Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss29Q99MS4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss29Q99MS4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prss29Q99MS4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prss29Q99MS4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prss29Q99MS4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss29Q99MS4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prss29Q99MS4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss29Q99MS4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss29Q99MS4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss29Q99MS4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss29Q99MS4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss29Q99MS4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss29Q99MS4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss29Q99MS4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss29Q99MS4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss29Q99MS4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss29Q99MS4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss29Q99MS4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss29Q99MS4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss29Q99MS4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prss29Q99MS4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss29Q99MS4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss29Q99MS4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss29Q99MS4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss29Q99MS4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prss29Q99MS4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss29Q99MS4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss29Q99MS4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss29Q99MS4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss29Q99MS4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss29Q99MS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss29Q99MS4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss29Q99MS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss29Q99MS4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prss29Q99MS4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss29Q99MS4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prss29Q99MS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prss29Q99MS4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prss29Q99MS4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss29Q99MS4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss29Q99MS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss29Q99MS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss29Q99MS4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss29Q99MS4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss29Q99MS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss29Q99MS4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prss29Q99MS4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prss29Q99MS4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss29Q99MS4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss29Q99MS4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss29Q99MS4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prss29Q99MS4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prss29Q99MS4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss29Q99MS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prss29Q99MS4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss29Q99MS4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prss29Q99MS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prss29Q99MS4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Prss29Q99MS4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss29Q99MS4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss29Q99MS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prss29Q99MS4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prss29Q99MS4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prss29Q99MS4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prss29Q99MS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prss29Q99MS4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prss29Q99MS4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prss29Q99MS4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prss29Q99MS4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss29Q99MS4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prss29Q99MS4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prss29Q99MS4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prss29Q99MS4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prss29Q99MS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss29Q99MS4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss29Q99MS4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss29Q99MS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss29Q99MS4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss29Q99MS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss29Q99MS4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss29Q99MS4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss29Q99MS4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss29Q99MS4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss29Q99MS4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss29Q99MS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss29Q99MS4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss29Q99MS4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss29Q99MS4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss29Q99MS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss29Q99MS4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss29Q99MS4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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