Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ9

Ighv1-12, Immunoglobulin heavy variable V1-12 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,79■■□□□ 1,4
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,83■■□□□ 1,24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,79■□□□□ 0,92
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