Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Edn1P22387 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Edn1P22387 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Edn1P22387 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Edn1P22387 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Edn1P22387 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Edn1P22387 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Edn1P22387 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Edn1P22387 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Edn1P22387 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Edn1P22387 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Edn1P22387 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Edn1P22387 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Edn1P22387 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Edn1P22387 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Edn1P22387 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Edn1P22387 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Edn1P22387 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Edn1P22387 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Edn1P22387 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Edn1P22387 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Edn1P22387 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Edn1P22387 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Edn1P22387 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Edn1P22387 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Edn1P22387 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Edn1P22387 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Edn1P22387 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Edn1P22387 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Edn1P22387 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Edn1P22387 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Edn1P22387 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Edn1P22387 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Edn1P22387 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Edn1P22387 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Edn1P22387 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Edn1P22387 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Edn1P22387 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Edn1P22387 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Edn1P22387 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Edn1P22387 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Edn1P22387 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Edn1P22387 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Edn1P22387 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Edn1P22387 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Edn1P22387 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Edn1P22387 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Edn1P22387 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Edn1P22387 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Edn1P22387 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Edn1P22387 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Edn1P22387 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Edn1P22387 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Edn1P22387 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Edn1P22387 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Edn1P22387 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Edn1P22387 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Edn1P22387 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Edn1P22387 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Edn1P22387 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Edn1P22387 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Edn1P22387 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Edn1P22387 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Edn1P22387 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Edn1P22387 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Edn1P22387 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Edn1P22387 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Edn1P22387 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Edn1P22387 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Edn1P22387 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Edn1P22387 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Edn1P22387 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Edn1P22387 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Edn1P22387 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Edn1P22387 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Edn1P22387 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Edn1P22387 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Edn1P22387 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Edn1P22387 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Edn1P22387 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Edn1P22387 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Edn1P22387 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Edn1P22387 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Edn1P22387 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Edn1P22387 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Edn1P22387 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Edn1P22387 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Edn1P22387 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Edn1P22387 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Edn1P22387 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Edn1P22387 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Edn1P22387 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Edn1P22387 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Edn1P22387 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Edn1P22387 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms