Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Gm3250E9Q1M3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gm3250E9Q1M3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm3250E9Q1M3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm3250E9Q1M3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm3250E9Q1M3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm3250E9Q1M3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm3250E9Q1M3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm3250E9Q1M3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm3250E9Q1M3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm3250E9Q1M3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3250E9Q1M3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3250E9Q1M3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3250E9Q1M3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3250E9Q1M3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3250E9Q1M3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3250E9Q1M3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3250E9Q1M3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3250E9Q1M3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3250E9Q1M3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3250E9Q1M3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3250E9Q1M3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3250E9Q1M3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3250E9Q1M3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3250E9Q1M3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3250E9Q1M3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3250E9Q1M3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3250E9Q1M3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3250E9Q1M3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3250E9Q1M3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3250E9Q1M3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3250E9Q1M3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3250E9Q1M3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3250E9Q1M3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3250E9Q1M3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3250E9Q1M3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3250E9Q1M3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3250E9Q1M3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3250E9Q1M3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3250E9Q1M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3250E9Q1M3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3250E9Q1M3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3250E9Q1M3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3250E9Q1M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3250E9Q1M3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3250E9Q1M3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3250E9Q1M3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3250E9Q1M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3250E9Q1M3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3250E9Q1M3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3250E9Q1M3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3250E9Q1M3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3250E9Q1M3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3250E9Q1M3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3250E9Q1M3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3250E9Q1M3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3250E9Q1M3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3250E9Q1M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3250E9Q1M3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3250E9Q1M3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3250E9Q1M3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3250E9Q1M3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3250E9Q1M3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3250E9Q1M3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3250E9Q1M3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3250E9Q1M3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3250E9Q1M3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3250E9Q1M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3250E9Q1M3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3250E9Q1M3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3250E9Q1M3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3250E9Q1M3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3250E9Q1M3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3250E9Q1M3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3250E9Q1M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3250E9Q1M3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3250E9Q1M3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3250E9Q1M3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3250E9Q1M3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3250E9Q1M3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3250E9Q1M3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3250E9Q1M3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3250E9Q1M3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3250E9Q1M3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3250E9Q1M3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3250E9Q1M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3250E9Q1M3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3250E9Q1M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3250E9Q1M3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3250E9Q1M3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3250E9Q1M3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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