Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q8

Ighv2-7, Immunoglobulin heavy variable 2-7 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Ighv2-7A0A075B5Q8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ighv2-7A0A075B5Q8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ighv2-7A0A075B5Q8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ighv2-7A0A075B5Q8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Ighv2-7A0A075B5Q8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Ighv2-7A0A075B5Q8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv2-7A0A075B5Q8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv2-7A0A075B5Q8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,64■■□□□ 1,37
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ighv2-7A0A075B5Q8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,48■■□□□ 1,35
Ighv2-7A0A075B5Q8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Ighv2-7A0A075B5Q8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv2-7A0A075B5Q8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ighv2-7A0A075B5Q8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv2-7A0A075B5Q8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv2-7A0A075B5Q8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ighv2-7A0A075B5Q8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv2-7A0A075B5Q8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ighv2-7A0A075B5Q8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ighv2-7A0A075B5Q8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ighv2-7A0A075B5Q8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ighv2-7A0A075B5Q8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv2-7A0A075B5Q8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv2-7A0A075B5Q8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ighv2-7A0A075B5Q8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ighv2-7A0A075B5Q8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Ighv2-7A0A075B5Q8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Ighv2-7A0A075B5Q8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv2-7A0A075B5Q8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ighv2-7A0A075B5Q8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ighv2-7A0A075B5Q8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ighv2-7A0A075B5Q8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Ighv2-7A0A075B5Q8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ighv2-7A0A075B5Q8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ighv2-7A0A075B5Q8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ighv2-7A0A075B5Q8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Ighv2-7A0A075B5Q8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ighv2-7A0A075B5Q8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ighv2-7A0A075B5Q8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ighv2-7A0A075B5Q8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ighv2-7A0A075B5Q8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ighv2-7A0A075B5Q8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ighv2-7A0A075B5Q8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Ighv2-7A0A075B5Q8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ighv2-7A0A075B5Q8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ighv2-7A0A075B5Q8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv2-7A0A075B5Q8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv2-7A0A075B5Q8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,31■■□□□ 1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv2-7A0A075B5Q8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ighv2-7A0A075B5Q8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ighv2-7A0A075B5Q8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Ighv2-7A0A075B5Q8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Ighv2-7A0A075B5Q8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ighv2-7A0A075B5Q8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ighv2-7A0A075B5Q8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ighv2-7A0A075B5Q8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ighv2-7A0A075B5Q8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ighv2-7A0A075B5Q8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ighv2-7A0A075B5Q8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ighv2-7A0A075B5Q8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ighv2-7A0A075B5Q8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ighv2-7A0A075B5Q8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ighv2-7A0A075B5Q8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ighv2-7A0A075B5Q8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ighv2-7A0A075B5Q8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
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