Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ9

Ighv1-12, Immunoglobulin heavy variable V1-12 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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