Protein–RNA interactions for Protein: Q99216

PNO1, Pre-rRNA-processing protein PNO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PNO1Q99216 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.53■□□□□ 0.72
PNO1Q99216 NSR1YGR159C 1245 nt19.32■□□□□ 0.68
PNO1Q99216 NOP1YDL014W 984 nt19.12■□□□□ 0.65
PNO1Q99216 YKL036CYKL036C 393 nt17.75■□□□□ 0.43
PNO1Q99216 MDJ1YFL016C 1536 nt17.07■□□□□ 0.32
PNO1Q99216 Q0297Q0297 156 nt16.76■□□□□ 0.27
PNO1Q99216 SRX1YKL086W 384 nt16.67■□□□□ 0.26
PNO1Q99216 YJL027CYJL027C 417 nt16.58■□□□□ 0.24
PNO1Q99216 SCS3YGL126W 1143 nt16.19■□□□□ 0.18
PNO1Q99216 YCR051WYCR051W 669 nt15.81■□□□□ 0.12
PNO1Q99216 YOL085CYOL085C 342 nt15.34■□□□□ 0.05
PNO1Q99216 DBP2YNL112W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
PNO1Q99216 PKP1YIL042C 1185 nt15.04■□□□□ -0
PNO1Q99216 RPP1BYDL130W 321 nt15.03■□□□□ -0
PNO1Q99216 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.98□□□□□ -0.01
PNO1Q99216 CCC1YLR220W 969 nt14.78□□□□□ -0.04
PNO1Q99216 SCJ1YMR214W 1134 nt14.61□□□□□ -0.07
PNO1Q99216 YBR190WYBR190W 312 nt14.59□□□□□ -0.07
PNO1Q99216 ATS1YAL020C 1002 nt14.53□□□□□ -0.08
PNO1Q99216 PET122YER153C 765 nt14.3□□□□□ -0.12
PNO1Q99216 RVS167YDR388W 1449 nt14.28□□□□□ -0.12
PNO1Q99216 SCR1SCR1 522 nt14.26□□□□□ -0.13
PNO1Q99216 RTC3YHR087W 336 nt14.24□□□□□ -0.13
PNO1Q99216 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.21□□□□□ -0.13
PNO1Q99216 RRN5YLR141W 1092 nt13.91□□□□□ -0.18
PNO1Q99216 YDJ1YNL064C 1230 nt13.79□□□□□ -0.2
PNO1Q99216 SHR5YOL110W 714 nt13.79□□□□□ -0.2
PNO1Q99216 RSB1YOR049C 1065 nt13.69□□□□□ -0.22
PNO1Q99216 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.64□□□□□ -0.23
PNO1Q99216 PST2YDR032C 597 nt13.43□□□□□ -0.26
PNO1Q99216 GAR1YHR089C 618 nt13.4□□□□□ -0.26
PNO1Q99216 URN1YPR152C 1398 nt13.32□□□□□ -0.28
PNO1Q99216 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
PNO1Q99216 DEP1YAL013W 1218 nt13.28□□□□□ -0.28
PNO1Q99216 RPN10YHR200W 807 nt13.2□□□□□ -0.3
PNO1Q99216 SSA3YBL075C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
PNO1Q99216 YNL208WYNL208W 600 nt13.16□□□□□ -0.3
PNO1Q99216 OPI9YLR338W 858 nt13.15□□□□□ -0.3
PNO1Q99216 SAH1YER043C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
PNO1Q99216 ARE1YCR048W 1833 nt13.04□□□□□ -0.32
PNO1Q99216 YKL097CYKL097C 411 nt13□□□□□ -0.33
PNO1Q99216 TIR1YER011W 765 nt12.96□□□□□ -0.33
PNO1Q99216 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.85□□□□□ -0.35
PNO1Q99216 POA1YBR022W 534 nt12.85□□□□□ -0.35
PNO1Q99216 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
PNO1Q99216 PUN1YLR414C 792 nt12.78□□□□□ -0.36
PNO1Q99216 SSA1YAL005C 1929 nt12.74□□□□□ -0.37
PNO1Q99216 YJR018WYJR018W 363 nt12.71□□□□□ -0.37
PNO1Q99216 PTC2YER089C 1395 nt12.61□□□□□ -0.39
PNO1Q99216 BSC6YOL137W 1494 nt12.59□□□□□ -0.39
PNO1Q99216 BUD23YCR047C 828 nt12.54□□□□□ -0.4
PNO1Q99216 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.54□□□□□ -0.4
PNO1Q99216 RPP2BYDR382W 333 nt12.52□□□□□ -0.41
PNO1Q99216 YJR120WYJR120W 351 nt12.5□□□□□ -0.41
PNO1Q99216 SRB2YHR041C 633 nt12.49□□□□□ -0.41
PNO1Q99216 NAB2YGL122C 1578 nt12.47□□□□□ -0.41
PNO1Q99216 YGR021WYGR021W 873 nt12.44□□□□□ -0.42
PNO1Q99216 YOR139CYOR139C 393 nt12.4□□□□□ -0.42
PNO1Q99216 WWM1YFL010C 636 nt12.38□□□□□ -0.43
PNO1Q99216 HOM6YJR139C 1080 nt12.35□□□□□ -0.43
PNO1Q99216 NPL3YDR432W 1245 nt12.32□□□□□ -0.44
PNO1Q99216 DAL1YIR027C 1383 nt12.3□□□□□ -0.44
PNO1Q99216 FIS1YIL065C 468 nt12.29□□□□□ -0.44
PNO1Q99216 INM2YDR287W 879 nt12.28□□□□□ -0.44
PNO1Q99216 Q0182Q0182 405 nt12.28□□□□□ -0.44
PNO1Q99216 MNP1YGL068W 585 nt12.27□□□□□ -0.45
PNO1Q99216 BDH2YAL061W 1254 nt12.27□□□□□ -0.45
PNO1Q99216 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.25□□□□□ -0.45
PNO1Q99216 FPR4YLR449W 1179 nt12.23□□□□□ -0.45
PNO1Q99216 YOL037CYOL037C 354 nt12.22□□□□□ -0.45
PNO1Q99216 RKM5YLR137W 1104 nt12.18□□□□□ -0.46
PNO1Q99216 PHO4YFR034C 939 nt12.17□□□□□ -0.46
PNO1Q99216 LSM3YLR438C-A 270 nt12.17□□□□□ -0.46
PNO1Q99216 YBL100CYBL100C 315 nt12.14□□□□□ -0.47
PNO1Q99216 SPT5YML010W 3192 nt12.06□□□□□ -0.48
PNO1Q99216 TRM9YML014W 840 nt12.02□□□□□ -0.49
PNO1Q99216 FUN26YAL022C 1554 nt12□□□□□ -0.49
PNO1Q99216 YPS1YLR120C 1710 nt11.97□□□□□ -0.49
PNO1Q99216 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.92□□□□□ -0.5
PNO1Q99216 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.92□□□□□ -0.5
PNO1Q99216 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.92□□□□□ -0.5
PNO1Q99216 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.92□□□□□ -0.5
PNO1Q99216 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.92□□□□□ -0.5
PNO1Q99216 CCT6YDR188W 1641 nt11.89□□□□□ -0.51
PNO1Q99216 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
PNO1Q99216 YLR281CYLR281C 468 nt11.88□□□□□ -0.51
PNO1Q99216 MOT3YMR070W 1473 nt11.84□□□□□ -0.51
PNO1Q99216 MEP2YNL142W 1500 nt11.83□□□□□ -0.52
PNO1Q99216 ALF1YNL148C 765 nt11.83□□□□□ -0.52
PNO1Q99216 WHI5YOR083W 888 nt11.82□□□□□ -0.52
PNO1Q99216 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.81□□□□□ -0.52
PNO1Q99216 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms