RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	FMO1	P38866	432 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YFL066C	P43538	392 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	FMP45	Q07651	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	BUD7	Q08754	746 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	EMC1	P25574	760 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MGM1	P32266	881 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	EFM4	P40516	257 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	BAP3	P41815	604 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	IME4	P41833	600 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	TCB2	P48231	1178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SSK2	P53599	1579 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	AI1	P03875	834 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YCR051W	P25631	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SWC3	P31376	625 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	NUP60	P39705	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	IMO32	P53219	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RSF1	Q05043	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SWT1	Q12104	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	GPM3	Q12326	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	CHD1	P32657	1468 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MMS22	Q06164	1454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	STF1	P01098	86 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	VPS34	P22543	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	VID24	P38263	362 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
TIP20	YGL145W	YJL055W	P47044	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ORC3	P54790	616 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YML037C	Q03703	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YLR122C	Q12312	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
TIP20	YGL145W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
TIP20	YGL145W	ERV1	P27882	189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	VPS62	P53285	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ERG5	P54781	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SEC5	P89102	971 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ROY1	Q04847	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	TCO89	Q08921	799 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SKS1	Q12505	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	DUS4	Q06063	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SRB5	P32585	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	FTH1	P38310	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	NAS2	P40555	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	FKH2	P41813	862 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YGR066C	P53242	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YAP6	Q03935	383 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MMR1	Q06324	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	AFI1	Q99222	893 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	KAR4	P25583	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	MRPL7	P36519	292 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YJL206C	P39529	758 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ICP55	P40051	511 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YNL058C	P53947	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	GTB1	Q04924	702 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
TIP20	YGL145W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	THI72	Q08579	599 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	CPR2	P23285	205 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	TAT1	P38085	619 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
TIP20	YGL145W	MAF1	P41910	395 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	CUL3	P53202	744 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	YGR130C	P53278	816 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	TOF1	P53840	1238 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	USA1	Q03714	838 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	ATG29	Q12092	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	HEL1	P36113	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	SIF2	P38262	535 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TIP20	YGL145W	VPS38	Q05919	439 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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