Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Edn1P22387 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Edn1P22387 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edn1P22387 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edn1P22387 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Edn1P22387 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Edn1P22387 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Edn1P22387 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edn1P22387 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edn1P22387 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edn1P22387 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edn1P22387 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edn1P22387 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edn1P22387 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edn1P22387 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Edn1P22387 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edn1P22387 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edn1P22387 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Edn1P22387 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Edn1P22387 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edn1P22387 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Edn1P22387 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Edn1P22387 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Edn1P22387 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edn1P22387 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Edn1P22387 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Edn1P22387 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Edn1P22387 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edn1P22387 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Edn1P22387 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edn1P22387 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edn1P22387 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edn1P22387 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Edn1P22387 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edn1P22387 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn1P22387 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn1P22387 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Edn1P22387 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Edn1P22387 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Edn1P22387 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edn1P22387 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Edn1P22387 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edn1P22387 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Edn1P22387 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edn1P22387 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edn1P22387 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edn1P22387 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edn1P22387 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Edn1P22387 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edn1P22387 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Edn1P22387 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Edn1P22387 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edn1P22387 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Edn1P22387 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edn1P22387 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edn1P22387 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edn1P22387 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edn1P22387 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edn1P22387 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edn1P22387 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edn1P22387 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edn1P22387 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edn1P22387 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edn1P22387 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Edn1P22387 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Edn1P22387 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edn1P22387 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edn1P22387 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edn1P22387 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edn1P22387 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edn1P22387 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edn1P22387 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Edn1P22387 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Edn1P22387 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Edn1P22387 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Edn1P22387 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edn1P22387 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edn1P22387 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edn1P22387 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edn1P22387 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edn1P22387 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edn1P22387 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Edn1P22387 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Edn1P22387 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edn1P22387 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Edn1P22387 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edn1P22387 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edn1P22387 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edn1P22387 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edn1P22387 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Edn1P22387 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edn1P22387 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edn1P22387 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edn1P22387 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edn1P22387 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms