Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5S6

Ighv3-1, Immunoglobulin heavy variable 3-1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Ighv3-1A0A075B5S6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ighv3-1A0A075B5S6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ighv3-1A0A075B5S6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Ighv3-1A0A075B5S6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ighv3-1A0A075B5S6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Ighv3-1A0A075B5S6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ighv3-1A0A075B5S6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Ighv3-1A0A075B5S6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Ighv3-1A0A075B5S6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ighv3-1A0A075B5S6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Ighv3-1A0A075B5S6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Ighv3-1A0A075B5S6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Ighv3-1A0A075B5S6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ighv3-1A0A075B5S6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ighv3-1A0A075B5S6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Ighv3-1A0A075B5S6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ighv3-1A0A075B5S6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ighv3-1A0A075B5S6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ighv3-1A0A075B5S6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ighv3-1A0A075B5S6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ighv3-1A0A075B5S6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ighv3-1A0A075B5S6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Ighv3-1A0A075B5S6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ighv3-1A0A075B5S6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Ighv3-1A0A075B5S6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ighv3-1A0A075B5S6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Ighv3-1A0A075B5S6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Ighv3-1A0A075B5S6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv3-1A0A075B5S6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv3-1A0A075B5S6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv3-1A0A075B5S6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ighv3-1A0A075B5S6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ighv3-1A0A075B5S6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ighv3-1A0A075B5S6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv3-1A0A075B5S6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ighv3-1A0A075B5S6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ighv3-1A0A075B5S6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ighv3-1A0A075B5S6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ighv3-1A0A075B5S6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ighv3-1A0A075B5S6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv3-1A0A075B5S6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv3-1A0A075B5S6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv3-1A0A075B5S6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv3-1A0A075B5S6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ighv3-1A0A075B5S6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv3-1A0A075B5S6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv3-1A0A075B5S6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv3-1A0A075B5S6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv3-1A0A075B5S6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
Ighv3-1A0A075B5S6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv3-1A0A075B5S6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv3-1A0A075B5S6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv3-1A0A075B5S6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ighv3-1A0A075B5S6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ighv3-1A0A075B5S6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ighv3-1A0A075B5S6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Ighv3-1A0A075B5S6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ighv3-1A0A075B5S6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv3-1A0A075B5S6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Ighv3-1A0A075B5S6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv3-1A0A075B5S6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv3-1A0A075B5S6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Ighv3-1A0A075B5S6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv3-1A0A075B5S6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
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