Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
P01748 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
P01748 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
P01748 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
P01748 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
P01748 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
P01748 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
P01748 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
P01748 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
P01748 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
P01748 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
P01748 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
P01748 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
P01748 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
P01748 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
P01748 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
P01748 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
P01748 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
P01748 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
P01748 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
P01748 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
P01748 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
P01748 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
P01748 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
P01748 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
P01748 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
P01748 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
P01748 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
P01748 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
P01748 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
P01748 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
P01748 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,39■■□□□ 1,33
P01748 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P01748 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P01748 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P01748 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P01748 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
P01748 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
P01748 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
P01748 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
P01748 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
P01748 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,94■■□□□ 1,26
P01748 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
P01748 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
P01748 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
P01748 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
P01748 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
P01748 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
P01748 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
P01748 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,69■■□□□ 1,22
P01748 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
P01748 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
P01748 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
P01748 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
P01748 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
P01748 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
P01748 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
P01748 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
P01748 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
P01748 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
P01748 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
P01748 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
P01748 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,09■■□□□ 1,13
P01748 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
P01748 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
P01748 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
P01748 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
P01748 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
P01748 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
P01748 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
P01748 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
P01748 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
P01748 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P01748 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P01748 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
P01748 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
P01748 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
P01748 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01748 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P01748 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P01748 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,82■■□□□ 1,08
P01748 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
P01748 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
P01748 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01748 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01748 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01748 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01748 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01748 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01748 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01748 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01748 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01748 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01748 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01748 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
P01748 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P01748 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
P01748 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,54■■□□□ 1,04
P01748 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P01748 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms