RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W RSF2P46974 1380 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W LAM4P38800 1345 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SUP35P05453 685 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CAJ1P39101 391 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W VID27P40157 782 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RPT2P40327 437 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W BIT61P47041 543 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W INP52P50942 1183 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MOT3P54785 490 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W UBP16Q02863 499 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YML131WQ03102 365 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W BLS1Q06071 122 aa5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ADH4P10127 382 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data5.89□□□□□ -1.47not detected
VHS1YDR247W PHO13P19881 312 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YPT7P32939 208 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W APM3P38153 483 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SWD1P39706 426 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W NDC80P40460 691 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MNT2P53059 558 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ECM3Q99252 613 aa5.89□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CBP3P21560 335 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W KIN82P25341 720 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
VHS1YDR247W PXL1P36166 706 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ADE17P38009 592 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CCT4P39078 528 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SEC9P40357 651 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MAD2P40958 196 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W FKH2P41813 862 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ERR3P42222 437 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W IML2P47031 731 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MAD3P47074 515 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MAL13P53338 473 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ALF1P53904 254 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W VPS38Q05919 439 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MCH5Q08777 521 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ATG11Q12527 1178 aa5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SOD2P00447 233 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RPO26P20435 155 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SEC15P22224 910 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ERG6P25087 383 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SAC6P32599 642 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TAF1P46677 1066 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ENB1Q08299 606 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W AFT2Q08957 416 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TAH18Q12181 623 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W POM34Q12445 299 aa5.87□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CWH43P25618 953 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PRE4P30657 266 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YEL043WP32618 956 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SHM2P37291 469 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W AIM3P38266 947 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.86□□□□□ -1.47not detected
VHS1YDR247W CCT3P39077 534 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W GET2P40056 285 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PRM2P40534 656 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W IMA5P40884 581 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RIM8P53179 542 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PEF1P53238 335 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CIA1Q05583 330 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ATG23Q06671 453 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W DIN7Q12086 430 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ATG9Q12142 997 aa5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W HMG2P12684 1045 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MTC7P32633 139 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TSA1P34760 196 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MUD2P36084 527 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YLF2P38746 405 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PPE1P38796 400 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SAP1P39955 897 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W CUE3P53137 624 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YNR071CP53757 342 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W BOP3P53958 396 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W GTR1Q00582 310 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TRS130Q03660 1102 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TRI1Q05024 226 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W HOS1Q12214 470 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RRI2Q12348 645 aa5.85□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W VPS1P21576 704 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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