Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Csmd1Q923L3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Csmd1Q923L3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Csmd1Q923L3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Csmd1Q923L3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Csmd1Q923L3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Csmd1Q923L3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Csmd1Q923L3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Csmd1Q923L3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Csmd1Q923L3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Csmd1Q923L3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Csmd1Q923L3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Csmd1Q923L3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Csmd1Q923L3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Csmd1Q923L3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Csmd1Q923L3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Csmd1Q923L3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Csmd1Q923L3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Csmd1Q923L3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Csmd1Q923L3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Csmd1Q923L3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Csmd1Q923L3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Csmd1Q923L3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Csmd1Q923L3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Csmd1Q923L3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Csmd1Q923L3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Csmd1Q923L3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Csmd1Q923L3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Csmd1Q923L3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Csmd1Q923L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Csmd1Q923L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Csmd1Q923L3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Csmd1Q923L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Csmd1Q923L3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Csmd1Q923L3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Csmd1Q923L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Csmd1Q923L3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Csmd1Q923L3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Csmd1Q923L3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Csmd1Q923L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Csmd1Q923L3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Csmd1Q923L3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Csmd1Q923L3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Csmd1Q923L3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Csmd1Q923L3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Csmd1Q923L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Csmd1Q923L3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Csmd1Q923L3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Csmd1Q923L3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Csmd1Q923L3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Csmd1Q923L3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Csmd1Q923L3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Csmd1Q923L3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Csmd1Q923L3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Csmd1Q923L3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Csmd1Q923L3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Csmd1Q923L3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Csmd1Q923L3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Csmd1Q923L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Csmd1Q923L3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Csmd1Q923L3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Csmd1Q923L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Csmd1Q923L3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Csmd1Q923L3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Csmd1Q923L3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Csmd1Q923L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Csmd1Q923L3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Csmd1Q923L3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Csmd1Q923L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Csmd1Q923L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Csmd1Q923L3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Csmd1Q923L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Csmd1Q923L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Csmd1Q923L3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Csmd1Q923L3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Csmd1Q923L3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Csmd1Q923L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Csmd1Q923L3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Csmd1Q923L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Csmd1Q923L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Csmd1Q923L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Csmd1Q923L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Csmd1Q923L3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Csmd1Q923L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Csmd1Q923L3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Csmd1Q923L3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Csmd1Q923L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Csmd1Q923L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Csmd1Q923L3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Csmd1Q923L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Csmd1Q923L3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Csmd1Q923L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Csmd1Q923L3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Csmd1Q923L3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Csmd1Q923L3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
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