Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
NrepQ07475 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
NrepQ07475 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
NrepQ07475 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
NrepQ07475 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
NrepQ07475 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
NrepQ07475 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
NrepQ07475 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
NrepQ07475 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
NrepQ07475 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
NrepQ07475 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
NrepQ07475 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,04■□□□□ 0,96
NrepQ07475 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
NrepQ07475 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
NrepQ07475 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
NrepQ07475 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
NrepQ07475 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
NrepQ07475 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
NrepQ07475 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
NrepQ07475 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
NrepQ07475 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
NrepQ07475 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
NrepQ07475 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
NrepQ07475 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
NrepQ07475 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
NrepQ07475 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
NrepQ07475 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,46■□□□□ 0,87
NrepQ07475 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
NrepQ07475 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
NrepQ07475 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
NrepQ07475 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
NrepQ07475 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
NrepQ07475 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
NrepQ07475 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
NrepQ07475 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,98■□□□□ 0,79
NrepQ07475 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
NrepQ07475 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
NrepQ07475 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
NrepQ07475 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,8■□□□□ 0,76
NrepQ07475 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
NrepQ07475 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
NrepQ07475 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
NrepQ07475 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
NrepQ07475 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
NrepQ07475 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,64■□□□□ 0,73
NrepQ07475 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
NrepQ07475 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
NrepQ07475 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
NrepQ07475 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
NrepQ07475 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
NrepQ07475 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
NrepQ07475 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
NrepQ07475 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
NrepQ07475 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
NrepQ07475 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
NrepQ07475 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,47■□□□□ 0,71
NrepQ07475 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
NrepQ07475 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
NrepQ07475 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
NrepQ07475 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
NrepQ07475 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,43■□□□□ 0,7
NrepQ07475 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,38■□□□□ 0,69
NrepQ07475 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
NrepQ07475 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,38■□□□□ 0,69
NrepQ07475 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
NrepQ07475 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,32■□□□□ 0,68
NrepQ07475 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
NrepQ07475 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,24■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
NrepQ07475 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,2■□□□□ 0,66
NrepQ07475 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,19■□□□□ 0,66
NrepQ07475 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
NrepQ07475 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,17■□□□□ 0,66
NrepQ07475 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
NrepQ07475 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
NrepQ07475 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
NrepQ07475 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
NrepQ07475 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
NrepQ07475 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
NrepQ07475 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
NrepQ07475 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
NrepQ07475 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
NrepQ07475 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
NrepQ07475 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
NrepQ07475 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
NrepQ07475 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
NrepQ07475 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,85■□□□□ 0,61
NrepQ07475 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
NrepQ07475 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
NrepQ07475 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
NrepQ07475 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms