Protein–RNA interactions for Protein: P03875

AI1, Putative COX1/OXI3 intron 1 protein, yeastyeast

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AI1P03875 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.78■□□□□ 0.6
AI1P03875 NSR1YGR159C 1245 nt18.71■□□□□ 0.59
AI1P03875 NOP1YDL014W 984 nt18.32■□□□□ 0.52
AI1P03875 YKL036CYKL036C 393 nt17.07■□□□□ 0.32
AI1P03875 MDJ1YFL016C 1536 nt16.65■□□□□ 0.26
AI1P03875 Q0297Q0297 156 nt16.09■□□□□ 0.17
AI1P03875 SRX1YKL086W 384 nt15.99■□□□□ 0.15
AI1P03875 YJL027CYJL027C 417 nt15.95■□□□□ 0.14
AI1P03875 SCS3YGL126W 1143 nt15.61■□□□□ 0.09
AI1P03875 YCR051WYCR051W 669 nt15.15■□□□□ 0.02
AI1P03875 YOL085CYOL085C 342 nt14.75□□□□□ -0.05
AI1P03875 DBP2YNL112W 1641 nt14.69□□□□□ -0.06
AI1P03875 PKP1YIL042C 1185 nt14.45□□□□□ -0.1
AI1P03875 RPP1BYDL130W 321 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.42□□□□□ -0.1
AI1P03875 CCC1YLR220W 969 nt14.31□□□□□ -0.12
AI1P03875 YBR190WYBR190W 312 nt14.22□□□□□ -0.13
AI1P03875 SCJ1YMR214W 1134 nt14.18□□□□□ -0.14
AI1P03875 ATS1YAL020C 1002 nt14.02□□□□□ -0.17
AI1P03875 RTC3YHR087W 336 nt13.93□□□□□ -0.18
AI1P03875 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
AI1P03875 PET122YER153C 765 nt13.71□□□□□ -0.21
AI1P03875 SCR1SCR1 522 nt13.69□□□□□ -0.22
AI1P03875 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
AI1P03875 SSA3YBL075C 1950 nt13.4□□□□□ -0.27
AI1P03875 RRN5YLR141W 1092 nt13.34□□□□□ -0.27
AI1P03875 SHR5YOL110W 714 nt13.33□□□□□ -0.28
AI1P03875 YDJ1YNL064C 1230 nt13.2□□□□□ -0.3
AI1P03875 RSB1YOR049C 1065 nt13.14□□□□□ -0.31
AI1P03875 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.09□□□□□ -0.31
AI1P03875 URN1YPR152C 1398 nt13□□□□□ -0.33
AI1P03875 DEP1YAL013W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
AI1P03875 PST2YDR032C 597 nt12.95□□□□□ -0.34
AI1P03875 GAR1YHR089C 618 nt12.92□□□□□ -0.34
AI1P03875 PUT4YOR348C 1884 nt12.92□□□□□ -0.34
AI1P03875 RPN10YHR200W 807 nt12.81□□□□□ -0.36
AI1P03875 OPI9YLR338W 858 nt12.81□□□□□ -0.36
AI1P03875 YNL208WYNL208W 600 nt12.77□□□□□ -0.37
AI1P03875 SAH1YER043C 1350 nt12.75□□□□□ -0.37
AI1P03875 ARE1YCR048W 1833 nt12.67□□□□□ -0.38
AI1P03875 YKL097CYKL097C 411 nt12.56□□□□□ -0.4
AI1P03875 POA1YBR022W 534 nt12.55□□□□□ -0.4
AI1P03875 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.53□□□□□ -0.4
AI1P03875 TIR1YER011W 765 nt12.48□□□□□ -0.41
AI1P03875 PUN1YLR414C 792 nt12.46□□□□□ -0.41
AI1P03875 YJR018WYJR018W 363 nt12.41□□□□□ -0.42
AI1P03875 SHU1YHL006C 453 nt12.35□□□□□ -0.43
AI1P03875 YGR139WYGR139W 339 nt12.34□□□□□ -0.43
AI1P03875 SSA1YAL005C 1929 nt12.33□□□□□ -0.44
AI1P03875 PTC2YER089C 1395 nt12.3□□□□□ -0.44
AI1P03875 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.44
AI1P03875 BUD23YCR047C 828 nt12.27□□□□□ -0.45
AI1P03875 RPP2BYDR382W 333 nt12.16□□□□□ -0.46
AI1P03875 YJR120WYJR120W 351 nt12.16□□□□□ -0.46
AI1P03875 NAB2YGL122C 1578 nt12.15□□□□□ -0.46
AI1P03875 SRB2YHR041C 633 nt12.09□□□□□ -0.47
AI1P03875 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.06□□□□□ -0.48
AI1P03875 Q0182Q0182 405 nt12.04□□□□□ -0.48
AI1P03875 DAL1YIR027C 1383 nt11.98□□□□□ -0.49
AI1P03875 INM2YDR287W 879 nt11.98□□□□□ -0.49
AI1P03875 FPR4YLR449W 1179 nt11.98□□□□□ -0.49
AI1P03875 YOR139CYOR139C 393 nt11.98□□□□□ -0.49
AI1P03875 FIS1YIL065C 468 nt11.94□□□□□ -0.5
AI1P03875 YGR021WYGR021W 873 nt11.93□□□□□ -0.5
AI1P03875 WWM1YFL010C 636 nt11.92□□□□□ -0.5
AI1P03875 BDH2YAL061W 1254 nt11.89□□□□□ -0.51
AI1P03875 NPL3YDR432W 1245 nt11.88□□□□□ -0.51
AI1P03875 PHO4YFR034C 939 nt11.86□□□□□ -0.51
AI1P03875 HOM6YJR139C 1080 nt11.85□□□□□ -0.51
AI1P03875 YBL100CYBL100C 315 nt11.84□□□□□ -0.51
AI1P03875 SPT5YML010W 3192 nt11.8□□□□□ -0.52
AI1P03875 MNP1YGL068W 585 nt11.78□□□□□ -0.52
AI1P03875 YOL037CYOL037C 354 nt11.76□□□□□ -0.53
AI1P03875 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.73□□□□□ -0.53
AI1P03875 LSM3YLR438C-A 270 nt11.72□□□□□ -0.53
AI1P03875 FUN26YAL022C 1554 nt11.7□□□□□ -0.54
AI1P03875 TRM9YML014W 840 nt11.69□□□□□ -0.54
AI1P03875 RKM5YLR137W 1104 nt11.68□□□□□ -0.54
AI1P03875 SSA4YER103W 1929 nt11.68□□□□□ -0.54
AI1P03875 YPS1YLR120C 1710 nt11.64□□□□□ -0.55
AI1P03875 MOT3YMR070W 1473 nt11.58□□□□□ -0.56
AI1P03875 YDR095CYDR095C 411 nt11.57□□□□□ -0.56
AI1P03875 ALF1YNL148C 765 nt11.57□□□□□ -0.56
AI1P03875 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
AI1P03875 CCT6YDR188W 1641 nt11.54□□□□□ -0.56
AI1P03875 MEP2YNL142W 1500 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.52□□□□□ -0.57
AI1P03875 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms