Protein–RNA interactions for Protein: P01753

Ig heavy chain V region 186-1, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01753 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
P01753 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
P01753 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
P01753 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
P01753 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
P01753 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
P01753 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
P01753 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
P01753 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
P01753 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
P01753 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
P01753 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P01753 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
P01753 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
P01753 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
P01753 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
P01753 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,46■■□□□ 1,19
P01753 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
P01753 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
P01753 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
P01753 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
P01753 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
P01753 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
P01753 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
P01753 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P01753 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P01753 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
P01753 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
P01753 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
P01753 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
P01753 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P01753 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01753 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P01753 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
P01753 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
P01753 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01753 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01753 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01753 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P01753 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
P01753 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
P01753 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
P01753 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01753 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
P01753 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
P01753 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
P01753 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,31■■□□□ 1
P01753 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
P01753 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
P01753 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
P01753 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
P01753 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
P01753 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
P01753 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
P01753 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
P01753 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
P01753 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
P01753 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
P01753 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
P01753 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,75■□□□□ 0,91
P01753 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
P01753 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
P01753 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,73■□□□□ 0,91
P01753 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
P01753 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
P01753 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
P01753 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
P01753 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
P01753 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
P01753 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
P01753 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
P01753 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
P01753 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
P01753 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
P01753 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
P01753 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
P01753 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
P01753 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
P01753 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
P01753 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
P01753 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
P01753 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
P01753 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
P01753 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
P01753 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
P01753 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01753 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
P01753 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
P01753 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
P01753 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
P01753 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
P01753 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01753 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
P01753 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
P01753 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01753 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01753 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
P01753 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01753 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01753 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms