
XBP1P40489 SAH1YER043C 1350 nt11.9□□□□□ -0.5
XBP1P40489 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.85□□□□□ -0.51
XBP1P40489 SSA1YAL005C 1929 nt11.77□□□□□ -0.53
XBP1P40489 BSC6YOL137W 1494 nt11.75□□□□□ -0.53
XBP1P40489 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.72□□□□□ -0.53
XBP1P40489 PUN1YLR414C 792 nt11.7□□□□□ -0.54
XBP1P40489 YJR018WYJR018W 363 nt11.69□□□□□ -0.54
XBP1P40489 YOR139CYOR139C 393 nt11.63□□□□□ -0.55
XBP1P40489 BUD23YCR047C 828 nt11.59□□□□□ -0.55
XBP1P40489 NPL3YDR432W 1245 nt11.59□□□□□ -0.55
XBP1P40489 RPP2BYDR382W 333 nt11.58□□□□□ -0.56
XBP1P40489 YGR021WYGR021W 873 nt11.58□□□□□ -0.56
XBP1P40489 SRB2YHR041C 633 nt11.53□□□□□ -0.56
XBP1P40489 WWM1YFL010C 636 nt11.49□□□□□ -0.57
XBP1P40489 HOM6YJR139C 1080 nt11.48□□□□□ -0.57
XBP1P40489 PTC2YER089C 1395 nt11.46□□□□□ -0.57
XBP1P40489 YJR120WYJR120W 351 nt11.46□□□□□ -0.57
XBP1P40489 MNP1YGL068W 585 nt11.43□□□□□ -0.58
XBP1P40489 YOL037CYOL037C 354 nt11.43□□□□□ -0.58
XBP1P40489 SPT5YML010W 3192 nt11.38□□□□□ -0.59
XBP1P40489 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.36□□□□□ -0.59
XBP1P40489 NAB2YGL122C 1578 nt11.35□□□□□ -0.59
XBP1P40489 BDH2YAL061W 1254 nt11.33□□□□□ -0.6
XBP1P40489 RKM5YLR137W 1104 nt11.33□□□□□ -0.6
XBP1P40489 INM2YDR287W 879 nt11.28□□□□□ -0.6
XBP1P40489 SSA4YER103W 1929 nt11.26□□□□□ -0.61
XBP1P40489 LSM3YLR438C-A 270 nt11.25□□□□□ -0.61
XBP1P40489 DAL1YIR027C 1383 nt11.21□□□□□ -0.61
XBP1P40489 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
XBP1P40489 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.19□□□□□ -0.62
XBP1P40489 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.19□□□□□ -0.62
XBP1P40489 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.19□□□□□ -0.62
XBP1P40489 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.19□□□□□ -0.62
XBP1P40489 FPR4YLR449W 1179 nt11.18□□□□□ -0.62
XBP1P40489 YBL100CYBL100C 315 nt11.18□□□□□ -0.62
XBP1P40489 FIS1YIL065C 468 nt11.11□□□□□ -0.63
XBP1P40489 TRM9YML014W 840 nt11.1□□□□□ -0.63
XBP1P40489 YLR281CYLR281C 468 nt11.09□□□□□ -0.63
XBP1P40489 PHO4YFR034C 939 nt11.07□□□□□ -0.64
XBP1P40489 PUS2YGL063W 1113 nt11.06□□□□□ -0.64
XBP1P40489 MEP2YNL142W 1500 nt11.05□□□□□ -0.64
XBP1P40489 FUN26YAL022C 1554 nt11.04□□□□□ -0.64
XBP1P40489 WHI5YOR083W 888 nt11.02□□□□□ -0.65
XBP1P40489 CCT6YDR188W 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
XBP1P40489 YPS1YLR120C 1710 nt10.92□□□□□ -0.66
XBP1P40489 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.9□□□□□ -0.66
XBP1P40489 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.9□□□□□ -0.66
XBP1P40489 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.9□□□□□ -0.66
XBP1P40489 ALF1YNL148C 765 nt10.89□□□□□ -0.67
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