RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C CIR1P42940 261 aa3.6□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C GRX3Q03835 250 aa3.6□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C MCM21Q06675 368 aa3.6□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
HRD1YOL013C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
HRD1YOL013C FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C YKR075CP36155 307 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C YHR112CP38716 378 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C UME6P39001 836 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C SPO22P40511 975 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C YNL058CP53947 316 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C ZDS2P54786 942 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C REC102Q02721 264 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C TIM50Q02776 476 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
HRD1YOL013C HSP42Q12329 375 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C RTN2Q12443 393 aa3.59□□□□□ -1.83
HRD1YOL013C IME1P21190 360 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C KIN3P22209 435 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MNE1P24720 663 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YEL025CP39991 1188 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C KHA1P40309 873 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YIL166CP40445 542 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MDE1P47095 244 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MRX6P48564 524 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C DSD1P53095 428 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MTL1P53214 551 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C VPS75P53853 264 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YMR210WQ03649 449 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C COX17Q12287 69 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.59□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C URA3P03962 267 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SIR3P06701 978 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PMS1P14242 873 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C GPI10P30777 616 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C CNS1P33313 385 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YKL100CP34248 587 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C NUP60P39705 539 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YJL068CP40363 299 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SIP4P46954 829 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C BSC5P53755 489 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YSA1Q01976 231 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C NGL3Q03210 505 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C HOT1Q03213 719 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C NFI1Q12216 726 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YOL159C-AQ3E769 90 aa3.58□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C INO80P53115 1489 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C ARG1P22768 420 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C DMC1P25453 334 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C MTC7P32633 139 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YHR033WP38690 423 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C FMO1P38866 432 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PSD1P39006 500 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YJR061WP40355 935 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PRM2P40534 656 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C LCB2P40970 561 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SGF73P53165 657 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YNR061CP53747 219 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C ENT4Q07872 247 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C ICL2Q12031 575 aa3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C GCN4P03069 281 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C SES1P07284 462 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C TDP1P38319 544 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YLF2P38746 405 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RRF1P38771 230 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C LYS9P38999 446 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C UBP7P40453 1071 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C NDC80P40460 691 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84 RIP-Chip
HRD1YOL013C POL31P46957 487 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YJL055WP47044 245 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YML122CQ03207 126 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C FCP1Q03254 732 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C RMT2Q03305 412 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C AIM32Q04689 311 aa3.56□□□□□ -1.84
HRD1YOL013C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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