Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TtrP07309 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TtrP07309 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TtrP07309 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TtrP07309 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TtrP07309 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TtrP07309 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TtrP07309 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtrP07309 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtrP07309 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TtrP07309 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TtrP07309 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TtrP07309 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TtrP07309 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TtrP07309 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TtrP07309 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TtrP07309 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TtrP07309 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtrP07309 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TtrP07309 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TtrP07309 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TtrP07309 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TtrP07309 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtrP07309 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TtrP07309 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtrP07309 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtrP07309 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtrP07309 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtrP07309 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TtrP07309 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TtrP07309 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TtrP07309 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtrP07309 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TtrP07309 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtrP07309 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TtrP07309 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TtrP07309 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TtrP07309 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TtrP07309 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TtrP07309 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TtrP07309 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TtrP07309 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TtrP07309 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TtrP07309 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TtrP07309 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtrP07309 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TtrP07309 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TtrP07309 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TtrP07309 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TtrP07309 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtrP07309 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtrP07309 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtrP07309 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TtrP07309 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TtrP07309 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TtrP07309 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TtrP07309 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtrP07309 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TtrP07309 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtrP07309 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TtrP07309 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtrP07309 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TtrP07309 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtrP07309 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtrP07309 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtrP07309 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtrP07309 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtrP07309 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtrP07309 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TtrP07309 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtrP07309 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtrP07309 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtrP07309 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtrP07309 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtrP07309 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtrP07309 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TtrP07309 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtrP07309 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TtrP07309 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtrP07309 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtrP07309 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtrP07309 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtrP07309 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtrP07309 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtrP07309 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtrP07309 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtrP07309 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtrP07309 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtrP07309 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TtrP07309 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TtrP07309 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TtrP07309 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TtrP07309 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtrP07309 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtrP07309 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtrP07309 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TtrP07309 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtrP07309 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtrP07309 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtrP07309 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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