RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.31■■□□□ 1.16
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gab3Q8BSM5 595 aa19.62■□□□□ 0.73
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trim41Q5NCC3 630 aa19.48■□□□□ 0.71
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Abcc8B2RUS7 1588 aa19.41■□□□□ 0.7
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa19.31■□□□□ 0.68
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa18.97■□□□□ 0.63
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zeb1Q64318 1117 aa18.93■□□□□ 0.62
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Npm2Q80W85 207 aa18.92■□□□□ 0.62
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc180J3QNE4 1664 aa18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 HrcG5E8J6 738 aa18.7■□□□□ 0.58
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Wdr66E9Q743 1299 aa18.67■□□□□ 0.58
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rtl1Q7M732 1744 aa18.48■□□□□ 0.55
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa18.41■□□□□ 0.54
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chic1Q8CBW7 227 aa18.4■□□□□ 0.54
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.38■□□□□ 0.53
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa18.34■□□□□ 0.53
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dcaf1Q80TR8 1506 aa18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pcgf6Q99NA9 353 aa18.14■□□□□ 0.49
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mier1Q5UAK0 511 aa18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kdm5dQ62240 1548 aa18■□□□□ 0.47
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lmod2Q3UHZ5 550 aa17.95■□□□□ 0.46
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Baz1aO88379 1555 aa17.88■□□□□ 0.45
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slc24a1Q91WD8 1130 aa17.85■□□□□ 0.45
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cep164Q5DU05 1446 aa17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Neurod1Q60867 357 aa17.8■□□□□ 0.44
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Eid3Q3V124 375 aa17.79■□□□□ 0.44
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ScribQ80U72 1612 aa17.72■□□□□ 0.43
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa17.7■□□□□ 0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TonslQ6NZL6 1363 aa17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clip1Q922J3 1391 aa17.58■□□□□ 0.41
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sall2Q9QX96 1004 aa17.54■□□□□ 0.4
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa17.54■□□□□ 0.4
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Golga3P55937 1487 aa17.53■□□□□ 0.4
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa17.52■□□□□ 0.4
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sycp2Q9CUU3 1500 aa17.4■□□□□ 0.38
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zbtb4Q5F293 982 aa17.39■□□□□ 0.37
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kif15Q6P9L6 1387 aa17.37■□□□□ 0.37
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Chic2Q9D9G3 165 aa17.35■□□□□ 0.37
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm38655A0A286YDK6 273 aa17.27■□□□□ 0.36
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 BlmO88700 1416 aa17.25■□□□□ 0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Setd5Q5XJV7 1441 aa17.23■□□□□ 0.35
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ClspnQ80YR7 1315 aa17.2■□□□□ 0.34
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smarca2Q6DIC0 1577 aa17.17■□□□□ 0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Os9Q8K2C7 672 aa17.13■□□□□ 0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Synj1Q8CHC4 1574 aa17.13■□□□□ 0.33
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 NrdcQ8BHG1 1161 aa17.06■□□□□ 0.32
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Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Erich6D3Z6S9 713 aa17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stra8P70278 393 aa17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Crybg2B7ZCC2 1516 aa17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Csrnp3P59055 597 aa17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cep162Q6ZQ06 1403 aa17■□□□□ 0.31
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ercc6F8VPZ5 1481 aa16.98■□□□□ 0.31
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Eea1Q8BL66 1411 aa16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plppr3Q7TPB0 716 aa16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arhgap27A2AB59 869 aa16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc18Q640L5 1455 aa16.91■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fmn1Q05860 1466 aa16.9■□□□□ 0.3
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cux2P70298 1426 aa16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rgl3Q3UYI5 709 aa16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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