Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.73■□□□□ 0.59
MSL5Q12186 NOP1YDL014W 984 nt18.42■□□□□ 0.54
MSL5Q12186 NSR1YGR159C 1245 nt18.24■□□□□ 0.51
MSL5Q12186 YKL036CYKL036C 393 nt17.41■□□□□ 0.38
MSL5Q12186 YJL027CYJL027C 417 nt16.33■□□□□ 0.2
MSL5Q12186 Q0297Q0297 156 nt16.27■□□□□ 0.2
MSL5Q12186 SRX1YKL086W 384 nt16.09■□□□□ 0.17
MSL5Q12186 SCS3YGL126W 1143 nt16.06■□□□□ 0.16
MSL5Q12186 MDJ1YFL016C 1536 nt15.74■□□□□ 0.11
MSL5Q12186 YCR051WYCR051W 669 nt15.29■□□□□ 0.04
MSL5Q12186 YOL085CYOL085C 342 nt15.07■□□□□ 0
MSL5Q12186 SCJ1YMR214W 1134 nt14.82□□□□□ -0.04
MSL5Q12186 PKP1YIL042C 1185 nt14.77□□□□□ -0.05
MSL5Q12186 RPP1BYDL130W 321 nt14.6□□□□□ -0.07
MSL5Q12186 ATS1YAL020C 1002 nt14.5□□□□□ -0.09
MSL5Q12186 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.27□□□□□ -0.13
MSL5Q12186 CCC1YLR220W 969 nt14.12□□□□□ -0.15
MSL5Q12186 DBP2YNL112W 1641 nt14.12□□□□□ -0.15
MSL5Q12186 PET122YER153C 765 nt13.88□□□□□ -0.19
MSL5Q12186 SCR1SCR1 522 nt13.87□□□□□ -0.19
MSL5Q12186 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.66□□□□□ -0.22
MSL5Q12186 RRN5YLR141W 1092 nt13.53□□□□□ -0.24
MSL5Q12186 RTC3YHR087W 336 nt13.46□□□□□ -0.25
MSL5Q12186 RVS167YDR388W 1449 nt13.39□□□□□ -0.27
MSL5Q12186 RSB1YOR049C 1065 nt13.39□□□□□ -0.27
MSL5Q12186 PST2YDR032C 597 nt13.36□□□□□ -0.27
MSL5Q12186 YBR190WYBR190W 312 nt13.32□□□□□ -0.28
MSL5Q12186 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.28□□□□□ -0.28
MSL5Q12186 YDJ1YNL064C 1230 nt13.22□□□□□ -0.29
MSL5Q12186 YKL097CYKL097C 411 nt13.07□□□□□ -0.32
MSL5Q12186 SHR5YOL110W 714 nt13.04□□□□□ -0.32
MSL5Q12186 GAR1YHR089C 618 nt12.84□□□□□ -0.35
MSL5Q12186 SHU1YHL006C 453 nt12.7□□□□□ -0.38
MSL5Q12186 DEP1YAL013W 1218 nt12.49□□□□□ -0.41
MSL5Q12186 SSA3YBL075C 1950 nt12.46□□□□□ -0.41
MSL5Q12186 YOR139CYOR139C 393 nt12.45□□□□□ -0.42
MSL5Q12186 TIR1YER011W 765 nt12.38□□□□□ -0.43
MSL5Q12186 URN1YPR152C 1398 nt12.38□□□□□ -0.43
MSL5Q12186 YNL208WYNL208W 600 nt12.37□□□□□ -0.43
MSL5Q12186 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.34□□□□□ -0.43
MSL5Q12186 RPN10YHR200W 807 nt12.32□□□□□ -0.44
MSL5Q12186 NPL3YDR432W 1245 nt12.26□□□□□ -0.45
MSL5Q12186 SSA1YAL005C 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
MSL5Q12186 OPI9YLR338W 858 nt12.11□□□□□ -0.47
MSL5Q12186 YGR021WYGR021W 873 nt12.01□□□□□ -0.49
MSL5Q12186 SRB2YHR041C 633 nt12□□□□□ -0.49
MSL5Q12186 HOM6YJR139C 1080 nt11.98□□□□□ -0.49
MSL5Q12186 MNP1YGL068W 585 nt11.97□□□□□ -0.49
MSL5Q12186 YOL037CYOL037C 354 nt11.97□□□□□ -0.49
MSL5Q12186 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.94□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.94□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.94□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.94□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.94□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 WWM1YFL010C 636 nt11.91□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 SAH1YER043C 1350 nt11.91□□□□□ -0.5
MSL5Q12186 YJR018WYJR018W 363 nt11.84□□□□□ -0.51
MSL5Q12186 RKM5YLR137W 1104 nt11.8□□□□□ -0.52
MSL5Q12186 PUN1YLR414C 792 nt11.77□□□□□ -0.53
MSL5Q12186 YJR120WYJR120W 351 nt11.75□□□□□ -0.53
MSL5Q12186 RPP2BYDR382W 333 nt11.74□□□□□ -0.53
MSL5Q12186 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.73□□□□□ -0.53
MSL5Q12186 PUT4YOR348C 1884 nt11.72□□□□□ -0.53
MSL5Q12186 PUS2YGL063W 1113 nt11.69□□□□□ -0.54
MSL5Q12186 MOT3YMR070W 1473 nt11.66□□□□□ -0.54
MSL5Q12186 YLR281CYLR281C 468 nt11.66□□□□□ -0.54
MSL5Q12186 ARE1YCR048W 1833 nt11.65□□□□□ -0.54
MSL5Q12186 BDH2YAL061W 1254 nt11.58□□□□□ -0.56 RIP-Chip
MSL5Q12186 WHI5YOR083W 888 nt11.55□□□□□ -0.56
MSL5Q12186 BSC6YOL137W 1494 nt11.55□□□□□ -0.56
MSL5Q12186 PTC2YER089C 1395 nt11.54□□□□□ -0.56
MSL5Q12186 LSM3YLR438C-A 270 nt11.52□□□□□ -0.57
MSL5Q12186 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.51□□□□□ -0.57
MSL5Q12186 POA1YBR022W 534 nt11.4□□□□□ -0.58
MSL5Q12186 FMP45YDL222C 930 nt11.39□□□□□ -0.59
MSL5Q12186 MRPL8YJL063C 717 nt11.39□□□□□ -0.59
MSL5Q12186 INM2YDR287W 879 nt11.38□□□□□ -0.59
MSL5Q12186 DSK2YMR276W 1122 nt11.36□□□□□ -0.59
MSL5Q12186 YPR011CYPR011C 981 nt11.35□□□□□ -0.59
MSL5Q12186 YBL100CYBL100C 315 nt11.33□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 NAB2YGL122C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 YCH1YGR203W 447 nt11.32□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 IMP2'YIL154C 1041 nt11.31□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 YLR236CYLR236C 324 nt11.29□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 BUD23YCR047C 828 nt11.28□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 TRM9YML014W 840 nt11.28□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 DAL1YIR027C 1383 nt11.28□□□□□ -0.6
MSL5Q12186 FPR4YLR449W 1179 nt11.24□□□□□ -0.61
MSL5Q12186 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.22□□□□□ -0.61
MSL5Q12186 FPS1YLL043W 2010 nt11.21□□□□□ -0.61 RIP-Chip
MSL5Q12186 FUN26YAL022C 1554 nt11.21□□□□□ -0.61
MSL5Q12186 FIS1YIL065C 468 nt11.2□□□□□ -0.62
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