Protein–RNA interactions for Protein: Q04307

RPC11, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC11Q04307 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.48■□□□□ 0.87
RPC11Q04307 NSR1YGR159C 1245 nt20.14■□□□□ 0.81
RPC11Q04307 NOP1YDL014W 984 nt19.94■□□□□ 0.78
RPC11Q04307 YKL036CYKL036C 393 nt18.66■□□□□ 0.58
RPC11Q04307 MDJ1YFL016C 1536 nt17.72■□□□□ 0.43
RPC11Q04307 Q0297Q0297 156 nt17.59■□□□□ 0.41
RPC11Q04307 SRX1YKL086W 384 nt17.48■□□□□ 0.39
RPC11Q04307 YJL027CYJL027C 417 nt17.44■□□□□ 0.38
RPC11Q04307 SCS3YGL126W 1143 nt17.14■□□□□ 0.33
RPC11Q04307 YCR051WYCR051W 669 nt16.57■□□□□ 0.24
RPC11Q04307 YOL085CYOL085C 342 nt16.18■□□□□ 0.18
RPC11Q04307 PKP1YIL042C 1185 nt15.9■□□□□ 0.14
RPC11Q04307 DBP2YNL112W 1641 nt15.81■□□□□ 0.12
RPC11Q04307 RPP1BYDL130W 321 nt15.78■□□□□ 0.12
RPC11Q04307 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.7■□□□□ 0.1
RPC11Q04307 CCC1YLR220W 969 nt15.49■□□□□ 0.07
RPC11Q04307 SCJ1YMR214W 1134 nt15.42■□□□□ 0.06
RPC11Q04307 ATS1YAL020C 1002 nt15.37■□□□□ 0.05
RPC11Q04307 PET122YER153C 765 nt15.08■□□□□ 0
RPC11Q04307 YBR190WYBR190W 312 nt15.01□□□□□ -0.01
RPC11Q04307 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.91□□□□□ -0.02
RPC11Q04307 SCR1SCR1 522 nt14.89□□□□□ -0.03
RPC11Q04307 RVS167YDR388W 1449 nt14.79□□□□□ -0.04
RPC11Q04307 RTC3YHR087W 336 nt14.64□□□□□ -0.07
RPC11Q04307 RRN5YLR141W 1092 nt14.63□□□□□ -0.07
RPC11Q04307 YDJ1YNL064C 1230 nt14.41□□□□□ -0.1
RPC11Q04307 SHR5YOL110W 714 nt14.38□□□□□ -0.11
RPC11Q04307 RSB1YOR049C 1065 nt14.38□□□□□ -0.11
RPC11Q04307 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.37□□□□□ -0.11
RPC11Q04307 PST2YDR032C 597 nt14.22□□□□□ -0.13
RPC11Q04307 GAR1YHR089C 618 nt14.04□□□□□ -0.16
RPC11Q04307 DEP1YAL013W 1218 nt13.9□□□□□ -0.18
RPC11Q04307 URN1YPR152C 1398 nt13.84□□□□□ -0.19
RPC11Q04307 YKL097CYKL097C 411 nt13.74□□□□□ -0.21
RPC11Q04307 YNL208WYNL208W 600 nt13.69□□□□□ -0.22
RPC11Q04307 RPN10YHR200W 807 nt13.63□□□□□ -0.23
RPC11Q04307 SHU1YHL006C 453 nt13.6□□□□□ -0.23
RPC11Q04307 OPI9YLR338W 858 nt13.6□□□□□ -0.23
RPC11Q04307 TIR1YER011W 765 nt13.58□□□□□ -0.24
RPC11Q04307 PUT4YOR348C 1884 nt13.5□□□□□ -0.25
RPC11Q04307 SAH1YER043C 1350 nt13.46□□□□□ -0.25
RPC11Q04307 SSA1YAL005C 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
RPC11Q04307 ARE1YCR048W 1833 nt13.34□□□□□ -0.27
RPC11Q04307 SRB2YHR041C 633 nt13.3□□□□□ -0.28
RPC11Q04307 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.3□□□□□ -0.28
RPC11Q04307 YOR139CYOR139C 393 nt13.22□□□□□ -0.29
RPC11Q04307 YJR018WYJR018W 363 nt13.2□□□□□ -0.3
RPC11Q04307 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
RPC11Q04307 YJR120WYJR120W 351 nt13.17□□□□□ -0.3
RPC11Q04307 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.14□□□□□ -0.31
RPC11Q04307 POA1YBR022W 534 nt13.06□□□□□ -0.32
RPC11Q04307 WWM1YFL010C 636 nt13.03□□□□□ -0.32
RPC11Q04307 HOM6YJR139C 1080 nt13.01□□□□□ -0.33
RPC11Q04307 MNP1YGL068W 585 nt13□□□□□ -0.33
RPC11Q04307 PTC2YER089C 1395 nt12.99□□□□□ -0.33
RPC11Q04307 YGR021WYGR021W 873 nt12.98□□□□□ -0.33
RPC11Q04307 NPL3YDR432W 1245 nt12.96□□□□□ -0.33
RPC11Q04307 RPP2BYDR382W 333 nt12.95□□□□□ -0.34
RPC11Q04307 SSA3YBL075C 1950 nt12.92□□□□□ -0.34
RPC11Q04307 YOL037CYOL037C 354 nt12.82□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 BUD23YCR047C 828 nt12.81□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 RKM5YLR137W 1104 nt12.81□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.79□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 BDH2YAL061W 1254 nt12.79□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 NAB2YGL122C 1578 nt12.78□□□□□ -0.36
RPC11Q04307 BSC6YOL137W 1494 nt12.75□□□□□ -0.37
RPC11Q04307 FIS1YIL065C 468 nt12.71□□□□□ -0.37
RPC11Q04307 DAL1YIR027C 1383 nt12.68□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 INM2YDR287W 879 nt12.67□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.66□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.66□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.66□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.66□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.66□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 LSM3YLR438C-A 270 nt12.65□□□□□ -0.38
RPC11Q04307 YBL100CYBL100C 315 nt12.63□□□□□ -0.39
RPC11Q04307 FPR4YLR449W 1179 nt12.61□□□□□ -0.39
RPC11Q04307 PHO4YFR034C 939 nt12.58□□□□□ -0.4
RPC11Q04307 YLR281CYLR281C 468 nt12.53□□□□□ -0.4
RPC11Q04307 FUN26YAL022C 1554 nt12.49□□□□□ -0.41
RPC11Q04307 PUS2YGL063W 1113 nt12.46□□□□□ -0.41
RPC11Q04307 TRM9YML014W 840 nt12.46□□□□□ -0.41
RPC11Q04307 WHI5YOR083W 888 nt12.44□□□□□ -0.42
RPC11Q04307 CCT6YDR188W 1641 nt12.39□□□□□ -0.43
RPC11Q04307 YPR011CYPR011C 981 nt12.26□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 MOT3YMR070W 1473 nt12.26□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.25□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 YPS1YLR120C 1710 nt12.25□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 YLR236CYLR236C 324 nt12.23□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 YDR095CYDR095C 411 nt12.22□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 DSK2YMR276W 1122 nt12.21□□□□□ -0.45
RPC11Q04307 ALF1YNL148C 765 nt12.21□□□□□ -0.45
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