RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-16A0A075B5U1 98 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plp1P60202 277 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm26938S4R185 226 aa9.26□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm28038F7BCN9 126 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm9944Q8C559 102 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q9D131 166 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01820 115 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm21370Q3T9V6 190 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cdpf1Q8R3A2 119 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Higd1aQ9JLR9 95 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Synj2bpQ9D6K5 145 aa9.25□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm11444F6QMA6 170 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Olfr312Q7TRZ9 308 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PlnP61014 52 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chac1Q8R3J5 223 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Bhlha15Q9QYC3 197 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trbv14A0A140T8L9 115 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prh1P05142 261 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PlaurP35456 327 aa9.24□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 OdaphJ3QNT8 126 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lamtor2Q9JHS3 125 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav12-3A0A075B648 115 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm20379A0A087WR34 119 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ovol3D3YYM0 189 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm815Q3UWS2 115 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm1553Q66VB7 94 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NrepQ07475 68 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gng7Q61016 68 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Olfr498Q8VEW2 330 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q9CX25 107 aa9.23□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TroQ6DIC6 2087 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 RetnQ99P87 114 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gnb1lQ9EQ15 326 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Muc5acE9QAQ8 3455 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01756 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01757 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 H2-DMb1P35737 261 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 RhohQ9D3G9 191 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm15294V9GXA7 121 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01748 117 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Defa20Q45VN2 95 aa9.22□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trav14-2A0A075B694 121 aa9.21□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa9.21□□□□□ -0.93
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 DdtO35215 118 aa9.21□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem263Q9DAM7 115 aa9.21□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TtrP07309 147 aa9.21□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Edn1P22387 202 aa9.21□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znrf2Q71FD5 238 aa9.21□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1810032O08RikE9PZV8 113 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01747 120 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm26727M0QWT1 121 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01753 117 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ndufs7Q9DC70 224 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tcl1b4P56844 120 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm3250E9Q1M3 230 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01741 114 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plscr4P58196 326 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Odf3l1Q810P2 275 aa9.2□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5150Q1AN92 299 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cysltr1Q99JA4 352 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slamf6Q9ET39 351 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NpyP57774 97 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpl39P62892 51 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Olfr1367Q8VFG2 316 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem101Q91VP7 257 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plac1Q9JI83 173 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sprr3O09116 238 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01786 117 aa9.19□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GalmQ8K157 342 aa9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tex48Q9DA81 110 aa9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10775Q3V290 127 aa9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf239P24399 201 aa9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ankrd39Q9D2X0 183 aa9.18□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 P01738 130 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cox8bP48772 70 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 MdfiP70331 251 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atp5iQ06185 71 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Prss29Q99MS4 279 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trank1Q8BV79 2999 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vps13cQ8BX70 3748 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Csmd1Q923L3 3564 aa9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ankrd17Q99NH0 2603 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrygbP04344 175 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.5 ms