Protein–RNA interactions for Protein: Q12253

YLR046C, Uncharacterized membrane protein YLR046C, yeastyeast

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR046CQ12253 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.83■□□□□ 0.93
YLR046CQ12253 NSR1YGR159C 1245 nt20.54■□□□□ 0.88
YLR046CQ12253 NOP1YDL014W 984 nt20.29■□□□□ 0.84
YLR046CQ12253 YKL036CYKL036C 393 nt18.88■□□□□ 0.61
YLR046CQ12253 MDJ1YFL016C 1536 nt18.13■□□□□ 0.49
YLR046CQ12253 Q0297Q0297 156 nt17.82■□□□□ 0.44
YLR046CQ12253 SRX1YKL086W 384 nt17.74■□□□□ 0.43
YLR046CQ12253 YJL027CYJL027C 417 nt17.67■□□□□ 0.42
YLR046CQ12253 SCS3YGL126W 1143 nt17.27■□□□□ 0.36
YLR046CQ12253 YCR051WYCR051W 669 nt16.86■□□□□ 0.29
YLR046CQ12253 YOL085CYOL085C 342 nt16.36■□□□□ 0.21
YLR046CQ12253 PKP1YIL042C 1185 nt16.12■□□□□ 0.17
YLR046CQ12253 DBP2YNL112W 1641 nt16.1■□□□□ 0.17
YLR046CQ12253 RPP1BYDL130W 321 nt15.99■□□□□ 0.15
YLR046CQ12253 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.95■□□□□ 0.14
YLR046CQ12253 CCC1YLR220W 969 nt15.81■□□□□ 0.12
YLR046CQ12253 ATS1YAL020C 1002 nt15.5■□□□□ 0.07
YLR046CQ12253 SCJ1YMR214W 1134 nt15.47■□□□□ 0.07
YLR046CQ12253 YBR190WYBR190W 312 nt15.38■□□□□ 0.05
YLR046CQ12253 PET122YER153C 765 nt15.28■□□□□ 0.04
YLR046CQ12253 RVS167YDR388W 1449 nt15.16■□□□□ 0.02
YLR046CQ12253 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YLR046CQ12253 SCR1SCR1 522 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR046CQ12253 RTC3YHR087W 336 nt15.07■□□□□ 0
YLR046CQ12253 RRN5YLR141W 1092 nt14.86□□□□□ -0.03
YLR046CQ12253 SHR5YOL110W 714 nt14.67□□□□□ -0.06
YLR046CQ12253 YDJ1YNL064C 1230 nt14.64□□□□□ -0.07
YLR046CQ12253 RSB1YOR049C 1065 nt14.6□□□□□ -0.07
YLR046CQ12253 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.56□□□□□ -0.08
YLR046CQ12253 PST2YDR032C 597 nt14.32□□□□□ -0.12
YLR046CQ12253 GAR1YHR089C 618 nt14.32□□□□□ -0.12
YLR046CQ12253 DEP1YAL013W 1218 nt14.22□□□□□ -0.13
YLR046CQ12253 URN1YPR152C 1398 nt14.17□□□□□ -0.14
YLR046CQ12253 YNL208WYNL208W 600 nt13.99□□□□□ -0.17
YLR046CQ12253 RPN10YHR200W 807 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR046CQ12253 OPI9YLR338W 858 nt13.92□□□□□ -0.18
YLR046CQ12253 PUT4YOR348C 1884 nt13.86□□□□□ -0.19
YLR046CQ12253 YKL097CYKL097C 411 nt13.83□□□□□ -0.2
YLR046CQ12253 TIR1YER011W 765 nt13.81□□□□□ -0.2
YLR046CQ12253 SAH1YER043C 1350 nt13.8□□□□□ -0.2
YLR046CQ12253 SHU1YHL006C 453 nt13.71□□□□□ -0.21
YLR046CQ12253 ARE1YCR048W 1833 nt13.67□□□□□ -0.22
YLR046CQ12253 SSA1YAL005C 1929 nt13.63□□□□□ -0.23
YLR046CQ12253 SSA3YBL075C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
YLR046CQ12253 YJR018WYJR018W 363 nt13.52□□□□□ -0.25
YLR046CQ12253 PUN1YLR414C 792 nt13.51□□□□□ -0.25
YLR046CQ12253 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.49□□□□□ -0.25
YLR046CQ12253 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.46□□□□□ -0.25
YLR046CQ12253 SRB2YHR041C 633 nt13.45□□□□□ -0.26
YLR046CQ12253 POA1YBR022W 534 nt13.45□□□□□ -0.26
YLR046CQ12253 YJR120WYJR120W 351 nt13.36□□□□□ -0.27
YLR046CQ12253 PTC2YER089C 1395 nt13.33□□□□□ -0.27
YLR046CQ12253 RPP2BYDR382W 333 nt13.28□□□□□ -0.28
YLR046CQ12253 YOR139CYOR139C 393 nt13.27□□□□□ -0.29
YLR046CQ12253 WWM1YFL010C 636 nt13.25□□□□□ -0.29
YLR046CQ12253 BUD23YCR047C 828 nt13.2□□□□□ -0.3
YLR046CQ12253 YGR021WYGR021W 873 nt13.19□□□□□ -0.3
YLR046CQ12253 HOM6YJR139C 1080 nt13.17□□□□□ -0.3
YLR046CQ12253 MNP1YGL068W 585 nt13.15□□□□□ -0.3
YLR046CQ12253 NAB2YGL122C 1578 nt13.12□□□□□ -0.31
YLR046CQ12253 BSC6YOL137W 1494 nt13.12□□□□□ -0.31
YLR046CQ12253 NPL3YDR432W 1245 nt13.11□□□□□ -0.31
YLR046CQ12253 BDH2YAL061W 1254 nt13.04□□□□□ -0.32
YLR046CQ12253 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.01□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 INM2YDR287W 879 nt13□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 DAL1YIR027C 1383 nt12.99□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 RKM5YLR137W 1104 nt12.98□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 FPR4YLR449W 1179 nt12.98□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 FIS1YIL065C 468 nt12.96□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 YOL037CYOL037C 354 nt12.96□□□□□ -0.33
YLR046CQ12253 YBL100CYBL100C 315 nt12.92□□□□□ -0.34
YLR046CQ12253 LSM3YLR438C-A 270 nt12.9□□□□□ -0.34
YLR046CQ12253 PHO4YFR034C 939 nt12.87□□□□□ -0.35
YLR046CQ12253 TRM9YML014W 840 nt12.78□□□□□ -0.36
YLR046CQ12253 FUN26YAL022C 1554 nt12.77□□□□□ -0.36
YLR046CQ12253 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR046CQ12253 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR046CQ12253 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR046CQ12253 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR046CQ12253 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR046CQ12253 YLR281CYLR281C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
YLR046CQ12253 CCT6YDR188W 1641 nt12.64□□□□□ -0.39
YLR046CQ12253 WHI5YOR083W 888 nt12.61□□□□□ -0.39
YLR046CQ12253 PUS2YGL063W 1113 nt12.6□□□□□ -0.39
YLR046CQ12253 YPS1YLR120C 1710 nt12.55□□□□□ -0.4
YLR046CQ12253 ALF1YNL148C 765 nt12.55□□□□□ -0.4
YLR046CQ12253 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.51□□□□□ -0.41
YLR046CQ12253 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.51□□□□□ -0.41
YLR046CQ12253 YDR095CYDR095C 411 nt12.5□□□□□ -0.41
YLR046CQ12253 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.46□□□□□ -0.41
YLR046CQ12253 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
YLR046CQ12253 SIS1YNL007C 1059 nt12.36□□□□□ -0.43
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