RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TKL2	P33315	681 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RDH54	P38086	958 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	BRL1	P38770	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TVP23	P38962	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YAT2	P40017	923 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PSF2	P40359	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SYG1	P40528	902 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YJL132W	P47014	750 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	USE1	P53146	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	KTR6	P54070	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	INA17	Q02888	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ACL4	Q03771	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	AIM32	Q04689	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GRX8	Q05926	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ESC8	Q08119	714 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
KAR2	YJL034W	GPM2	Q12008	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	IES3	Q12345	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RGS2	Q99188	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RGR1	P19263	1082 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CLN1	P20437	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MSH2	P25847	964 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NDI1	P32340	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SMI1	P32566	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	UTR2	P32623	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CYM1	P32898	989 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RIM2	P38127	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PPE1	P38796	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PEX18	P38855	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	FIR1	P40020	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	IRR1	P40541	1150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MAF1	P41910	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	VTC4	P47075	721 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NCS6	P53088	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NUT1	P53114	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MRM2	P53123	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TVP15	Q03860	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CIT2	P08679	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HSF1	P10961	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
KAR2	YJL034W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MEF1	P25039	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NPP1	P25353	742 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SNT1	P25357	1226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YCL068C	P25593	260 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	VPH2	P32341	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PHA2	P32452	334 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MRPL7	P36519	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MUM2	P38236	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	FES1	P38260	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	VMA22	P38784	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	FRT2	P39734	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	AFG3	P39925	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	JEM1	P40358	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CDC1	P40986	491 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YFL012W	P43580	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GUF1	P46943	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	FMP33	P46998	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ARP9	Q05123	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HRD3	Q05787	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	CDC123	Q05791	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ATG17	Q06410	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RSC2	Q06488	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PSR1	Q07800	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PEX15	Q08215	383 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ARP7	Q12406	477 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SRF1	Q12516	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PET122	P10355	254 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	AMD2	P22580	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YIH1	P25637	258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	AIM26	P32858	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	BEM3	P32873	1128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HES1	P35843	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PHO89	P38361	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	YEL028W	P39989	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TGL3	P40308	642 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ATM1	P40416	690 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	TAF1	P46677	1066 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MAD3	P47074	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms