Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trav14-2A0A075B694 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Trav14-2A0A075B694 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trav14-2A0A075B694 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Trav14-2A0A075B694 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Trav14-2A0A075B694 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Trav14-2A0A075B694 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Trav14-2A0A075B694 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Trav14-2A0A075B694 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Trav14-2A0A075B694 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Trav14-2A0A075B694 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Trav14-2A0A075B694 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Trav14-2A0A075B694 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Trav14-2A0A075B694 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Trav14-2A0A075B694 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Trav14-2A0A075B694 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Trav14-2A0A075B694 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trav14-2A0A075B694 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trav14-2A0A075B694 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Trav14-2A0A075B694 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Trav14-2A0A075B694 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Trav14-2A0A075B694 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Trav14-2A0A075B694 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Trav14-2A0A075B694 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Trav14-2A0A075B694 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Trav14-2A0A075B694 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Trav14-2A0A075B694 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Trav14-2A0A075B694 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Trav14-2A0A075B694 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
Trav14-2A0A075B694 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Trav14-2A0A075B694 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Trav14-2A0A075B694 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Trav14-2A0A075B694 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Trav14-2A0A075B694 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Trav14-2A0A075B694 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Trav14-2A0A075B694 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Trav14-2A0A075B694 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Trav14-2A0A075B694 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Trav14-2A0A075B694 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Trav14-2A0A075B694 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Trav14-2A0A075B694 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Trav14-2A0A075B694 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Trav14-2A0A075B694 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Trav14-2A0A075B694 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Trav14-2A0A075B694 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Trav14-2A0A075B694 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Trav14-2A0A075B694 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Trav14-2A0A075B694 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Trav14-2A0A075B694 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Trav14-2A0A075B694 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Trav14-2A0A075B694 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Trav14-2A0A075B694 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Trav14-2A0A075B694 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Trav14-2A0A075B694 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Trav14-2A0A075B694 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
Trav14-2A0A075B694 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Trav14-2A0A075B694 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trav14-2A0A075B694 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Trav14-2A0A075B694 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Trav14-2A0A075B694 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Trav14-2A0A075B694 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Trav14-2A0A075B694 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,84
Trav14-2A0A075B694 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Trav14-2A0A075B694 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Trav14-2A0A075B694 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Trav14-2A0A075B694 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Trav14-2A0A075B694 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Trav14-2A0A075B694 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Trav14-2A0A075B694 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Trav14-2A0A075B694 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Trav14-2A0A075B694 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,79
Trav14-2A0A075B694 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Trav14-2A0A075B694 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Trav14-2A0A075B694 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Trav14-2A0A075B694 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Trav14-2A0A075B694 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19,88■□□□□ 0,77
Trav14-2A0A075B694 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
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