Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trav14-2A0A075B694 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trav14-2A0A075B694 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav14-2A0A075B694 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trav14-2A0A075B694 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trav14-2A0A075B694 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trav14-2A0A075B694 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav14-2A0A075B694 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav14-2A0A075B694 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav14-2A0A075B694 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trav14-2A0A075B694 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trav14-2A0A075B694 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trav14-2A0A075B694 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trav14-2A0A075B694 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trav14-2A0A075B694 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trav14-2A0A075B694 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trav14-2A0A075B694 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trav14-2A0A075B694 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trav14-2A0A075B694 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav14-2A0A075B694 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav14-2A0A075B694 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav14-2A0A075B694 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trav14-2A0A075B694 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trav14-2A0A075B694 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trav14-2A0A075B694 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trav14-2A0A075B694 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav14-2A0A075B694 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trav14-2A0A075B694 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trav14-2A0A075B694 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trav14-2A0A075B694 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trav14-2A0A075B694 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trav14-2A0A075B694 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trav14-2A0A075B694 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trav14-2A0A075B694 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trav14-2A0A075B694 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trav14-2A0A075B694 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trav14-2A0A075B694 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav14-2A0A075B694 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trav14-2A0A075B694 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trav14-2A0A075B694 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trav14-2A0A075B694 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trav14-2A0A075B694 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trav14-2A0A075B694 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trav14-2A0A075B694 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trav14-2A0A075B694 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trav14-2A0A075B694 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav14-2A0A075B694 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trav14-2A0A075B694 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trav14-2A0A075B694 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trav14-2A0A075B694 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trav14-2A0A075B694 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trav14-2A0A075B694 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trav14-2A0A075B694 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trav14-2A0A075B694 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trav14-2A0A075B694 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trav14-2A0A075B694 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trav14-2A0A075B694 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav14-2A0A075B694 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trav14-2A0A075B694 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trav14-2A0A075B694 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trav14-2A0A075B694 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trav14-2A0A075B694 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trav14-2A0A075B694 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trav14-2A0A075B694 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trav14-2A0A075B694 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trav14-2A0A075B694 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trav14-2A0A075B694 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trav14-2A0A075B694 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trav14-2A0A075B694 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trav14-2A0A075B694 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trav14-2A0A075B694 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trav14-2A0A075B694 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trav14-2A0A075B694 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trav14-2A0A075B694 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trav14-2A0A075B694 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trav14-2A0A075B694 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trav14-2A0A075B694 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms