RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A PTC6P25646 442 aa3.06□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A UBP7P40453 1071 aa3.06□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A IDS2P46958 469 aa3.06□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A PDR8Q06149 701 aa3.06□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YPL191CQ08930 360 aa3.05□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A ASG1P40467 964 aa3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A AZF1P41696 914 aa3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A PMT3P47190 753 aa3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A POS5Q06892 414 aa3.04□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A NUP145P49687 1317 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YML002WP0CF17 737 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A VPS41P38959 992 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A FAA2P39518 744 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A IRC5P43610 853 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YGR237CP50089 785 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A CUL3P53202 744 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YMR254CQ04838 102 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A THI3Q07471 609 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YOR378WQ08902 515 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A HOS1Q12214 470 aa3.03□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A REV1P12689 985 aa3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A OCT1P35999 772 aa3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A ESBP6P53918 673 aa3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A ECI1Q05871 280 aa3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A URA3P03962 267 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A HNM1P19807 563 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A YJL070CP40361 888 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A UBP8P50102 471 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A MNT2P53059 558 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A ARP9Q05123 467 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A YGR161W-CQ3E744 92 aa3.01□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A YPR003CP53394 754 aa3□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A YCR061WP25639 631 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CPR3P25719 182 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A SIP1P32578 815 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A EAF5P39995 279 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CDC1P40986 491 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A MCH4Q08268 501 aa2.99□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A KRE9P39005 276 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A ADD37Q03233 198 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A SKY1Q03656 742 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CAC2Q04199 468 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CRF1Q04930 467 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A PIG1Q06216 648 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A YPR027CQ12079 277 aa2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CYB2P00175 591 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A PMS1P14242 873 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A EFM2P38347 419 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A UBP12P39538 1254 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A GSM1P42950 618 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A NIT2P47016 307 aa2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YHL009W-AYHL009W-A CBP1P07252 654 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YCR006CP25350 157 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A RAD24P32641 659 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A SHE10P53075 577 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A FRE3Q08905 711 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A DIN7Q12086 430 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A RMP1Q12530 201 aa2.96□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ERC1P38767 581 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A MAD2P40958 196 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ATG27P46989 271 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YJR120WP47157 116 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YNR071CP53757 342 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A SWF1Q04629 336 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.95□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A PRP45P28004 379 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A SWC3P31376 625 aa2.94□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ENP1P38333 483 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YEN1P40028 759 aa2.94□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ZAP1P47043 880 aa2.94□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A CTT1P06115 562 aa2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A COX11P19516 300 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A TRS65P32893 560 aa2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A PCA1P38360 1216 aa2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A FPR3P38911 411 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A VFA1P40080 203 aa2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A IML2P47031 731 aa2.93□□□□□ -1.94
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