RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	REG1	Q00816	1014 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RNQ1	YCL028W	RSC4	Q02206	625 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RNQ1	YCL028W	PML39	Q03760	334 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RNQ1	YCL028W	NDD1	Q08887	554 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RNQ1	YCL028W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	AMS1	P22855	1083 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	MIH1	P23748	554 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YCR051W	P25631	222 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SMI1	P32566	505 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	APM3	P38153	483 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	VPS41	P38959	992 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TUB4	P53378	473 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TEP1	P53916	434 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TMN2	Q04562	672 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	NCA2	Q12374	616 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	MSH1	P25846	959 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SRP101	P32916	621 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	HEM14	P40012	539 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	VNX1	P42839	908 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	HST2	P53686	357 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	FAR8	Q05040	523 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YDR344C	Q05510	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.31	□□□□□ -0.6	not detected
RNQ1	YCL028W	MRPL8	P22353	238 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TFA2	P36145	328 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	EXO1	P39875	702 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SLX8	P40072	274 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TRS85	P46944	698 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YTP1	P53584	459 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SLT2	Q00772	484 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SLD7	Q08457	257 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	PEX11	Q12462	236 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	CLN1	P20437	546 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	DAL81	P21657	970 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	KIP2	P28743	706 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SET3	P36124	751 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	BIO4	P53630	237 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TRS31	Q03337	283 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	NHX1	Q04121	633 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YLR053C	Q12026	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YLR046C	Q12253	270 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	REV1	P12689	985 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SQT1	P35184	431 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	MED6	P38782	295 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	CHS6	P40955	746 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	EFM6	P53970	246 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	NUP100	Q02629	959 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	CDC123	Q05791	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	INO1	P11986	533 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	BET2	P20133	325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	KIN3	P22209	435 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	RBK1	P25332	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SGF29	P25554	259 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	DCC1	P25559	380 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	GEX1	P25596	615 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	GDA1	P32621	518 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	SLD2	P34252	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	GEX2	P36173	615 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	MRP21	P38175	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	RGI2	P40188	164 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	AIM14	P53109	570 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YHM2	Q04013	314 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RNQ1	YCL028W	ATP12	P22135	325 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	YSP3	P25036	478 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	RDH54	P38086	958 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	YHR131C	P38835	850 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	YJL206C	P39529	758 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	AIM23	P47015	356 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	SAP4	P53036	818 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RNQ1	YCL028W	SFB2	P53953	876 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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