RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MsmbO08540 113 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Khdc1aQ3UWR2 166 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rchy1Q9CR50 261 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-9A0A0A6YW37 117 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psmb11Q8BG41 302 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9961Q8BNV2 113 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SstP60041 116 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9CX63 252 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A1Y7VMQ4 148 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21994F6T2D2 329 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28305F6U473 122 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q24JP4 165 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cox7a2lQ61387 111 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fmc1Q9CR13 113 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAB9 146 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11027G8JL69 66 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AY761185Q5ERI8 94 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav2Q5R1I9 109 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav6-6A0A075B603 114 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28038F7BCN9 126 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbfox3Q8BIF2 374 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9913Q8BQQ2 135 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RhohQ9D3G9 191 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PdfS4R2K0 231 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfyve26Q5DU37 2529 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TroQ6DIC6 2087 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zcwpw2Q08EN7 125 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr311Q5NC59 308 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SelenokQ9JLJ1 94 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc4Q8JZM8 3443 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc2Q80Z19 2680 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem262D3Z338 116 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb1b3J3QJY4 93 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01739 132 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1437Q7TQR7 312 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Obox1Q9D350 204 aa10.3□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl21aP84444 133 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl21bP86792 133 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl21cP86793 133 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nit2Q9JHW2 276 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tep1P97499 2629 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cited2O35740 269 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01801 115 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrcol1Q3URS3 161 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12888Q3UW77 119 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf580Q9DB38 172 aa10.29□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01727 129 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6040Q4QY32 63 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb1b19F6WYW0 93 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map1lc3aQ91VR7 121 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa10.28□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10553J3QPF1 123 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01750 117 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bri3P28662 125 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm94Q3V2D2 93 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyyr1Q8VIH7 165 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cend1Q9JKC6 149 aa10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Celsr2Q9R0M0 2920 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mien1Q9CQ86 115 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tomm6Q9CQN3 74 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAA3 117 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm26938S4R185 226 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav14-2A0A075B694 121 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TshbP12656 138 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cacng7P62956 275 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bahcc1Q3UHR0 2643 aa10.27□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pmis2Q497Q9 96 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr312Q7TRZ9 308 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpx7Q99LJ6 186 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klk10Q99M20 278 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dkk2Q9QYZ8 259 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgap32Q811P8 2089 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr317Q5NCD6 327 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klhdc1Q80YG3 406 aa10.26□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930447F04RikA2AFR2 126 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf114Q9ET26 229 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rabac1Q9Z0S9 185 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv8-8A0A0A6YXQ0 119 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3UNZ8 350 aa10.25□□□□□ -0.77
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trappc1Q5NCF2 145 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.5 ms