RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	VPS64	Q03944	604 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TAF11	Q04226	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	STP3	Q05937	343 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	CAB2	P40506	365 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	BUD17	P53727	317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	ATG4	P53867	494 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	SSL2	Q00578	843 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YML119W	Q03208	357 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	PSF2	P40359	213 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	INN1	P53901	409 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YMC2	P38087	329 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	REV7	P38927	245 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	IRC6	P43615	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	GTB1	Q04924	702 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	UBP5	P39944	805 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	SUN4	P53616	420 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	UBP7	P40453	1071 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	COG1	P53079	417 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	MDR1	P53258	950 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DSS1	YMR287C	PET122	P10355	254 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YIP4	P53093	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NMA2	P53204	395 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	UFO1	Q04511	668 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ESC8	Q08119	714 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NTH1	P32356	751 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	EMP70	P32802	667 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YJL206C	P39529	758 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TIM10	P87108	93 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YSA1	Q01976	231 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PCL8	Q08966	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	LAM4	P38800	1345 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NPR2	P39923	615 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YGL117W	P53133	265 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RIA1	P53893	1110 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CBK1	P53894	756 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	MUB1	Q03162	620 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RCO1	Q04779	684 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	COX17	Q12287	69 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SUL1	P38359	859 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	PPE1	P38796	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CRF1	Q04930	467 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	LCB4	Q12246	624 aa		4.2	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	AAC1	P04710	309 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ERG8	P24521	451 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SLC1	P33333	303 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NMD4	Q12129	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SPE4	Q12455	300 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CCL1	P37366	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TMA108	P40462	946 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TDA10	P42938	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NPA3	P47122	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	VPS4	P52917	437 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RAD33	Q04231	177 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YBR225W	P38321	900 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YHL017W	P38745	532 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SWP82	P43554	623 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	MSY1	P48527	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	NGL3	Q03210	505 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	HRD3	Q05787	833 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	TRM2	P33753	639 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	ERC1	P38767	581 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	CCT6	P39079	546 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	YEL068C	P39977	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	SDS3	P40505	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DSS1	YMR287C	AAD10	P47182	288 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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