Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 NSR1YGR159C 1245 nt18.71■□□□□ 0.59
ATG17Q06410 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.09■□□□□ 0.49
ATG17Q06410 NOP1YDL014W 984 nt17.32■□□□□ 0.36
ATG17Q06410 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
ATG17Q06410 YJL027CYJL027C 417 nt15.96■□□□□ 0.15
ATG17Q06410 YKL036CYKL036C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
ATG17Q06410 SSA3YBL075C 1950 nt15.23■□□□□ 0.03
ATG17Q06410 SRX1YKL086W 384 nt15.09■□□□□ 0.01
ATG17Q06410 YBR190WYBR190W 312 nt15.02■□□□□ -0
ATG17Q06410 DBP2YNL112W 1641 nt14.97□□□□□ -0.01
ATG17Q06410 Q0297Q0297 156 nt14.86□□□□□ -0.03
ATG17Q06410 RTC3YHR087W 336 nt14.64□□□□□ -0.07
ATG17Q06410 YCR051WYCR051W 669 nt14.26□□□□□ -0.13
ATG17Q06410 PUT4YOR348C 1884 nt14.2□□□□□ -0.14
ATG17Q06410 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.1□□□□□ -0.15
ATG17Q06410 RVS167YDR388W 1449 nt13.98□□□□□ -0.17
ATG17Q06410 CCC1YLR220W 969 nt13.95□□□□□ -0.18
ATG17Q06410 SCS3YGL126W 1143 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG17Q06410 POA1YBR022W 534 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG17Q06410 ARE1YCR048W 1833 nt13.69□□□□□ -0.22
ATG17Q06410 SCJ1YMR214W 1134 nt13.65□□□□□ -0.22
ATG17Q06410 BSC6YOL137W 1494 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG17Q06410 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG17Q06410 SPT5YML010W 3192 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG17Q06410 SAH1YER043C 1350 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG17Q06410 SSA4YER103W 1929 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG17Q06410 URN1YPR152C 1398 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG17Q06410 OPI9YLR338W 858 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG17Q06410 RPP1BYDL130W 321 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG17Q06410 SHR5YOL110W 714 nt13.28□□□□□ -0.28
ATG17Q06410 YOL085CYOL085C 342 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG17Q06410 BUD23YCR047C 828 nt13.18□□□□□ -0.3
ATG17Q06410 DEP1YAL013W 1218 nt13.14□□□□□ -0.31
ATG17Q06410 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG17Q06410 RPN10YHR200W 807 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG17Q06410 PKP1YIL042C 1185 nt13.04□□□□□ -0.32
ATG17Q06410 PUN1YLR414C 792 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG17Q06410 BDF1YLR399C 2061 nt12.97□□□□□ -0.33
ATG17Q06410 PTC2YER089C 1395 nt12.95□□□□□ -0.34
ATG17Q06410 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG17Q06410 YNL208WYNL208W 600 nt12.89□□□□□ -0.35
ATG17Q06410 MEP2YNL142W 1500 nt12.83□□□□□ -0.35
ATG17Q06410 PET122YER153C 765 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG17Q06410 TAT1YBR069C 1860 nt12.8□□□□□ -0.36
ATG17Q06410 YJR018WYJR018W 363 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG17Q06410 YDJ1YNL064C 1230 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG17Q06410 PAC11YDR488C 1602 nt12.68□□□□□ -0.38
ATG17Q06410 FIS1YIL065C 468 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG17Q06410 DAL1YIR027C 1383 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG17Q06410 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG17Q06410 FPR4YLR449W 1179 nt12.53□□□□□ -0.4
ATG17Q06410 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
ATG17Q06410 SCR1SCR1 522 nt12.51□□□□□ -0.41
ATG17Q06410 YPS1YLR120C 1710 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG17Q06410 YMR090WYMR090W 684 nt12.47□□□□□ -0.41
ATG17Q06410 PHO4YFR034C 939 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG17Q06410 YBR220CYBR220C 1683 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG17Q06410 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG17Q06410 INM2YDR287W 879 nt12.42□□□□□ -0.42
ATG17Q06410 EMI2YDR516C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
ATG17Q06410 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
ATG17Q06410 RRN5YLR141W 1092 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG17Q06410 RPP2BYDR382W 333 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG17Q06410 YJR120WYJR120W 351 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG17Q06410 YDR095CYDR095C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
ATG17Q06410 YDL221WYDL221W 552 nt12.26□□□□□ -0.45
ATG17Q06410 SDH1YKL148C 1923 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG17Q06410 ATS1YAL020C 1002 nt12.21□□□□□ -0.45
ATG17Q06410 PCH2YBR186W 1695 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG17Q06410 SEC11YIR022W 504 nt12.18□□□□□ -0.46
ATG17Q06410 GUT2YIL155C 1950 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG17Q06410 YBL100CYBL100C 315 nt12.13□□□□□ -0.47
ATG17Q06410 TIR1YER011W 765 nt12.12□□□□□ -0.47
ATG17Q06410 CAC2YML102W 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG17Q06410 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG17Q06410 SSA1YAL005C 1929 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG17Q06410 RPP2AYOL039W 321 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG17Q06410 SCC4YER147C 1875 nt12.06□□□□□ -0.48
ATG17Q06410 PTP1YDL230W 1008 nt12.06□□□□□ -0.48
ATG17Q06410 FPS1YLL043W 2010 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG17Q06410 ALF1YNL148C 765 nt12□□□□□ -0.49
ATG17Q06410 YJL225CYJL225C 5277 nt12□□□□□ -0.49
ATG17Q06410 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG17Q06410 IRC15YPL017C 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
ATG17Q06410 BDH2YAL061W 1254 nt11.89□□□□□ -0.51
ATG17Q06410 RSB1YOR049C 1065 nt11.89□□□□□ -0.51
ATG17Q06410 PIB2YGL023C 1908 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG17Q06410 GIS3YLR094C 1509 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG17Q06410 YSC84YHR016C 1407 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG17Q06410 RTF1YGL244W 1677 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG17Q06410 TRM9YML014W 840 nt11.82□□□□□ -0.52
ATG17Q06410 SIS1YNL007C 1059 nt11.8□□□□□ -0.52
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