Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W1

Ighv1-50, Immunoglobulin heavy variable 1-50 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ighv1-50A0A075B5W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ighv1-50A0A075B5W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ighv1-50A0A075B5W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Ighv1-50A0A075B5W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ighv1-50A0A075B5W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Ighv1-50A0A075B5W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv1-50A0A075B5W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv1-50A0A075B5W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Ighv1-50A0A075B5W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv1-50A0A075B5W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ighv1-50A0A075B5W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ighv1-50A0A075B5W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv1-50A0A075B5W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv1-50A0A075B5W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ighv1-50A0A075B5W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ighv1-50A0A075B5W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv1-50A0A075B5W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv1-50A0A075B5W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Ighv1-50A0A075B5W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ighv1-50A0A075B5W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv1-50A0A075B5W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ighv1-50A0A075B5W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv1-50A0A075B5W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv1-50A0A075B5W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ighv1-50A0A075B5W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ighv1-50A0A075B5W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv1-50A0A075B5W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Ighv1-50A0A075B5W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ighv1-50A0A075B5W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ighv1-50A0A075B5W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv1-50A0A075B5W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ighv1-50A0A075B5W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Ighv1-50A0A075B5W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,89■■□□□ 1,09
Ighv1-50A0A075B5W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ighv1-50A0A075B5W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ighv1-50A0A075B5W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ighv1-50A0A075B5W1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ighv1-50A0A075B5W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv1-50A0A075B5W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ighv1-50A0A075B5W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,39■■□□□ 1,02
Ighv1-50A0A075B5W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ighv1-50A0A075B5W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,27■□□□□ 0,99
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ighv1-50A0A075B5W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-50A0A075B5W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,15■□□□□ 0,98
Ighv1-50A0A075B5W1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Ighv1-50A0A075B5W1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,12■□□□□ 0,97
Ighv1-50A0A075B5W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ighv1-50A0A075B5W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ighv1-50A0A075B5W1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ighv1-50A0A075B5W1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ighv1-50A0A075B5W1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Ighv1-50A0A075B5W1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ighv1-50A0A075B5W1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ighv1-50A0A075B5W1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Ighv1-50A0A075B5W1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ighv1-50A0A075B5W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ighv1-50A0A075B5W1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ighv1-50A0A075B5W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ighv1-50A0A075B5W1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ighv1-50A0A075B5W1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ighv1-50A0A075B5W1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ighv1-50A0A075B5W1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ighv1-50A0A075B5W1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ighv1-50A0A075B5W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ighv1-50A0A075B5W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Ighv1-50A0A075B5W1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Ighv1-50A0A075B5W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Ighv1-50A0A075B5W1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Ighv1-50A0A075B5W1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
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